/var/www/html/cpndb/fasta_results/b19587.fasta# /data/www/cpndb/fasta35 -E 200 -Q -m 6 -b 20 -d 20 -z 2 -H /data/www/cpndb/fasta_results/b19587 /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 35.03 Feb. 18, 2008
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b19587
  1>>>b19587 552 nt - 552 nt
Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences

10433008 residues in 18820 sequences
Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0030;  K=1.096e-05 (cen=941)
Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized]
Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6
 join: 51, opt: 36, open/ext: -12/-4, width:  16
 Scan time:  2.380



The best scores are:                                      opt bits E(18820)
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b21749 NZ_AGAG01000001 Candidatus Arthromitus  ( 552) [f] 2265 26.3      68 align
b19592 AP012209 Candidatus Arthromitus sp. SFB ( 552) [f] 2265 26.3      68 align
b21750 NZ_AFXW01000087 Candidatus Arthromitus  ( 552) [f] 2265 26.3      68 align
b35806 NZ_RJWG01000008 Clostridium prolinivora ( 552) [f] 1806 24.3 2.7e+02 align
b18892 CP002410 Clostridium botulinum BKT01592 ( 552) [f] 1801 24.3 2.8e+02 align
b3195 AB086955 Clostridium botulinum strain D- ( 552) [f] 1783 24.2 2.9e+02 align
b29175 NZ_LZYV01000097 Clostridium roseum DSM  ( 552) [f] 1770 24.2   3e+02 align
b29177 NZ_LZYU01000034 Clostridium roseum DSM  ( 552) [f] 1770 24.2   3e+02 align
b9540 NC_008593 Clostridium novyi NT           ( 552) [f] 1761 24.1 3.1e+02 align
b29174 NZ_LZYW01000092 Clostridium aurantibuty ( 552) [f] 1761 24.1 3.1e+02 align
b34643 NZ_BHYK01000001 Clostridium  tagluense  ( 552) [f] 1761 24.1 3.1e+02 align
b19258 AESA01000076 Clostridium botulinum C st ( 552) [f] 1756 24.1 3.1e+02 align
b10980 NZ_ABDQ01000002 Clostridium botulinum C ( 552) [f] 1752 24.1 3.2e+02 align
b29861 LITR01000001 Clostridium  autoethanogen ( 552) [f] 1747 24.1 3.2e+02 align
b14410 NZ_ACSJ01000001 Clostridium botulinum D ( 552) [f] 1747 24.1 3.2e+02 align
b29924 NZ_LITR01000001 Clostridium  autoethano ( 552) [f] 1747 24.1 3.2e+02 align
b1288 NC_003030 Clostridium acetobutylicum ATC ( 552) [f] 1743 24.1 3.3e+02 align
b18653 CP002118 Clostridium acetobutylicum EA  ( 552) [f] 1743 24.1 3.3e+02 align
b116 M74572 Clostridium acetobutylicum DSM 173 ( 552) [f] 1743 24.1 3.3e+02 align


>>>b19587, 552 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library

>>b31710 NC_016012  Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Y  (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 2760; 100.0% identity (100.0% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b31710 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :::::::::::: b31710 TGTGTTGGTGTT 550


>>b21749 NZ_AGAG01000001 Candidatus Arthromitus sp. SFB-  (552 nt)
 initn: 2259 init1: 2259 opt: 2265  Z-score: 89.3  bits: 26.3 E():   68
banded Smith-Waterman score: 2265; 90.0% identity (90.0% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: ::::::::::: ::::::::::::::::: :: :::::::: :: :: ::::::::: b21749 GCGACTGTTTTAGCACAAGCTATAATAAGAGAGGGTCTTAAAAACGTTACGTCAGGTGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::::::::::::::::::::::::: : ::::::::: :::::::: :: :: b21749 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAACTAGCTGTAGATGCAGCAGTTGAGGAGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::: :: ::::: :: :: ::: b21749 AAAAAACTTTCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGATATATCTAGGGTTGCATCTATATCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :: ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::: :::::: b21749 GCAGGTGATTCAACTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :::::::::::::::::: b21749 GGCGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAAAATATGGAAACTAGTCTTGAAGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: b21749 ATGCAGTTTGAAAGAGGTTATGTAAGTCCATATATGGTTACTGATGCGGAAAAAATGGAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA ::::: ::::: :: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: b21749 GCATCTTTGGAGGATCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAAATTTCTAATATTCAAGAG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::::::::::::::: ::::: :::::::: :: ::::: :: :::::::: :: b21749 ATACTTCCTATTCTTGAGCAGATTGTGCAACAAGGTAAAAAACTATTGATAATAGCTGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::::::::::: :: :: :: :::::::: ::::: :::::::::::::::::::::::: b21749 GATATAGAAGGTGAAGCTTTGGCTACTTTGGTTGTTAATAGATTAAGAGGAACATTTACA 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :::::::::::: b21749 TGTGTTGGTGTT 550


