/var/www/html/cpndb/fasta_results/b9495.fasta# /data/www/cpndb/fasta35 -E 200 -Q -m 6 -b 20 -d 20 -z 2 -H /data/www/cpndb/fasta_results/b9495 /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 35.03 Feb. 18, 2008
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b9495
  1>>>b9495 564 nt - 564 nt
Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences

10433008 residues in 18820 sequences
Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0040;  K=1.1e-05 (cen=941)
Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized]
Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6
 join: 52, opt: 37, open/ext: -12/-4, width:  16
 Scan time:  2.480



The best scores are:                                      opt bits E(18820)
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b7439 AAGC01000059 Wolbachia sp.               ( 564) [f] 2811 32.8     0.8 align
b13531 NC_012416 Wolbachia sp. wRi             ( 564) [f] 2811 32.8     0.8 align
b7440 AAGB01000050 Wolbachia sp.               ( 564) [f] 2811 32.8     0.8 align
b26243 NC_021089 Wolbachia sp. endosymbiont of ( 564) [f] 2793 32.7    0.86 align
b31120 NZ_NWVI01000051 Wolbachia  pipientis    ( 561) [f] 2697 32.1     1.3 align
b7515 AJ609660 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2244 29.5     7.8 align
b7453 AJ628412 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2217 29.3     8.7 align
b7454 AJ628411 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2208 29.3       9 align
b20425 NZ_CAGB01000016 Wolbachia pipientis wAl ( 561) [f] 2196 29.2     9.5 align
b7516 AJ609659 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2185 29.1     9.9 align
b7518 AJ609657 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2181 29.1      10 align
b31121 NZ_NWVI01000050 Wolbachia  pipientis    ( 558) [f] 2181 29.1      10 align
b402 AB002286 Wolbachia sp. group B            ( 561) [f] 2178 29.1      10 align
b26246 NC_021084 Wolbachia sp. endosymbiont of ( 561) [f] 2169 29.1      11 align
b7437 NC_006833 Wolbachia sp. TRS endosymbiont ( 564) [f] 2149 28.9      11 align
b7521 AJ609654 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2149 28.9      11 align
b7520 AJ609655 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2122 28.8      13 align
b7523 AJ609652 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2095 28.6      14 align
b4814 AJ558023 Wolbachia pipientis             ( 564) [f] 2082 28.6      15 align


>>>b9495, 564 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library

>>b5007 NC_002978 Wolbachia sp. wMel                      (564 nt)
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banded Smith-Waterman score: 2820; 100.0% identity (100.0% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b5007 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b5007 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 550 560


>>b7439 AAGC01000059 Wolbachia sp.                        (564 nt)
 initn: 2811 init1: 2811 opt: 2811  Z-score: 123.9  bits: 32.8 E():  0.8
banded Smith-Waterman score: 2811; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 ATTATTCAACCTTTACTTCCTGTTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7439 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b7439 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 550 560


>>b13531 NC_012416 Wolbachia sp. wRi                      (564 nt)
 initn: 2811 init1: 2811 opt: 2811  Z-score: 123.9  bits: 32.8 E():  0.8
banded Smith-Waterman score: 2811; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 ATTATTCAACCTTTACTTCCTGTTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b13531 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b13531 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 550 560


>>b7440 AAGB01000050 Wolbachia sp.                        (564 nt)
 initn: 2811 init1: 2811 opt: 2811  Z-score: 123.9  bits: 32.8 E():  0.8
banded Smith-Waterman score: 2811; 99.8% identity (99.8% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 ATTATTCAACCTTTACTTCCTGTTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7440 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b7440 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 550 560


>>b26243 NC_021089 Wolbachia sp. endosymbiont of Drosoph  (564 nt)
 initn: 2793 init1: 2793 opt: 2793  Z-score: 123.3  bits: 32.7 E(): 0.86
banded Smith-Waterman score: 2793; 99.5% identity (99.5% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 ACGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: b26243 ATATCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATTGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b26243 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b26243 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 550 560


