/data/www/cpndb/fasta_results/b20460.fasta# /data/www/cpndb/fasta35 -E 200 -Q -m 6 -b 20 -d 20 -z 2 -H /data/www/cpndb/fasta_results/b20460 /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut
<pre>
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 35.03 Feb. 18, 2008
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

</pre>
Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b20460
<pre>
  1>>>b20460 555 nt - 555 nt
Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences

10433008 residues in 18820 sequences
Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0024;  K=9.654e-06 (cen=941)
Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized]
Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6
 join: 51, opt: 36, open/ext: -12/-4, width:  16
 Scan time:  1.330
</pre>
<p>
<hr>
<p>
<p><pre>

The best scores are:                                      opt bits E(18820)
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29843',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29843" target=_"blank">b29843</a> NZ_NASO01000009 Gilliamella sp. A-TSA1  ( 555) [f] 1830 22.9 7.1e+02 <A HREF="#b29843">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32596',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32596" target=_"blank">b32596</a> NZ_NASR01000003 Gilliamella  apis  A-TS ( 555) [f] 1830 22.9 7.1e+02 <A HREF="#b32596">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4995',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4995" target=_"blank">b4995</a> NC_005061 Candidatus Blochmannia florida ( 555) [f] 1825 22.9 7.2e+02 <A HREF="#b4995">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24363',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24363" target=_"blank">b24363</a> JQ269400 Buchnera aphidicola isolate Al ( 555) [f] 1776 22.7 8.1e+02 <A HREF="#b24363">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24350',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24350" target=_"blank">b24350</a> JQ269416 Buchnera aphidicola isolate Er ( 555) [f] 1767 22.7 8.2e+02 <A HREF="#b24350">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24331',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24331" target=_"blank">b24331</a> JQ269442 Buchnera aphidicola isolate 56 ( 555) [f] 1767 22.7 8.2e+02 <A HREF="#b24331">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24365',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24365" target=_"blank">b24365</a> JQ269397 Buchnera aphidicola isolate Ch ( 555) [f] 1762 22.7 8.3e+02 <A HREF="#b24365">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32849',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32849" target=_"blank">b32849</a>  NZ_QGLN01000009 Gilliamella  apis  ESL ( 555) [f] 1749 22.6 8.6e+02 <A HREF="#b32849">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24362',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24362" target=_"blank">b24362</a> JQ269401 Buchnera aphidicola isolate Pg ( 555) [f] 1749 22.6 8.6e+02 <A HREF="#b24362">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24334',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24334" target=_"blank">b24334</a> JQ269438 Buchnera aphidicola isolate Ms ( 555) [f] 1744 22.6 8.7e+02 <A HREF="#b24334">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24345',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24345" target=_"blank">b24345</a> JQ269421 Buchnera aphidicola isolate Ms ( 555) [f] 1744 22.6 8.7e+02 <A HREF="#b24345">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24354',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24354" target=_"blank">b24354</a> JQ269410 Buchnera aphidicola isolate 3  ( 555) [f] 1740 22.6 8.8e+02 <A HREF="#b24354">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b7717',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b7717" target=_"blank">b7717</a> NC_007292 Candidatus Blochmannia pennsyl ( 555) [f] 1735 22.6 8.9e+02 <A HREF="#b7717">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32937',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32937" target=_"blank">b32937</a> NZ_QICT01000003 Gilliamella  apicola  D ( 555) [f] 1731 22.6   9e+02 <A HREF="#b32937">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b22784',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b22784" target=_"blank">b22784</a> NC_020075 Candidatus Blochmannia chroma ( 555) [f] 1726 22.6 9.1e+02 <A HREF="#b22784">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24336',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24336" target=_"blank">b24336</a> JQ269436 Buchnera aphidicola isolate 20 ( 555) [f] 1726 22.6 9.1e+02 <A HREF="#b24336">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29271',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29271" target=_"blank">b29271</a> LKAS01000002 Bacterium endosymbiont PRU ( 555) [f] 1726 22.6 9.1e+02 <A HREF="#b29271">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b33203',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b33203" target=_"blank">b33203</a> NZ_QGTI01000005  Frischella perrara DSM ( 555) [f] 1717 22.5 9.3e+02 <A HREF="#b33203">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29347',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29347" target=_"blank">b29347</a> NAHW01000012 Gilliamella apicola N-9-4  ( 555) [f] 1713 22.5 9.3e+02 <A HREF="#b29347">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b9501',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b9501" target=_"blank">b9501</a> AB231904 Candidatus Ishikawaella capsula ( 555) [f] 1713 22.5 9.3e+02 <A HREF="#b9501">align</A>
</pre><p><hr><p>