>>b19592 AP012209 Candidatus Arthromitus sp. SFB-mouse-Y  (552 nt)
 initn: 2259 init1: 2259 opt: 2265  Z-score: 89.3  bits: 26.3 E():   68
banded Smith-Waterman score: 2265; 90.0% identity (90.0% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: ::::::::::: ::::::::::::::::: :: :::::::: :: :: ::::::::: b19592 GCGACTGTTTTAGCACAAGCTATAATAAGAGAGGGTCTTAAAAACGTTACGTCAGGTGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::::::::::::::::::::::::: : ::::::::: :::::::: :: :: b19592 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAACTAGCTGTAGATGCAGCAGTTGAGGAGATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::: :: ::::: :: :: ::: b19592 AAAAAACTTTCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGATATATCTAGGGTTGCATCTATATCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :: ::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::: :::::: b19592 GCAGGTGATTCAACTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: :::::::::::::::::: b19592 GGCGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAAAATATGGAAACTAGTCTTGAAGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::::::::: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: b19592 ATGCAGTTTGAAAGAGGTTATGTAAGTCCATATATGGTTACTGATGCGGAAAAAATGGAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA ::::: ::::: :: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: b19592 GCATCTTTGGAGGATCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAAATTTCTAATATTCAAGAG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::::::::::::::: ::::: :::::::: :: ::::: :: :::::::: :: b19592 ATACTTCCTATTCTTGAGCAGATTGTGCAACAAGGTAAAAAACTATTGATAATAGCTGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::::::::::: :: :: :: :::::::: ::::: :::::::::::::::::::::::: b19592 GATATAGAAGGTGAAGCTTTGGCTACTTTGGTTGTTAATAGATTAAGAGGAACATTTACA 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :::::::::::: b19592 TGTGTTGGTGTT 550


>>b21750 NZ_AFXW01000087 Candidatus Arthromitus sp. SFB-  (552 nt)
 initn: 2259 init1: 2259 opt: 2265  Z-score: 89.3  bits: 26.3 E():   68
banded Smith-Waterman score: 2265; 90.0% identity (90.0% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

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>>b35806 NZ_RJWG01000008 Clostridium prolinivorans PYR-1  (552 nt)
 initn: 1747 init1: 1747 opt: 1806  Z-score: 78.5  bits: 24.3 E(): 2.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1806; 80.8% identity (80.8% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT ::::: :: : :::::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: ::: b35806 GCAACACTTCTTGCTCAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :::::::::: :::::: :: :: ::::: :: :: :::::::::::: b35806 AATCCAATGCTTATAAGAACTGGTATCAATAAAGCCGTAGAAAAAGCTGTTGAAGAAATC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT ::::: : :: : : :: :::: :: :::::::: : :::::::: ::::: :: b35806 AAAAAGATTTCAAGACCAGTTGATGGAAAAGAAGACATAGCTAGAGTTGCTTCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: ::: :: : ::: :::::::::::::::::::::: :: ::::: :::::: b35806 GCTGCTGACGAAGAAATAGGAAAGCTTATAGCTGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :::::::::::::::::::: :: :: ::::: ::: : :: ::::::::::: b35806 GGTGTTATAACAGTTGAAGAATCAAAATCTATGGGCACTGAATTAGATGTTGTTGAAGGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::: ::::::::: :::: :::::::::::::::::: : :::::::::::: b35806 ATGCAGTTTGATAGAGGATATGTAAGCCCATATATGGTTACTGATACTGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: : :: :: :::::::: : ::::: ::::: ::::::::::: :: :::::: b35806 GCTGTTCTAGACGATCCATATATACTTATAACTGATAAAAAGATTTCTAACATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :: ::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::::::::::::::::: :: b35806 ATCCTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAACTTTTAATAATAGCTGAT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: :::::::: :::::::: :::: ::::::::::::::: :: b35806 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTCACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :: :: :: ::: b35806 TGCGTAGGAGTT 550