>>b31120 NZ_NWVI01000051 Wolbachia  pipientis   HN2016    (561 nt)
 initn: 2697 init1: 2697 opt: 2697  Z-score: 120.3  bits: 32.1 E():  1.3
banded Smith-Waterman score: 2697; 97.9% identity (97.9% similar) in 561 nt overlap (4-564:1-561)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31120 TCAATATTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::::: b31120 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCGAAAGACGTAATATTAAAGGAAATT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :::::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::: :: :::::::: ::: b31120 ACGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATGGATGAAGTAGCGCAAGTTGCGATA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::: b31120 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATTGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: b31120 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAAAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31120 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31120 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::: b31120 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31120 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT 480 490 500 510 520 530 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::::::::::::::::::::: b31120 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA 540 550 560


>>b7515 AJ609660 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2212 init1: 2212 opt: 2244  Z-score: 106.1  bits: 29.5 E():  7.8
banded Smith-Waterman score: 2244; 88.7% identity (88.7% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b7515 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : :::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::: b7515 GATCGTGTTAGCATTAAAAACGGAATGCAGAAGGCAAAAGATGTAGTATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: :: :::::::: ::::::::: : ::::: :::: ::::: :: :::::::: :: b7515 GCATCGATGTCTCGCACAATTTCTTTGGAGAAGGTAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: :::::::::::::::: ::::: :::: :: :: :::::: : :: ::::: ::: b7515 ATTTCTGCAAATGGTGATAGAGATATTGGTAGTAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: :::::::: ::::::::::: ::::: ::::::::::: ::::: :::::: b7515 GGAAAAGAAGGTGTAATCACTGTTGAAGAAAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAGGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: :::::::: :::::::: :: ::::: :: :::::::::::: b7515 CTCACTACTGGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTTTCCCCGTACTTCATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::::::::: :::::::::::: :::: ::::: :::::::::::::::::: : ::: b7515 GAAAAAATGATTGTGGAGCTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAACTGAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :::::::: ::::: :::::::::::::::::: ::::::: ::::::: :::::: :: b7515 ATTATTCAGCCTTTGCTTCCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAGACCTTTACTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::: :::::::: ::: ::::: b7515 ATTATTGCAGAGGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTGGTTATCAACAAACTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: ::::::: ::::: ::: b7515 GGTGGTCTAAAAGTCGCTGCGGTA 550 560


>>b7453 AJ628412 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2206 init1: 2206 opt: 2217  Z-score: 105.2  bits: 29.3 E():  8.7
banded Smith-Waterman score: 2217; 88.1% identity (88.1% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: b7453 TGCTCAATACTAACTAGTAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCAGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : :::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::: b7453 GATCGTGTTAGCATTAAAAACGGAATGCAGAAGGCAAAAGATGTAGTATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: :: :::::::: ::::::::: : :: :: :::: ::::: :: :::::::: :: b7453 GCATCGATGTCTCGCACAATTTCTTTGGAAAAGGTAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :::::::::::::::::::: ::::: :::: :: :: :::::: :::: :::: ::: b7453 ATCTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGTAGTAGCATTGCTGATGCCGTTAAAAGGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: ::::::::::: ::::: ::::::::::: :::::::::::: b7453 GGAAAAGAAGGTGTGATCACTGTTGAAGAAAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: :::::::: :::::::: :::::::: ::::::::::::::: b7453 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTTTCTCCGTACTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::::::::: :: ::::::::: :::: ::::: :::::::::::::::::: : ::: b7453 GAAAAAATGATTGTAGAGCTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAACTGAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::: : :::::: ::::: :::::::::::::: : ::::: ::::::: ::: :: :: b7453 ATTGTCCAACCTCTACTTTCTATTCTTGAAGCTGTCGTTAAGTCTGGTAGACCCTTACTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: :::::::: :: ::::: b7453 ATTATTGCAGAGGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTGGTTATCAACAAGCTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: ::::::::::::: ::: b7453 GGTGGTCTAAAAGTTGCTGCGGTA 550 560