>>>b20460, 555 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library

<A name=b29843>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29843',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29843" target=_"blank">b29843</a> NZ_NASO01000009 Gilliamella sp. A-TSA1           (555 nt)
 initn: 1754 init1: 1754 opt: 1830  Z-score: 70.9  bits: 22.9 E(): 7.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1830; 81.1% identity (81.1% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::::: ::::: ::: ::::::: ::::::::: : ::::: :::::::: :: :::
b29843 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :: :::::::: :: ::: :::: :: ::::: ::: : 
b29843 AATCCAATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTTGTTGCAGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
b29843 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGATTCTAAAGCGATTGCCCAAGTTGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :: ::::::::::: :::::: : ::::: ::  : :: :::   :::::::: :::
b29843 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAGAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b29843 GAAGGTGTTATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::::::::: ::: : ::::: :::::  : :::: : ::::: : :  
b29843 GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACCGCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        ::::::::::::::: ::: : ::::::::::   ::::::::: : :: :::::  : 
b29843 ACTGTTGAATTAGATAGTCCGTATATTTTATTAGCAGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::::::::::::: :   :::: :: :: : :: ::::::
b29843 GAATTATTACCAGTATTAGAAGCAGTTGCTAAAGCAGGTAAATCTCTATTAATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: :::::: :::::::: 
b29843 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCAACATTAGTAGTTAACACTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::::: :: :::
b29843 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b32596>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32596',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32596" target=_"blank">b32596</a> NZ_NASR01000003 Gilliamella  apis  A-TSA4        (555 nt)
 initn: 1754 init1: 1754 opt: 1830  Z-score: 70.9  bits: 22.9 E(): 7.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1830; 81.1% identity (81.1% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::::: ::::: ::: ::::::: ::::::::: : ::::: :::::::: :: :::
b32596 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :: :::::::: :: ::: :::: :: ::::: ::: : 
b32596 AATCCAATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTTGTTGCAGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
b32596 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGATTCTAAAGCGATTGCCCAAGTTGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :: ::::::::::: :::::: : ::::: ::  : :: :::   :::::::: :::
b32596 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAGAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b32596 GAAGGTGTTATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::::::::: ::: : ::::: :::::  : :::: : ::::: : :  
b32596 GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACCGCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        ::::::::::::::: ::: : ::::::::::   ::::::::: : :: :::::  : 
b32596 ACTGTTGAATTAGATAGTCCGTATATTTTATTAGCAGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::::::::::::: :   :::: :: :: : :: ::::::
b32596 GAATTATTACCAGTATTAGAAGCAGTTGCTAAAGCAGGTAAATCTCTATTAATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: :::::: :::::::: 
b32596 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCAACATTAGTAGTTAACACTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::::: :: :::
b32596 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b4995>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4995',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4995" target=_"blank">b4995</a> NC_005061 Candidatus Blochmannia floridanus       (555 nt)
 initn: 1729 init1: 1729 opt: 1825  Z-score: 70.8  bits: 22.9 E(): 7.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1825; 81.0% identity (81.0% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :::::  : :: :::::::: :: ::::::::  : ::::: :: ::::: ::::::
b4995  GCAACTGTGTTGGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGATTGAAAGCTGTGGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::: ::: : :: :::::::: :: ::  : :: :: :: :::::::::
b4995  AATCCTATGGATTTGAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTAGTAGCAGCAGTAGAGGAGTTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: :::  :::::::  :::: :::: :::::::: ::::::::::::::::::
b4995  AAAAAATTGTCTGTTCCTTGTTCAGATCCAAAGGCTATTGCTCAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: ::::: :::::::: :: :::   :: :::::  : ::::::  :::::: ::::::
b4995  GCAAATTCCGATGAAACGGTAGGTAAATTGATAGCTCAAGCTATGGATAAAGTTGGAAAA
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              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :::::::: :: :: :::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::: :::
b4995  GAGGGAGTTATTACTGTAGAAGAAGGATCTGGATTGCAAGATGAGTTAGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::::::::: ::: : :: ::::::::::::::::   :::::  ::::
b4995  GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCCCCTTATTTTGTTAATAAGCCAGAAAGTGGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::: ::::::::  :::: ::::::::::::   ::::::::: : :: :: :: :: 
b4995  ACTGTGGAATTAGAACATCCATTTATTTTATTAGCGGATAAAAAAATATCTAACATCAGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :: ::: : :: :::::::::   ::::: :::::::: ::::::
b4995  GAAATGTTACCTATATTGGAATCTGTAGCTAAATCTGGAAAACCGTTACTTATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::::::::: :: ::::: :: ::::: ::::::::::: :: :: :::
b4995  GAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTGGCTACTTTGGTAGTAAACAATATGCGTGGAATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :: ::: :::: :: 
b4995  AAGGTTACTGCAGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24363>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24363',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24363" target=_"blank">b24363</a> JQ269400 Buchnera aphidicola isolate Alo1        (555 nt)
 initn: 1776 init1: 1776 opt: 1776  Z-score: 69.9  bits: 22.7 E(): 8.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1776; 80.0% identity (80.0% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : :: :::::::: :: ::::::::: : ::::: :: ::::: ::::::
b24363 GCTACTTTATTAGCACAATCTATAGTCAATGAAGGTTTAAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::: : ::::::::::::::::: :: ::::::  ::: :: :: :: :::
b24363 AATCCTATGGATCTTAAAAGAGGAATTGATAAAGCTGTTATTAGTGCTGTAGAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :: :::::   :::::::  :::::: ::::::::: : ::::::::::::::::::
b24363 AAAAATTTATCAGTTCCTTGTTCAGATTCTAAAGCTATTACTCAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: : ::::::: ::::::: : ::::: :: :: :: :::   ::::: :: :: 
b24363 GCTAATGCAGATGAAAAAGTTGGTTCTTTAATTGCTGAAGCAATGGAAAAAGTTGGTAAT
              190       200       210       220       230       240