>>b18892 CP002410 Clostridium botulinum BKT015925         (552 nt)
 initn: 1762 init1: 1762 opt: 1801  Z-score: 78.4  bits: 24.3 E(): 2.8e+02
banded Smith-Waterman score: 1801; 80.8% identity (80.8% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::::::::::::::::::: : ::::: :: ::: :::: ::: b18892 GCTACATTACTTGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGATTAAAAAACGTTACAGCAGGGGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :: :: ::::: :: :::::::: ::::: :::: :: :::::: :::: b18892 AATCCAATGCTAATTAGAAAAGGAATAAAATTAGCTGTTGATACTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: ::: :::::::::: :::: :: b18892 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATAGCAAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: ::: : : : ::: : :: ::::: :::::::::::::: :::::::::::: b18892 GCTGCAGATCCTGAAATCGGAAAACTAATAGCAGATGCTATGGAGAAAGTAGGAAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: ::::: :: :: : :::: ::: :::::::::::::: ::: b18892 GGAGTTATTACTGTAGAAGAATCAAATACAATGGCAACAGAACTTGAAGTTGTTGAGGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: :::::::::::::::::: b18892 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATGCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: ::: ::: : :::::::: : :::: ::::: :: :: ::::: :::::: b18892 GCTGTATTAGAAAATCCATATATACTTTTAACTGATAAAAAAATAAGCAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::::::::::: :::::::: b18892 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAACTTTTAATTATAGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: :::::::: :::::::: :::: :::::::::::::::::: b18892 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : ::: b18892 TGTGTAGCTGTA 550


>>b3195 AB086955 Clostridium botulinum strain D-4947      (552 nt)
 initn: 1753 init1: 1753 opt: 1783  Z-score: 78.0  bits: 24.2 E(): 2.9e+02
banded Smith-Waterman score: 1783; 80.4% identity (80.4% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::::::::::::::::::: : :::::::: ::: :::: ::: b3195 GCTACATTACTTGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCAGGGGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :: ::::: :: :: ::::: :: :::::::: ::::: :::: :: :::::: :::: b3195 AACCCAATGCTAATTAGAAAAGGAATAAAATTAGCTGTTGATACTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: ::: :::::::::: :::: :: b3195 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATAGCAAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: ::: : : : ::: : :: ::::: ::::::::::::: ::::::::::::: b3195 GCTGCAGATCCTGAAATCGGAAAACTAATAGCAGATGCTATGGAGAGGGTAGGAAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: ::::: :: :: : :::: ::: :::::::::::::::::: b3195 GGAGTTATTACTGTAGAAGAATCAAATACAATGGCAACAGAACTTGAAGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: :::::::::::::::::: b3195 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATGCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: ::: ::: : :::::::: : :::: ::::: :: :: ::::: ::::: b3195 GCTGTATTAGAAAATCCATATATACTTTTAACTGATAAAAAAATAAGCAATATACAAGAG 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: ::::::::::::::: : ::::: :::::::: b3195 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGGAAGAAATTGTTAATTATAGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: :::::::: :::::::: :::: :::::::::::::::::: b3195 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :: :: : ::: b3195 TGCGTAGCTGTA 550


>>b29175 NZ_LZYV01000097 Clostridium roseum DSM 7320      (552 nt)
 initn: 1703 init1: 1703 opt: 1770  Z-score: 77.7  bits: 24.2 E(): 3e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT ::::: :: : :: ::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: ::: b29175 GCAACACTTCTTGCACAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :::::::::: :: :::: : : :::::::: :: ::::::::: : : b29175 AATCCAATGCTTATAAGAAGCGGAATAAGACTCGCTGTAGAAAAAACAGTTGAAGGACTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT ::: : :::: :::::::: ::::: :: :::: ::: :::::::::: :::::::: b29175 AAAGGAATATCAAAAAATGTTAATGGAAAAGAAGATATAGCAAGAGTTGCTTCAATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :: : ::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::: :: ::::: :: ::: b29175 GCAGCAGATCCTGAAATAGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT ::::::::::: :::::::: :: :: :::: :: ::::: :::::::::::: b29175 GGTGTTATAACTGTTGAAGAATCAAAATCAATGGGTACAGAGCTTGATGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: ::: :::::: :::::: b29175 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATCAAGAAAAGATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: : : :: :: :::::::: ::::::::::::::::: :: :: ::::: :::::: b29175 GCTGTACTTGATGATCCATATATATTAATAACAGATAAGAAAATATCAAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :: ::::: ::::::::::::: :: :::::::: :::::: : : :::::::: :: b29175 ATTCTTCCACTTCTTGAGCAAATAGTTCAACAAGGTAAGAAATTACTTATAATAGCTGAT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::: : :::::::: :: :::::::: :::::::: :::: ::::::::::::::::: b29175 GATGTTGAAGGAGAAGCTTTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTAAC 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::::: :::: b29175 TGTGTTGCTGTT 550