>>b7454 AJ628411 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2208 init1: 2208 opt: 2208  Z-score: 105.0  bits: 29.3 E():    9
banded Smith-Waterman score: 2208; 87.9% identity (87.9% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: b7454 TGCTCAATACTGACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAGTCAATTGCTGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : :::::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::: b7454 GATCGTGTTAGCATTAAAAACGGAATGCAGAAGGCAAAAGATGTAGTATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: :: :::::::: ::::::::: : ::::: :::: ::::: :: :::::::: :: b7454 GCATCGATGTCTCGCACAATTTCTTTGGAGAAGGTAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: :::::::::::::::: ::::: :::: ::::: :::::: : :: ::::: :: b7454 ATTTCTGCAAATGGTGATAGAGATATTGGTAGTAGTATTGCTGATGCTGTTAAAAAGGTA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: ::::::::::: ::::: :::::::::::::: ::::::::: b7454 GGAAAAGAAGGTGTGATCACTGTTGAAGAAAGTAAGGGTTCAAAAGAGTTGGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: ::::::::::::::::: :: :: :: :::::::: :::::: b7454 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGATCGCGGTTATCTTTCCCCATACTTTATTACGAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::::::::: :::::::::::: :: : ::::: :::::::::::::::::: : :: b7454 GAAAAAATGATTGTGGAGCTTGATGATACATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAACTGAAC 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :::::: :::::::: ::::::::::: ::::::: ::::::: :::::: :: b7454 ATTATCCAACCTCTACTTCCTGTTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAGACCTTTACTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::: :::::::: ::: ::::: b7454 ATTATTGCAGAGGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTGGTTATCAACAAACTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: ::::::: ::::::::: b7454 GGTGGTCTAAAAGTCGCTGCAGTA 550 560


>>b20425 NZ_CAGB01000016 Wolbachia pipientis wAlbB        (561 nt)
 initn: 2204 init1: 2139 opt: 2196  Z-score: 104.6  bits: 29.2 E():  9.5
banded Smith-Waterman score: 2196; 87.9% identity (87.9% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-561)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::: :::::::: :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: b20425 TGCTCAATACTGACTAGCAATATGATAATGGAAGCTTCAAAGTCAATTGCAGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::: :: :::: ::::: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b20425 GATCGTATTTGTATCAAAAATGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTGATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : ::::::::::: ::::::::: :::::::::: :: ::::: ::::::::::::::: b20425 ACATCAATGTCTCGCACAATTTCTTTAGAGAAAATGGATGAAGTTGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::::::: b20425 ATTTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: :: :: :: ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: b20425 GGAAAAGAAGGCGTCATCACTGTTGAAGAGAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :: ::::: ::::: ::::: :: :::::::::::::: :: ::: ::::::::::: b20425 CTTACAACTGGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATCTCTCTCCATACTTTGTTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::: :::: ::::::::::::: :::: ::: : : :::::::: :::::: : ::: b20425 GAAAAGATGAGCGTGGAGCTTGATGATCCATATTTGCTGATTACAGAAAAAAAACTTAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::::: :::::: :: b20425 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTTTTAAGTCTGGTAAGCCTTTGTTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: :::::::: ::: : :::::::::::::::::::::::::: ::::: ::::: : b20425 ATCATTGCAGAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTGATCAACAAATTAC-- 490 500 510 520 530 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA ::::: ::::::::::::::::: b20425 -GTGGTCTAAAAGTTGCTGCAGTA 540 550 560