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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: ::::: :: :: ::::::::: :::: :: :::::::: ::::: :::::  ::
b24363 GATGGTGTTATTACAGTAGAAGAAGGTACTGGTTTACAAGATGAGTTAGAAGTTGTTAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::::: :: ::::: :: ::::::::: :::::: : ::::: :::: 
b24363 GGTATGCAATTTGATCGCGGTTATCTATCTCCTTATTTTATTAATAAAGCAGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         :::::: ::::: ::::: : ::::::: :   :::::::::: :::: :::::: : 
b24363 ATTGTTGAGTTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATTTCTAATATTCGT
              370       380       390       400       410       420

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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::  : :::::: : ::::::::::::   ::::::::  : :: ::: : 
b24363 GAAATGTTACCAATATTAGAATCTGTTGCTAAATCTGGAAAACCTTTGTTAATTATTTCA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : :::::::::::::::::::: ::::: :: ::   :::: :::: ::::::
b24363 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTGAATTCTATGAGAGGAATTGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::::: :: ::::::
b24363 AAAGTAGCAGCTGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24350>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24350',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24350" target=_"blank">b24350</a> JQ269416 Buchnera aphidicola isolate Eri1        (555 nt)
 initn: 1702 init1: 1702 opt: 1767  Z-score: 69.7  bits: 22.7 E(): 8.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1767; 79.8% identity (79.8% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::  :: : :: :::::::: :: ::::::::  : ::::: :::::::: ::::::
b24350 GCAACACTTTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGATTAAAAGCTGTTGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::::::::::::::: :::::::: :: ::::::  ::: ::  : :: :::
b24350 AATCCGATGGATTTAAAAAGAGGTATTGATAAAGCTGTTATTAATGCAGTAAAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :: ::::::  ::::::::  ::::: ::::: ::: : :: ::::: :::::::::
b24350 AAAAATTTATCTGTTCCTTGTGCTGATTCTAAAGCAATTACTCAGGTAGGGACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: ::::::::: ::::::   :::::: ::::: ::::::   ::::: :: :: 
b24350 GCTAATGCTGATGAAAAAGTTGGCAGCTTAATTGCAGAAGCTATGGAAAAAGTTGGTAAT
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: :: :: :: :::::::::::  ::::: :  :  :::::::::: :: ::  ::
b24350 GATGGTGTAATTACTGTTGAAGAAGGAACTGGACTAGATAATGAATTAGAAGTAGTTAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::::::::: ::::: ::::: :: ::: :::::: : ::::: :::: 
b24350 GGAATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTATCACCATACTTTATTAATAAACCAGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       :  :: :::::::::::::: : ::::::: :   :::::::::: :::: :::::  : 
b24350 TTAGTGGAATTAGATAATCCATATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATTTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::: ::::::::::::::::::: :::: :::::: ::: :::: ::: ::
b24350 GAATTATTACCTATTTTAGAAGCAGTTGCTAAGTCTAGTAAACCATTAGTTATGATTACT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : :::::::::::::::::::: :::::::::::   :::: :::::::::: 
b24350 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACTTTAGTAGTTAATTCTATGAGAGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: :::: :: :::
b24350 AAAATTGCAGCAGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24331>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24331',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24331" target=_"blank">b24331</a> JQ269442 Buchnera aphidicola isolate 562         (555 nt)
 initn: 1756 init1: 1756 opt: 1767  Z-score: 69.7  bits: 22.7 E(): 8.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1767; 79.8% identity (79.8% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: : ::::: ::::::::::: ::::::::  : ::::: ::::: :::::::::
b24331 GCTACTTTACTTGCACAATCTATTGTTAATGAAGGATTAAAAGCAGTTGCAGCAGGAATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::  ::: :: :: :: :::
b24331 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAAGCTGTTATTAGTGCAGTAGATGAATTA
               70        80        90       100       110       120

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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
        : :: ::::::  :::::::   ::::::::::: ::: : ::::: :: :: :: :::
b24331 AGAAATTTATCTGTTCCTTGTTCCGATTCAAAAGCAATTACTCAAGTTGGAACAATATCT
              130       140       150       160       170       180

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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::::::: : ::::: ::::: ::::::   ::::: :: :: 
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :::::::: :: :::::::::::  : ::::: ::: :::::::::: :: ::: ::
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              250       260       270       280       290       300

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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :::::: : :::::::::::: :::::: : : ::  : :: 
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              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
          :: :::::::: ::::: : ::::::: :   :::::::::: : :: : : : :::
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::  : ::::::::::: :::::: :   :::::::::: : :: ::: : 
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::::::::::::::::::::::::::::::   :::::: :: ::::: 
b24331 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATTCTATGCGTGGAATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: ::::::: :::
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              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24365>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24365',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24365" target=_"blank">b24365</a> JQ269397 Buchnera aphidicola isolate Chait1      (555 nt)
 initn: 1725 init1: 1725 opt: 1762  Z-score: 69.6  bits: 22.7 E(): 8.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1762; 79.8% identity (79.8% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : :: ::::::::::::::::::::  : ::::: ::::: :::::::::
b24365 GCTACTTTATTAGCACAATCTATTGTAAATGAAGGATTAAAAGCAGTTGCAGCAGGAATG
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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::::::::::::::: : :: ::::::   :: ::  : :: :::
b24365 AATCCAATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATCAAGCAGTTATTAAAGCAGTGAAAGAATTA
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :::::::::  ::: :::  : :::: ::::: ::: : ::::: :: :: ::::::
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: :::::::::: :: ::: : :::::  :::: :: :::  ::::::::: :: 
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: ::::: :: :: :: ::::::::  : :: ::  :::::::::::::::: ::  ::
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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :::::: : :: ::::::::: :::::: : ::::: :::: 
b24365 GGTATGCAATTTGATAGAGGATATTTATCTCCTTATTTTATTAATAAACCAGAAACTGGT
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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         : : :::::::: ::::::: ::::::: :  ::::::::::: :::: :::::::::
b24365 AATATAGAATTAGAAAATCCTTATATTTTAATGGTTGATAAAAAAATTTCTAATATTAGA
              370       380       390       400       410       420