>>b29177 NZ_LZYU01000034 Clostridium roseum DSM 6424      (552 nt)
 initn: 1703 init1: 1703 opt: 1770  Z-score: 77.7  bits: 24.2 E(): 3e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT ::::: :: : :: ::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: ::: b29177 GCAACACTTCTTGCACAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :::::::::: :: :::: : : :::::::: :: ::::::::: : : b29177 AATCCAATGCTTATAAGAAGCGGAATAAGACTCGCTGTAGAAAAAACAGTTGAAGGACTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT ::: : :::: :::::::: ::::: :: :::: ::: :::::::::: :::::::: b29177 AAAGGAATATCAAAAAATGTTAATGGAAAAGAAGATATAGCAAGAGTTGCTTCAATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :: : ::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::: :: ::::: :: ::: b29177 GCAGCAGATCCTGAAATAGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT ::::::::::: :::::::: :: :: :::: :: ::::: :::::::::::: b29177 GGTGTTATAACTGTTGAAGAATCAAAATCAATGGGTACAGAGCTTGATGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: ::: :::::: :::::: b29177 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATCAAGAAAAGATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: : : :: :: :::::::: ::::::::::::::::: :: :: ::::: :::::: b29177 GCTGTACTTGATGATCCATATATATTAATAACAGATAAGAAAATATCAAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :: ::::: ::::::::::::: :: :::::::: :::::: : : :::::::: :: b29177 ATTCTTCCACTTCTTGAGCAAATAGTTCAACAAGGTAAGAAATTACTTATAATAGCTGAT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::: : :::::::: :: :::::::: :::::::: :::: ::::::::::::::::: b29177 GATGTTGAAGGAGAAGCTTTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTAAC 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::::: :::: b29177 TGTGTTGCTGTT 550


>>b9540 NC_008593 Clostridium novyi NT                    (552 nt)
 initn: 1717 init1: 1717 opt: 1761  Z-score: 77.5  bits: 24.1 E(): 3.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1761; 79.9% identity (79.9% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::: :: :::::::::::::: :::::::::::: :::::::: b9540 GCTACATTACTTGCTCAAGCAATCATAAGAGAAGGACTAAAAAATGTAACAGCAGGTGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :: ::::: ::::::::::: ::::::::::: :::::::::: :: :::::: :::: b9540 AACCCAATGCTTATAAGAAAAGGTATAAAATTAGCTGTAGATACTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: ::: : :::::::: :::: :: b9540 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATAGCTAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: :::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::: :: ::::: :: ::: b9540 GCTGCTGATCCTGAAATCGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAAAAAGTAGGCAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: ::::: :: :: : :::: :: ::::::::::::::::: b9540 GGAGTTATCACTGTAGAAGAATCAAATACAATGGCTACAGAACTTGAAGTTGTTGAAGGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: :::::::: ::::::: :: ::::: :: :::::::::::::::::: b9540 ATGCAATTTGATAGAGGATACTTAAGTCCTTACATGGTAACAGATGCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: ::: ::: : :::::::: : :::: ::::: ::::: ::::: :::::: b9540 GCTGTATTAGAAAATCCATATATCCTTTTAACTGATAAAAAGATAAGCAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::: : ::::: :: ::::: b9540 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAATTATTAATTATTGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: ::::::::::::::::: :: : :::::::::::::::::: b9540 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTTAACAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :::: b9540 TGTGTAGCTGTT 550


>>b29174 NZ_LZYW01000092 Clostridium aurantibutyricum DS  (552 nt)
 initn: 1703 init1: 1703 opt: 1761  Z-score: 77.5  bits: 24.1 E(): 3.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1761; 79.9% identity (79.9% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: :: : :: ::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: ::: b29174 GCGACACTTCTTGCACAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :::::::::: :: :::: : : :::::::: :: ::::::::: : : b29174 AATCCAATGCTTATAAGAAGCGGAATAAGACTCGCTGTAGAAAAAACAGTTGAAGGACTT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT ::: : :::: :::::::: ::::: :: :::: ::: :::::::::: :::::::: b29174 AAAGGAATATCAAAAAATGTTAATGGAAAAGAAGATATAGCAAGAGTTGCTTCAATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :: : ::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::: :: ::::: :: ::: b29174 GCAGCAGATCCTGAAATAGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAAAAAGTAGGCAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT ::::::::::: :::::::: :: :: :::: :: ::::: :::::::::::: b29174 GGTGTTATAACTGTTGAAGAATCAAAATCAATGGGTACAGAGCTTGATGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: ::: :::::: :::::: b29174 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATCAAGAAAAGATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: : : :: :: :::::::: ::::::::::::::::: :: :: ::::: :::::: b29174 GCTGTACTTGATGATCCATATATATTAATAACAGATAAGAAAATATCAAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :: ::::: ::::::::::::: :: :::::::: :::::: : : :::::::: :: b29174 ATTCTTCCACTTCTTGAGCAAATAGTTCAACAAGGTAAGAAATTACTTATAATAGCTGAT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::: : :::::::: :: :::::::: :::::::: :::: ::::::::::::::::: b29174 GATGTTGAAGGAGAAGCTTTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTAAC 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::::: :::: b29174 TGTGTTGCTGTT 550