>>b7516 AJ609659 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2185 init1: 2185 opt: 2185  Z-score: 104.2  bits: 29.1 E():  9.9
banded Smith-Waterman score: 2185; 87.6% identity (87.6% similar) in 563 nt overlap (1-563:1-563)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::::::::: ::::::::: :::: :::::::::::::::::::: :::::: b7516 TGCTCAATACTAACTAGTAACATGATATTGGAGGCTTCAAAATCAATTGCTGCCGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::: :::::::::::::: b7516 GATCGTGTTGGTATCAAAAACGGAATGCAGAAGGCAAAAGATGTAGTATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: :: ::::: :: ::::::::: : ::::::::::: ::::: :: :::::::: :: b7516 GCATCGATGTCCCGCACAATTTCTTTGGAGAAAATAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::: ::::: :: : :: :: :::::: :::: ::::: ::: b7516 ATTTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGCAGTAGCATTGCTGATGCCGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: ::::::::::: ::::: :: :::::::: :: ::::::::: b7516 GGAAAAGAAGGTGTGATCACTGTTGAAGAAAGTAAGGGCTCAAAAGAATTGGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: ::::: :: ::::: ::::: :: :: ::::: :::::::: ::::::::::: ::: b7516 CTTACTACCGGTATGCAGTTTGACCGTGGCTATCTTTCTCCGTACTTTATTACAAACAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::::::::: :::::::::::: :::: ::: : :::::::: :: :::::: : ::: b7516 GAAAAAATGATTGTGGAGCTTGATGATCCATATATCTTAATTACCGAAAAAAAACTTAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :: ::: :::::::: ::::::::::: ::::::: ::::::: :::::: : b7516 ATTATCCAGCCTCTACTTCCTGTTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAGACCTTTACTC 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::: :::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::: ::::::::: b7516 ATTATTGCGGAGGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTAGTTATCAACAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA ::::::::::::::::::::::: b7516 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTC 550 560


>>b7518 AJ609657 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2149 init1: 2149 opt: 2181  Z-score: 104.1  bits: 29.1 E():   10
banded Smith-Waterman score: 2181; 87.4% identity (87.4% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::: :::::: ::::: b7518 TGCTCAATACTAACTAGTAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAACTGCTGCCGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::: ::: b7518 GATCGTGTTAGCATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAGTATTAAAGGAGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: : :::::::: ::::::::: : :: :: :::: ::::: :: :::::::: :: b7518 GCATTGATGTCTCGCACAATTTCTTTGGAAAAGGTAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT ::::::::::::::::::: ::::: :::: :: :: :::::: : :: ::::: ::: b7518 ATCTCTGCAAATGGTGATAGAGATATTGGTAGTAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: :::::::: :: ::::: ::::::::::: :::::::::::: b7518 GGAAAAGAAGGTGTGATCACTGTTGAGGAAAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: :::::::: :::::::: :::::::: :: ::::::::: :: b7518 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTTTCTCCGTACTTCATTACAAATGAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::::::::: :::::::::::: :::: ::::: :::::::::::::::::: : ::: b7518 GAAAAAATGATTGTGGAGCTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAACTGAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::: :::::::: ::::: :: ::::::::::: ::::::: ::::::::::: :: :: b7518 ATTGTTCAACCTCTACTTTCTGTTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAAACCCTTACTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::::::::: :::::::: :::::::::::::: :::::::: ::: ::::: b7518 ATTATTGCAGAGGATATTGAAGGTGAGGCATTAAGCACTTTGGTTATCAACAAACTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: ::::::: ::::: ::: b7518 GGTGGTCTAAAAGTCGCTGCGGTA 550 560


>>b31121 NZ_NWVI01000050 Wolbachia  pipientis   HN2016    (558 nt)
 initn: 2189 init1: 2124 opt: 2181  Z-score: 104.2  bits: 29.1 E():   10
banded Smith-Waterman score: 2181; 87.9% identity (87.9% similar) in 561 nt overlap (4-564:1-558)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :::::::: :::::::: :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: b31121 TCAATACTGACTAGCAATATGATAATGGAAGCTTCAAAGTCAATTGCAGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::: :: :::: ::::: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b31121 GATCGTATTTGTATCAAAAATGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTGATATTAAAGGAAATT 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : ::::::::::: ::::::::: :::::::::: :: ::::: ::::::::::::::: b31121 ACATCAATGTCTCGCACAATTTCTTTAGAGAAAATGGATGAAGTTGCACAAGTTGCAATA 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::::::: b31121 ATTTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAAGTT 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: :: :: :: ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: b31121 GGAAAAGAAGGCGTCATCACTGTTGAAGAGAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAA 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :: ::::: ::::: ::::: :: :::::::::::::: :: ::: ::::::::::: b31121 CTTACAACTGGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATCTCTCTCCATACTTTGTTACAAATAAT 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::: :::: ::::::::::::: :::: ::: : : :::::::: :::::: : ::: b31121 GAAAAGATGAGCGTGGAGCTTGATGATCCATATTTGCTGATTACAGAAAAAAAACTTAAT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::: :::::::: :::::: :: b31121 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTTTTAAGTCTGGTAAGCCTTTGTTT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: :::::::: ::: : :::::::::::::::::::::::::: ::::: ::::: : b31121 ATCATTGCAGAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTGATCAACAAATTAC-- 480 490 500 510 520 530 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA ::::: ::::::::::::::::: b31121 -GTGGTCTAAAAGTTGCTGCAGTA 540 550