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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :: :: ::: :: : :::::: :::: :: ::::::  :::::: ::: : :: ::::: 
b24365 GATATATTATCTTTATTAGAATCAGTAGCAAAATCTGGTAAACCATTATTAATTATTGCA
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::::::::::::::: ::::::::::::::   :::: ::::::: :::
b24365 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCAACATTAGTAGTTAATTCTATGAGAGGTATCGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: :::: ::::: 
b24365 AAAATTGCAGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b32849>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32849',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32849" target=_"blank">b32849</a>  NZ_QGLN01000009 Gilliamella  apis  ESL0169      (555 nt)
 initn: 1679 init1: 1679 opt: 1749  Z-score: 69.4  bits: 22.6 E(): 8.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1749; 79.5% identity (79.5% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::::: ::::: ::: ::::::: :: :::::: : ::::: :::::::: :: :::
b32849 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAACGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :: :::::::: :: ::  :::: :: ::::: ::: : 
b32849 AATCCAATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTAGTTGCAGCTGTTGAAGAGCTT
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :: ::::::::::: :::::: : ::::: ::  : :: :::   :::::::: :::
b32849 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAAA
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::  : :: :: ::::::::: : :::::::: :::
b32849 GAAGGCGTTATCACTGTTGAAGATGGCACAGGTTTACAAGATGAACTTGATGTTGTTGAA
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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::: ::::: ::: : ::::: :::::  : :: : : ::::: : : :
b32849 GGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAACAAACCAGAAACAGCA
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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :::::::::::::  :: : ::::::::::   ::::::::: : :: :::::  : 
b32849 ACGGTTGAATTAGATAGCCCGTATATTTTATTAGCAGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: ::::: : :::::::::
b32849 GAATTATTACCAGTATTAGAAGCTGTTGCTAAAGCAGGTAAATCTTTATTAATCATTGCT
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :: ::::: :: :: : :::::: :::::::: 
b32849 GAAGATGTTGAAGGCGAAGCATTAGCAACTTTAGTTGTGAATACTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::::::::::: :::
b32849 AAAGTTGCTGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24362>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24362',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24362" target=_"blank">b24362</a> JQ269401 Buchnera aphidicola isolate Pgr1        (555 nt)
 initn: 1749 init1: 1749 opt: 1749  Z-score: 69.4  bits: 22.6 E(): 8.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1749; 79.5% identity (79.5% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : :: ::: : :: :: ::::::::: : ::::: :::::::: :: :::
b24362 GCTACTTTATTAGCTCAAGCAATAGTTAATGAAGGTTTAAAAGCAGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::: : :: :::::::: :: :: :::  ::: ::  : :: :::
b24362 AATCCTATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCTGTAATTCATGCTGTAAAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::  : :::  ::: :::   ::: : ::::::::: : ::::::::::::::::: 
b24362 AAAAATATGTCTGTTCCATGTTCTGATCCTAAAGCTATTACTCAAGTAGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: :::::::::: :::::: : ::::: ::::: :: :::   :::::::: :: 
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              190       200       210       220       230       240

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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: :: :: :: :: ::::::::  :::::::::::::::::::::: :::::: ::
b24362 GATGGTGTAATTACTGTAGAAGAAGGAACTGGATTGCAAGATGAATTAGAAGTTGTAAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::: :::::: : : ::: :::: 
b24362 GGTATGCAATTCGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTATTAATAAATCTGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         : : :::::::::::::::: ::::::: :   :::::::::: : :: :::::: : 
b24362 ATTATAGAATTAGATAATCCTTATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
              370       380       390       400       410       420

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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::  :::::::::: ::::: ::::: : :::::: ::: : :: ::::::
b24362 GAATTATTACCAATTTTAGAAGCTGTTGCAAAATCAAGTAAACCATTATTAATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : :: :: :::::::::::::: ::::: :: ::   :::: :::: :: :::
b24362 GAAGATTTAGAGGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTCAATTCTATGAGAGGAATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::::: :::::::::
b24362 AAAGTAGCTGCTGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24334>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24334',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24334" target=_"blank">b24334</a> JQ269438 Buchnera aphidicola isolate Msu1        (555 nt)
 initn: 1744 init1: 1744 opt: 1744  Z-score: 69.3  bits: 22.6 E(): 8.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1744; 79.4% identity (79.4% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : :: ::::::::::: ::::::::: : ::::: :: ::::: :: :::
b24334 GCTACTTTATTAGCTCAATCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCAGTAGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::  ::: ::  : :: :::
b24334 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAAGCAGTTATTAGTGCAGTAAAAGAATTA
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :::::::::  :::::::  :::::::::::::::: : ::::: ::::::::::: 
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: ::::::::: ::::::    ::::::::::: ::::::   :::::::: :: 
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :::::::: :: :: ::::::::  :::: :: ::: :::::::::: :::::  ::
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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :: ::: : :: ::::::::: :::::: : ::::: :::::
b24334 GGTATGCAATTTGATAGAGGGTATTTATCTCCTTATTTTATTAATAAACCAGAAACTGGA
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       :  :: :::::::::::::: :  :::::: :   :::::::::: : :: :::::: : 
b24334 TTAGTAGAATTAGATAATCCATACATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
              370       380       390       400       410       420