>>b402 AB002286 Wolbachia sp. group B                     (561 nt)
 initn: 2186 init1: 2121 opt: 2178  Z-score: 104.1  bits: 29.1 E():   10
banded Smith-Waterman score: 2178; 87.6% identity (87.6% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-561)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::: :::::::: :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: b402 TGCTCAATACTGACTAGCAATATGATAATGGAAGCTTCAAAGTCAATTGCAGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::: :: :::: ::::: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::: ::: b402 GATCGTATTTGTATCAAAAATGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTGATATTAAAGGAGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : ::::::::::: ::::::::: :::::::::: :: ::::: ::::::::::::::: b402 ACATCAATGTCTCGCACAATTTCTTTAGAGAAAATGGATGAAGTTGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::: ::: b402 ATTTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: :: :: :: ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: b402 GGAAAAGAAGGCGTCATCACTGTTGAAGAGAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :: ::::: ::::: ::::: :: :::::::::::::: :: ::: ::::::::::: b402 CTTACAACTGGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATCTCTCTCCATACTTTGTTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::: :::: ::::::::::::: :::: ::: : : :::::::: :::::: : ::: b402 GAAAAGATGAGCGTGGAGCTTGATGATCCATATTTGCTGATTACAGAAAAAAAACTTAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :::: ::::::::::::::: :: b402 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAGGCTATTTTTAAGTCTGGTAAACCTTTGTTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: :::::::: ::: : :::::::::::::::::::::::::: ::::: ::::: : b402 ATCATTGCAGAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTGATCAACAAATTAC-- 490 500 510 520 530 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA ::::: ::::::::::::::::: b402 -GTGGTCTAAAAGTTGCTGCAGTA 540 550 560


>>b26246 NC_021084 Wolbachia sp. endosymbiont of Drosoph  (561 nt)
 initn: 2177 init1: 2112 opt: 2169  Z-score: 103.8  bits: 29.1 E():   11
banded Smith-Waterman score: 2169; 87.4% identity (87.4% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-561)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::: :::::::: :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: b26246 TGCTCAATACTGACTAGCAATATGATAATGGAAGCTTCAAAGTCAATTGCAGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::: :: :::: ::::: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b26246 GATCGTATTTGTATCAAAAATGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTGATATTAAAGGAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : ::::::::::: ::::::::: :::::::::: :: ::::: ::::::::::::::: b26246 ACATCAATGTCTCGCACAATTTCTTTAGAGAAAATGGATGAAGTTGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :: ::::: : :: ::::: ::: b26246 ATTTCTGCAAATGGTGATAAAGATATTGGTAATAGCATTGCTGACGCTGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: :: :: :: :: :::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: b26246 GGAAAAGAAGGCGTCATCACCGTTGAAGAGAGTAAGGGTTCAAAAGAATTAGAAGTTGAA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :: ::::: ::::: ::::: :: :::::::::::::: :: ::: ::::::::::: b26246 CTTACAACTGGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATCTCTCTCCATACTTTGTTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT ::::: :::: ::: ::::::::: :::: ::: : : :::::::: :::::: : ::: b26246 GAAAAGATGAGCGTTGAGCTTGATGATCCATATTTGCTGATTACAGAAAAAAAACTTAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::::::::::::::::::::::::::: :::::: :::: ::::::::::::::: :: b26246 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAGGCTATTTTTAAGTCTGGTAAACCTTTGTTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: :::::::: ::: : :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: : b26246 ATCATTGCAGAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTGATCAATAAATTAC-- 490 500 510 520 530 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA ::::: ::::::::::::::::: b26246 -GTGGTCTAAAAGTTGCTGCAGTA 540 550 560


>>b7437 NC_006833 Wolbachia sp. TRS endosymbiont of Brug  (564 nt)
 initn: 2143 init1: 2143 opt: 2149  Z-score: 103.1  bits: 28.9 E():   11
banded Smith-Waterman score: 2149; 86.9% identity (86.9% similar) in 563 nt overlap (1-563:1-563)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :: :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::: ::::::::: b7437 TGTTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTTAAAGTCAATTGCCGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : :: :::::::: :: :: ::::::::::::: : ::::: : : ::: b7437 GATCGTGTTAGCATCAAAAACGGGATGCAAAAGGCAAAAGATGCAGTATTAGAAGGGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : :::::::: :: :::::: :: : :: ::::: :: ::::: ::::::::::::::: b7437 ACATCAATGTCCCGCACAATTCCTTTGGAAAAAATGGATGAAGTAGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::::::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::::::: b7437 ATTTCTGCAAATGGTGATAAGGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: :: :::::::: ::::: :: ::::::::::::::::::::: b7437 GGAAAAGAAGGTGTGATTACCGTTGAAGAAAGTAAGGGCTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::::::::::::::::::::: ::::: :: ::::: :::: :::: b7437 CTTACTACTGGTATGCAATTTGATCGCGGTTATCTTTCTCCATACTTTATCACAAGTAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :: :::::::: :: :: ::::: :::: ::::: :::::::::::::::::::: : : b7437 GAGAAAATGATTGTAGAATTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAATTGAGT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :: :: :: :::::::::::::::::: ::::::: :::::::::::::: :: b7437 ATTATACAGCCATTGCTTCCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAAACCTTTACTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::: ::::: ::::::::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::: b7437 ATTATTGCAGAAGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTGGTTATCAACAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: :::::::: ::::::: b7437 GGTGGTCTAAAAGTTACTGCAGTG 550 560


>>b7521 AJ609654 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2143 init1: 2143 opt: 2149  Z-score: 103.1  bits: 28.9 E():   11
banded Smith-Waterman score: 2149; 86.9% identity (86.9% similar) in 563 nt overlap (1-563:1-563)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :: :::::::::::::::::::::::::::::::::: ::: :::::::: ::::::::: b7521 TGTTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTTAAAGTCAATTGCCGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::: : :: :::::::: :: :: ::::::::::::: : ::::: : : ::: b7521 GATCGTGTTAGCATCAAAAACGGGATGCAAAAGGCAAAAGATGCAGTATTAGAAGGGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : :::::::: :: :::::: :: : :: ::::: :: ::::: ::::::::::::::: b7521 ACATCAATGTCCCGCACAATTCCTTTGGAAAAAATGGATGAAGTAGCACAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::::::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::::::: b7521 ATTTCTGCAAATGGTGATAAGGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: :: :::::::: ::::: :: ::::::::::::::::::::: b7521 GGAAAAGAAGGTGTGATTACCGTTGAAGAAAGTAAGGGCTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::::::::::::::::::::: ::::: :: ::::: :::: :::: b7521 CTTACTACTGGTATGCAATTTGATCGCGGTTATCTTTCTCCATACTTTATCACAAGTAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :: :::::::: :: :: ::::: :::: ::::: :::::::::::::::::::: : : b7521 GAGAAAATGATTGTAGAATTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAATTGAGT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :: :: :: :::::::::::::::::: ::::::: ::::::::::::::: :: b7521 ATTATACAGCCATTGCTTCCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAAACCTTTGCTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT ::::::::::: ::::: ::::::::::: ::::: ::::: :::::::: ::::::::: b7521 ATTATTGCAGAAGATATTGAAGGTGAAGCGTTAAGTACTTTGGTTATCAACAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: :::::::: ::::::: b7521 GGTGGTCTAAAAGTTACTGCAGTG 550 560