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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::  : :::::: :::::::  : ::::: :::::    ::::: ::  : :: ::: ::
b24334 GAGTTATTACCTCTTTTAGAGTCTGTTGCAAAATCAGGAAAACCATTTTTAATTATTTCT
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::: ::::: :: ::   :::: :::: ::::: 
b24334 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTCGTAAATTCTATGAGAGGAATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: : :::::::: 
b24334 AAAATAGCTGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24345>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24345',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24345" target=_"blank">b24345</a> JQ269421 Buchnera aphidicola isolate Msi1        (555 nt)
 initn: 1744 init1: 1744 opt: 1744  Z-score: 69.3  bits: 22.6 E(): 8.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1744; 79.4% identity (79.4% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : :: ::::::::::: ::::::::: : ::::: :: ::::: :: :::
b24345 GCTACTTTATTAGCTCAATCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCAGTAGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::  ::: ::  : :: :::
b24345 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAAGCAGTTATTAGTGCAGTAAAAGAATTA
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :::::::::  :::::::  :::::::::::::::: : ::::: ::::::::::: 
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: ::::::::: ::::::    ::::::::::: ::::::   :::::::: :: 
b24345 GCTAATGCTGATGAAAAAGTTGGAAGTTTAATAGCAGAAGCTATGGAGAAAGTAGGTAAT
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :::::::: :: :: ::::::::  :::: :: ::: :::::::::: :::::  ::
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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :: ::: : :: ::::::::: :::::: : ::::: :::::
b24345 GGTATGCAATTTGATAGAGGGTATTTATCTCCTTATTTTATTAATAAACCAGAAACTGGA
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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       :  :: :::::::::::::: :  :::::: :   :::::::::: : :: :::::: : 
b24345 TTAGTAGAATTAGATAATCCATACATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::  : :::::: :::::::  : ::::: :::::    ::::: ::  : :: ::: ::
b24345 GAGTTATTACCTCTTTTAGAGTCTGTTGCAAAATCAGGAAAACCATTTTTAATTATTTCT
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::: ::::: :: ::   :::: :::: ::::: 
b24345 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTCGTAAATTCTATGAGAGGAATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: : :::::::: 
b24345 AAAATAGCTGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24354>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24354',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24354" target=_"blank">b24354</a> JQ269410 Buchnera aphidicola isolate 3           (555 nt)
 initn: 1725 init1: 1725 opt: 1740  Z-score: 69.2  bits: 22.6 E(): 8.8e+02
banded Smith-Waterman score: 1740; 79.3% identity (79.3% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::  :  : :::::::::::::: ::::::::  : ::::: :: ::::::::::::
b24354 GCTACATTATTAGCGCAATCTATTGTTAATGAAGGATTAAAAGCAGTAGCTGCAGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::: ::::::::::::: :: :: :::  ::: :: :: :: :::
b24354 AATCCTATGGATTTAAAACGAGGAATTGATAAAGCTGTAATTAGTGCAGTAGAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
       ::::: ::::::  :::::::   ::::: ::::::::: : ::::::::::::::::::
b24354 CGTAATTTATCTGTTCCTTGTTCTGATTCTAAAGCTATTACACAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::: ::: : ::::: ::::: :: :::  :::::: :: :: 
b24354 GCAAATGCAGATGAAAAAGTAGGTTCTTTAATTGCAGAAGCAATGGATAAAGTTGGTAAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: ::::::::::: :: ::::::::  : :: :: ::: :::::::::: :: ::  ::
b24354 GATGGAGTTATAACAGTAGAAGAAGGAACAGGTTTACAAAATGAATTAGAAGTAGTTAAA
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              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :: ::: : :: :: :::::: :::::: ::::::  :::::
b24354 GGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCATATTTTATTAATAAAACAGATACTGGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       :  :: :::::::: ::::: : ::::::: :    ::::::::: :::: : : :::::
b24354 TTAGTAGAATTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCAGATAAAAAAATTTCTAGTGTTAGA
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::: : ::::::::::: :: ::: :   :::::: ::: : :: ::: : 
b24354 GAATTATTACCTATATTAGAAGCAGTAGCAAAAGCAGGTAAACCATTATTAATTATTTCA
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::::::::::::::: :: ::::: :: ::   :::::: :::::::: 
b24354 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCAACTTTAGTTGTAAATTCTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: : :: ::::::
b24354 AAAATAGCAGCTGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b7717>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b7717',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b7717" target=_"blank">b7717</a> NC_007292 Candidatus Blochmannia pennsylvanicus   (555 nt)
 initn: 1696 init1: 1696 opt: 1735  Z-score: 69.1  bits: 22.6 E(): 8.9e+02
banded Smith-Waterman score: 1735; 79.2% identity (79.2% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::  : :: :::::::: :: :::::::: :: ::::: :: ::::: ::::::
b7717  GCAACCGTGTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGACTCAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :::::::::::::: ::  :::: :: :: :: :: :: 
b7717  AATCCCATGGATTTAAAACGTGGAATTGATAAGGCAGTCGTTGCAGCAGTAGAAGAATTG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: :::::   ::::::  :::: : ::::::::::: ::::::::::::::::::
b7717  AAAAAACTATCTGTGCCTTGTTCAGATCCTAAAGCTATTGCACAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :::::::::::::: ::::::    : :: ::  : :: :::  ::: :: ::::::
b7717  GCAAATTCTGATGAAACTGTTGGTAAACTTATTGCGCAAGCAATGGATAAGGTGGGAAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::::::::: :: :: :::::::: :: :: :: ::::::::: ::::::: :: :::
b7717  GAAGGAGTTATCACTGTAGAAGAAGGGTCGGGTTTACAAGATGAACTAGATGTAGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::::::::: ::::: :::::::: :::::::::::::::: : : :::  ::: 
b7717  GGTATGCAATTTGACCGTGGTTATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAACCTGAAAGTGGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :: ::: ::::  ::::::: :::::::::   ::::::::  :::: :: ::::: 
b7717  ACAGTGGAACTAGAACATCCTTTCATTTTATTAGCAGATAAAAAGATTTCTAACATTAGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :::::: : ::::: ::  :    ::::: :: ::::: ::::::
b7717  GAAATGTTACCTATATTAGAATCTGTTGCAAAGGCAGGAAAACCATTGCTTATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::::::::: ::::: :: :: :: :: :: :::::::: ::::: :::
b7717  GAAGATGTAGAAGGTGAAGCTTTAGCGACTTTGGTTGTAAATAATATGCGTGGTATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::  :::: :: 
b7717  AAAGTAACTGCCGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b32937>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32937',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32937" target=_"blank">b32937</a> NZ_QICT01000003 Gilliamella  apicola  DSM 10409  (555 nt)
 initn: 1642 init1: 1642 opt: 1731  Z-score: 69.0  bits: 22.6 E(): 9e+02
banded Smith-Waterman score: 1731; 79.1% identity (79.1% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: ::::: ::: :::: :: ::::::::: : ::::: :::::::: :: :::
b32937 GCAACAGTACTTGCTCAAGCTATCGTTAATGAAGGTTTAAAAGCTGTTGCTGCGGGCATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::: : :: :::::::: :::::  ::::::: ::::: ::: : 
b32937 AATCCTATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCGGTGGTTGCTGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::::: :: ::::  :: :: ::::: ::::: ::::: ::::::::::: 
b32937 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGACTCTAAAGCAATTGCGCAAGTTGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :: ::::::::::: :::::: : ::::: ::  : :: :::   :::::::: :::
b32937 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :: :: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b32937 GAAGGTGTCATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::: ::::: ::: : ::::: :::::  : :::: : ::::: : :  
b32937 GGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACAGCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::::::::::::::: :::: ::::::::::  :::::::::: : :: :::::  : 
b32937 ACTGTTGAATTAGATAACCCTTATATTTTATTAGCTGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  :::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: :  :: : :: :: :::
b32937 GAATTACTACCAGTATTAGAAGCGGTTGCTAAAGCGGGTAAATCACTATTAATTATCGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: :: :  ::::: :::::::: 
b32937 GAAGATGTTGAAGGCGAAGCATTAGCAACATTAGTTGTCAATACAATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::::: :: :::
b32937 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b22784>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b22784',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b22784" target=_"blank">b22784</a> NC_020075 Candidatus Blochmannia chromaiodes 64  (555 nt)
 initn: 1687 init1: 1687 opt: 1726  Z-score: 68.9  bits: 22.6 E(): 9.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1726; 79.1% identity (79.1% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::  : :: :::::::: :: :::::::: :: ::::: :: ::::: ::::::
b22784 GCAACCGTGTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGACTCAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :::::::::::::: ::  :::: :: :: :: :: :: 
b22784 AATCCCATGGATTTAAAACGTGGAATTGATAAGGCAGTCGTTGCAGCAGTAGAAGAATTG
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: :::::   ::::::  :::: : ::::::::::: ::::::::::::::::::
b22784 AAAAAACTATCTGTGCCTTGTTCAGATCCTAAAGCTATTGCACAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :::::::::::::: ::::::    : :: ::  : :: :::  ::: :: ::::::
b22784 GCAAATTCTGATGAAACTGTTGGTAAACTTATTGCGCAAGCAATGGATAAGGTGGGAAAA
              190       200       210       220       230       240