>>b7520 AJ609655 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2122 init1: 2122 opt: 2122  Z-score: 102.3  bits: 28.8 E():   13
banded Smith-Waterman score: 2122; 86.3% identity (86.3% similar) in 563 nt overlap (1-563:1-563)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::::::::::: :::::: ::::::: :::: ::: ::::::::::::::::: b7520 TGCTCAATACTAACTAGTAACATGGTAATGGAGGCTTTAAAGTCAATTGCTGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT ::::::::::: ::::::::::: :: :: ::::::::::::: : ::::: : : :::: b7520 GATCGTGTTGGCATTAAAAACGGGATGCAAAAGGCAAAAGATGCAGTATTAGAAGGAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA : ::::::::::: :::::: :: : :: ::::: :: ::::: :: :::::::::::: b7520 ACATCAATGTCTCGCACAATTCCTTTGGAAAAAATGGATGAAGTAGCGCAAGTTGCAATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::::::::::::::::::::: ::::: :: :: :::::: : :: ::::::::: b7520 ATTTCTGCAAATGGTGATAAGGATATTGGTAATAGCATTGCTGATGCTGTTAAAAAAGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :: ::::: ::::: :: ::::::::::: ::::: :: ::::::::::::::::::::: b7520 GGGAAAGAAGGTGTGATTACTGTTGAAGAAAGTAAGGGCTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: ::::::::::::::::: ::::: :: ::::: :::: :::: b7520 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGATCGCGGTTATCTTTCTCCATACTTTATCACAAGTAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :: :::::::: :: :: ::::: :::: ::::: ::: :::::::::::::::: : b7520 GAGAAAATGATTGTAGAATTTGATGATCCATATCTCTTAGTTACAGAGAAAAAATTGAGC 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :: :: :: :::::::::::::::::: ::::::: ::::::: ::::::: :: b7520 ATTATACAGCCATTGCTTCCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAGACCTTTGCTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :::::::::: ::::: ::::::::::::::::: ::::: :::::::::::::::::: b7520 GTTATTGCAGAAGATATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTGGTTATCAATAAATTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: : :: ::::::::::: b7520 GGTGGTCTGAAGGTTGCTGCAGTG 550 560


>>b7523 AJ609652 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
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banded Smith-Waterman score: 2095; 85.8% identity (85.8% similar) in 563 nt overlap (1-563:1-563)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC :: :::::::::::::: :::::: :::: :::::::: ::::::::::::::::: b7523 TGTTCAATACTAACTAGTGGTATGATAGTGGAGGCTTCAAAGTCAATTGCTGCTGGAAAT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::: : :::: :: :: ::::: ::::: :::::::::::: ::::::: ::: :: b7523 GATCGTATCAGTATCAAGAATGGAATGCAGAAAGCAAAAGATGTAGTATTAAAAGAAGTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: :::::: :::::::::::::: : :: :: ::::: ::::: :: :::::::: ::: b7523 GCTTCAATGGCTCGTACAATTTCTTTGGAAAAGATAGATGAAGTAGCGCAAGTTGCTATA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: ::::: :: ::::::: ::: :::: : ::: :::::: : :: ::::: ::: b7523 ATTTCTGCGAACGGTGATAGAAGTATTGGTAGTAATATTGCTGATGCTGTTAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :::::::: ::::: :: ::::::::::: ::::::::::::::::: :::: :::::: b7523 GGAAAAGAAGGTGTGATTACTGTTGAAGAAAGTAAAGGTTCAAAAGAACTAGAGGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: :::::::: :: ::::: :::::::::::::::::::::::: b7523 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGATCGTGGCTATCTTTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :: ::::::::::::::::::::: :::: ::::: :::::::::::::::::: : ::: b7523 GAGAAAATGATCGTGGAGCTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAGAAAAAACTTAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT ::::: :: ::::: ::: :::::::::::::: ::::::: ::::::::::::::: :: b7523 ATTATCCAGCCTTTGCTTTCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAAACCTTTGCTT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: :::::::: :: :: ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::: :::::: b7523 ATCATTGCAGAAGACATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTAGTTATTAATAAGTTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: :::::::::::::::: b7523 GGTGGTCTAAAAGTTGCTGCAGTG 550 560