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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::::::::: :: :: :::::::: :: :: :: ::::::::::::::::: :: :::
b22784 GAAGGAGTTATCACTGTAGAAGAAGGATCGGGTTTACAAGATGAATTAGATGTAGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::::::::::::::: ::::: :: :::::::::::::::: : : :::   :: 
b22784 GGTATGCAATTTGATCGTGGTTATCTGTCTCCTTATTTTGTTAATAAACCTGAAAGCGGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :: ::: ::::  ::::::: :::::::::   :: :::::  :::: :: ::::: 
b22784 ACAGTGGAACTAGAACATCCTTTCATTTTATTAGCAGACAAAAAGATTTCTAACATTAGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :::::: : ::::: ::  :    ::::: :: ::::: ::::::
b22784 GAAATGTTACCTATATTAGAATCTGTTGCAAAGGCAGGAAAACCATTGCTTATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::::::::: ::::: :: :: :: :: :: :::::::: ::::: :::
b22784 GAAGATGTAGAAGGTGAAGCTTTAGCGACTTTGGTTGTAAATAATATGCGTGGTATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::  :::: :: 
b22784 AAAGTAACTGCCGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24336>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24336',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24336" target=_"blank">b24336</a> JQ269436 Buchnera aphidicola isolate 2041        (555 nt)
 initn: 1720 init1: 1720 opt: 1726  Z-score: 68.9  bits: 22.6 E(): 9.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1726; 79.1% identity (79.1% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: : ::::: ::::::::::: ::::::::  : ::::: ::::: :::::::::
b24336 GCTACTTTACTTGCACAATCTATTGTTAATGAAGGATTAAAAGCAGTTGCAGCAGGAATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :: ::::::::::::::::: ::::::::::: :: ::::::  ::: :: :: :: :::
b24336 AACCCTATGGATTTAAAAAGGGGAATTGATAAAGCTGTTATTAGTGCAGTAGATGAATTA
               70        80        90       100       110       120