>>b4814 AJ558023 Wolbachia pipientis                      (564 nt)
 initn: 2082 init1: 2082 opt: 2082  Z-score: 101.0  bits: 28.6 E():   15
banded Smith-Waterman score: 2082; 85.5% identity (85.5% similar) in 564 nt overlap (1-564:1-564)

10 20 30 40 50 60 b9495 TGCTCAATACTAACTAGCAACATGATAATGGAAGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC ::::::::: ::::::: : :::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::: b4814 TGCTCAATATTAACTAGTAGCATGATAATGGAGGCTTCAAAATCAATTGCTGCTGGAAAC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b9495 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATACAGAAGGCAAAAGATGTAATATTAAAGGAAATT :::::::::::::::::::::::::: :: :::::::: :::::: ::::::::::: :: b4814 GATCGTGTTGGTATTAAAAACGGAATGCAAAAGGCAAAGGATGTAGTATTAAAGGAAGTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b9495 GCGTCAATGTCTCGTACAATTTCTCTAGAGAAAATAGACGAAGTGGCACAAGTTGCAATA :: ::::::::::: ::::::::: :::: :::::::: :: :: :: :::::::: :: b4814 GCATCAATGTCTCGCACAATTTCTTTAGAAAAAATAGATGAGGTAGCTCAAGTTGCTATC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b9495 ATCTCTGCAAATGGTGATAAGGATATAGGTAACAGTATCGCTGATTCCGTGAAAAAAGTT :: :::::::::::::::: : :: :::: : ::: :::::: : :: ::::: ::: b4814 ATTTCTGCAAATGGTGATAGGAGCATTGGTAGTAATATTGCTGATGCTGTCAAAAAGGTT 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b9495 GGAAAAGAGGGTGTAATAACTGTTGAAGAGAGTAAAGGTTCAAAAGAGTTAGAAGTTGAG :: ::::: ::::: :: ::::::::::: :::::::: :::::::: :::: :::::: b4814 GGCAAAGAAGGTGTGATTACTGTTGAAGAAAGTAAAGGCTCAAAAGAACTAGAGGTTGAG 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b9495 CTGACTACTGGCATGCAATTTGATCGCGGTTATCTCTCTCCGTATTTTATTACAAATAAT :: :::::::: ::::: ::::: :: :: ::::: ::::: :: ::::::::::: ::: b4814 CTTACTACTGGTATGCAGTTTGACCGTGGCTATCTTTCTCCATACTTTATTACAAACAAT 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b9495 GAAAAAATGATCGTGGAGCTTGATAATCCTTATCTATTAATTACAGAGAAAAAATTAAAT :: :::::::: :::::::::::: :::: ::::: ::::::::::: :::::: : ::: b4814 GAGAAAATGATAGTGGAGCTTGATGATCCATATCTCTTAATTACAGAAAAAAAACTCAAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b9495 ATTATTCAACCTTTACTTCCTATTCTTGAAGCTATTGTTAAATCTGGTAAACCTTTGGTT :: :: :: ::::: ::: :::::::::::::: ::::::: ::::::::::::::: : b4814 ATCATACAGCCTTTGCTTTCTATTCTTGAAGCTGTTGTTAAGTCTGGTAAACCTTTGCTC 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b9495 ATTATTGCAGAGGATATCGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTTATCAATAAATTGCGT :: ::::: :: :: :: ::::::::::::::::: ::: :::: :: ::::: :::::: b4814 ATCATTGCGGAAGACATTGAAGGTGAAGCATTAAGTACTCTAGTCATTAATAAGTTGCGT 490 500 510 520 530 540 550 560 b9495 GGTGGTTTAAAAGTTGCTGCAGTA :::::: ::::::: :: :::::: b4814 GGTGGTCTAAAAGTCGCCGCAGTA 550 560




564 residues in 1 query   sequences
10433008 residues in 18820 library sequences
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]