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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
        : :: ::::::  :::::::   ::::::::::: ::: : ::::: :: :: :: :::
b24336 AGAAATTTATCTGTTCCTTGTTCTGATTCAAAAGCAATTACTCAAGTTGGAACAATATCT
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::::::: : ::::: ::::: :: :::   ::::: ::::: 
b24336 GCGAATGCAGATGAAAAAGTTGGTTCTTTAATTGCAGAAGCGATGGAAAAAGTTGGAAAT
              190       200       210       220       230       240

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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: ::::: :: :: :::::::::::  : ::::: ::: :::::::::: :: ::: ::
b24336 GATGGAGTAATTACTGTTGAAGAAGGAACAGGATTACAAAATGAATTAGAAGTAGTAAAA
              250       260       270       280       290       300

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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::: : :::::: : :::::::::::: :::::: : : ::  : :: 
b24336 GGTATGCAATTTGATAGAGGATATTTATCACCTTATTTTATTAATAAACCTGATACAGGT
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       :  :: :::::::: ::::: : ::::::: :   :::::::::: : :: : : : :::
b24336 TTAGTAGAATTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAGTGTAAGA
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::  : ::::::::::: :::::: :    ::::::::: : :: ::: : 
b24336 GAATTATTACCAATATTAGAAGCAGTAGCTAAAGCAGGCAAACCTTTATTAATTATTTCA
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::::::::::::::::::::::::::: ::   :::::: :: ::::: 
b24336 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTAAATTCTATGCGTGGAATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::: ::::::: :: 
b24336 AAAATTGCTGCAGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b29271>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29271',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29271" target=_"blank">b29271</a> LKAS01000002 Bacterium endosymbiont PRUG         (555 nt)
 initn: 1720 init1: 1720 opt: 1726  Z-score: 68.9  bits: 22.6 E(): 9.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1726; 79.1% identity (79.1% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :::::: : :: :::::::::::::: :::::: : ::::: :: ::  : ::  ::
b29271 GCAACTGTTTTAGCACAATCTATTGTAAACGAAGGTTTAAAAGCAGTAGCATCTGGTTTG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::::::::::::::: :::::::: ::  : ::::: :: ::::: :: :::
b29271 AATCCAATGGATTTAAAAAGAGGTATTGATAAAGCAATAATTGCAGCAGTTGAAGAATTA
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: : ::    ::::::  :::::: ::: : :: :: ::::: :::::::: :::
b29271 AAAAAACTTTCAGTACCTTGTTCAGATTCTAAATCAATAGCACAAGTCGGTACTATATCT
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::: : ::::: ::  : ::::: ::: ::::::::   ::::::::::::
b29271 GCAAATGCAGATCATACAGTAGGGACATTAATTGCAAATGCTATGGAAAAAGTAGGAAAA
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :::::::::::::: :: :::::::::::::::::: : :::::: ::::::: ::::::
b29271 GAAGGAGTTATAACAGTAGAAGAAGGTTCTGGATTGAATGATGAACTAGATGTAGTAGAA
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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: :::::::: ::  : ::::: ::::: :: :::::::: :::: : : ::: :::::
b29271 GGAATGCAATTCGACAGAGGATACCTTTCTCCATATTTTGTAAATAAACCTGAAACTGGA
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :: :::::::: :::::::::::  :  ::   ::::::::::: :: :::::::::
b29271 ACAGTAGAATTAGAAAATCCTTTTATACTTCTAGCAGATAAAAAAGTGTCTAATATTAGA
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::: ::::  : :::::: : :: :: ::::::   ::: :: : :: :: ::::::
b29271 GAAATGCTACCAATATTAGAATCTGTAGCAAAATCTGGAAAATCTCTTCTAATTATTGCT
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::: : ::::::::::: :: :: : :::: :::::::::::
b29271 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCACTGGCTACATTAGTTGTAAATACTATGAGAGGTATTGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::::: : :::::: 
b29271 AAAGTCGTTGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b33203>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b33203',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b33203" target=_"blank">b33203</a> NZ_QGTI01000005  Frischella perrara DSM 104328   (555 nt)
 initn: 1642 init1: 1642 opt: 1717  Z-score: 68.8  bits: 22.5 E(): 9.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1717; 78.9% identity (78.9% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       ::::: ::  : :: ::: : ::::: :: :::::: : ::::: ::::: ::::: :::
b33203 GCTACAGTATTAGCTCAAGCAATTGTTAACGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCAGCAGGCATG
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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: :::::::::::: : :: :::::::: :::::::::::::: :: :: ::  : 
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :::::::::::::::::::  :: :: :: :::::::: :::::::: :: ::::::
b33203 AAAAAATTATCTTCTCCTTGTGCTGACTCTAAGGCTATTGCACAAGTAGGAACGATTTCT
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       ::::: :: :::::::: ::::::   ::::: ::: : :: :::   ::::: :: :::
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b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::: ::::  : ::::::::: : :::::::: :::
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              250       260       270       280       290       300

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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::: ::::: ::: : ::::: :::::  :::: : : ::::: : : :
b33203 GGTATGCAGTTTGACCGTGGCTATTTATCACCATATTTCATTAACAAACCAGAAACAGCA
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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :::::: ::::::  :::: :::: :: :  ::::::::::: : :: :::::  : 
b33203 ACAGTTGAACTAGATAGCCCTTATATTCTACTTGTTGATAAAAAAATATCTAATATCCGT
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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: ::::::::::  : ::::: ::::::::: :   :::: : ::: : :: :: :::
b33203 GAATTGTTACCTGTGCTTGAAGCTGTTGCTAAAGCAGGTAAATCATTATTAATTATCGCT
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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       ::::::::::::::::::::: :::: :::::::: ::::: :  ::::: :::::::: 
b33203 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCACTAGCAACATTAGTGGTTAATACCATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       ::::::::::: :: 
b33203 AAAGTTGCTGCGGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b29347>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29347',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29347" target=_"blank">b29347</a> NAHW01000012 Gilliamella apicola N-9-4           (555 nt)
 initn: 1624 init1: 1624 opt: 1713  Z-score: 68.7  bits: 22.5 E(): 9.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1713; 78.7% identity (78.7% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: ::::: ::: :::: :: ::::::::: : :::::  ::::::: :: :::
b29347 GCAACAGTACTTGCTCAAGCTATCGTTAATGAAGGTTTAAAAGCTATTGCTGCGGGCATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::::::: : :: :::::::: :::::  ::::::: ::::: ::: : 
b29347 AATCCTATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCGGTGGTTGCTGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::::: :: ::::  :: :: ::::: ::::: ::::: ::::::::::: 
b29347 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGACTCTAAAGCAATTGCACAAGTTGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :: :: ::::::::::: :::::: : ::::: ::  : :: :::   :::::::: :::
b29347 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b20460 GAAGGAGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :: :: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b29347 GAAGGTGTCATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

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b20460 GGGATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTGTTAATAGAACAGAATCTGGA
       :: ::::: ::::: ::::: ::: : ::::: :::::  : :::: : ::::: : :  
b29347 GGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACAGCT
              310       320       330       340       350       360

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b20460 TCTGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTATTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::::::::::::::  :::: ::::::::::  :::::::::: : :: :::::  : 
b29347 ACTGTTGAATTAGATAGCCCTTATATTTTATTAGCTGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

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b20460 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  :::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: :  :: : :: :: :::
b29347 GAATTACTACCAGTGTTAGAAGCGGTTGCTAAAGCAGGTAAATCACTATTAATTATCGCT
              430       440       450       460       470       480

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b20460 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAACAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: :: :  ::::: :::::::: 
b29347 GAAGATGTTGAAGGCGAAGCATTAGCAACATTAGTTGTCAATACAATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b20460 AAAGTTGCTGCTGTT
       :::::::: :: :::
b29347 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b9501>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b9501',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b9501" target=_"blank">b9501</a> AB231904 Candidatus Ishikawaella capsulata        (555 nt)
 initn: 1711 init1: 1711 opt: 1713  Z-score: 68.7  bits: 22.5 E(): 9.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1713; 78.7% identity (78.7% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b20460 GCTACTGTTCTTGCGCAATCTATTGTAAATGAAGGTCTTAAAGCGGTTGCTGCAGGAATG
       ::::::::  : :: ::: : ::::::::: :::: :: ::::: :::::::: :: :::
b9501  GCTACTGTATTAGCTCAAGCAATTGTAAATAAAGGCCTAAAAGCAGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b20460 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAGGCGGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::::: ::: : :: :::::::: ::::::::::::::::::::  :::: 
b9501  AATCCTATGGATTTGAAACGTGGTATTGATAAAGCGGTTATTGCTGCCGTTGAACAGTTG
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b20460 CGTAAATTATCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
            : : :::   :::::   ::: :::::::: ::: : ::::::::::::::::::
b9501  AAGGCACTTTCTGTACCTTGCTCAGACTCAAAAGCGATTACACAAGTAGGTACTATTTCT
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b20460 GCTAATTCTGATGAAACAGTTGGTGCCTTAATAGCAGATGCTATGACTAAAGTAGGAAAA
       :::::: : :::::::  :: ::: : ::::: ::  : :: :::   : ::: :: :::
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       :::::::: :: :: :::::::: ::  :: : :: :::::::::::: ::::::: :::
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       :: ::::: ::::::::::: ::: : :: :::::::::::::::: : ::::: : :: 
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       :: ::::: :::::: :::::::::: :: :::::::  ::::: ::: :: : :: :::
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       :::::::: ::::::::::: :: :: ::: : :: ::::: :  ::::: :: ::::: 
b9501  GAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTGGCAACACTTGTTGTTAATACAATGCGTGGAATTGTC
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b9501  AAAGTTGCTGCCGCT
              550     

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<hr>
<p><pre>


555 residues in 1 query   sequences
10433008 residues in 18820 library sequences
 Scomplib [35.03]
 start: Mon Jun 24 03:29:21 2024 done: Mon Jun 24 03:29:23 2024
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]
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