>>b34643 NZ_BHYK01000001 Clostridium  tagluense  A121     (552 nt)
 initn: 1717 init1: 1717 opt: 1761  Z-score: 77.5  bits: 24.1 E(): 3.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1761; 79.9% identity (79.9% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: :: : ::::::::::::::::::::::: : :::::::: ::: : ::::: b34643 GCTACACTTCTTGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGTTTGAAAAATGTTACAGCTGGTGCC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC ::::: :: :: ::::::: :::::::::: ::::::: :: :: ::::::::::::::: b34643 AATCCTATGCTAATAAGAACTGGTATAAAAATGGCTGTGGACAAAGCAGTTGAAGAAATC 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: :::::: :: :: ::::: :::: ::: : :::::::: :::: :: b34643 AAAAAATCTTCTAAACCAGTTAACGGTAAAGAAGATATAGCTAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA ::: ::::: :: ::::: :: :::::: :::::::::: :: ::::: :::::: b34643 GCTAGTGATGAAGAAATTGGAACTCTAATAGCTAATGCTATGGAAAAAGTAGGTAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: :::::::: :: ::::: :: :: ::::: :::: :: :: :: :::::::: b34643 GGCGTTATAACTGTAGAAGAATCAAAATCTATGGGAACTGAGCTAGATGTAGTTGAAGGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::: ::::::::: ::::::::::::::::::: ::: : :::::::::::: b34643 ATGCAGTTTGATAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTTACAGATCCTGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA ::: : ::::: : ::::::::::::::::: ::::: ::: :::: :: ::::: b34643 GCAAACCTTGAAGAAGCTTATATTTTAATAACAGACAAGAAAATTACTAACATACAAGAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: :::::::::::::: :::::::: : :: :: : :::::::: :: b34643 ATACTTCCAATACTTGAGCAAATTGTTCAACAAGGAAGAAAGCTACTTATAATAGCTGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::::: ::::: :: :: :::::::: ::::::: :::: :::::::::::::::::: b34643 GATATCGAAGGTGAAGCATTAGCTACACTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT :: :: : :::: b34643 TGCGTAGCTGTT 550


>>b19258 AESA01000076 Clostridium botulinum C str. Stock  (552 nt)
 initn: 1726 init1: 1726 opt: 1756  Z-score: 77.4  bits: 24.1 E(): 3.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1756; 79.9% identity (79.9% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::::::::::::::::::: : :: ::::: ::: :::: ::: b19258 GCTACATTACTTGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGATTAAAGAATGTTACAGCAGGGGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :: :: ::::: :: :::::::: ::::: :::: :: :::::: :::: b19258 AATCCAATGCTAATTAGAAAAGGAATAAAATTAGCTGTTGATACTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: :: :::::::::: :::: :: b19258 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATCGCAAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: ::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::::: :::::::::::: b19258 GCTGCAGATCCTGAAATCGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAGAGAGTAGGAAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: :::::::: :: : :::: ::: :::::::::::::::::: b19258 GGAGTTATTACTGTAGAAGAGTCAAATACAATGGCAACAGAACTTGAAGTTGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: ::::::::::: :::::: b19258 ATGCAATTTGACAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATGCAGAAAAGATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: ::: ::: : ::::::: : :::: ::::: :: :: ::::: :::::: b19258 GCTGTATTAGAAAATGCATATATACTTTTAACTGATAAAAAAATAAGCAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::::: ::::: :::::::: b19258 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAACTATTAATTATAGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: :::::::: :::::::: :::: :::::::::::::::::: b19258 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :: b19258 TGTGTAGCAGTA 550


>>b10980 NZ_ABDQ01000002 Clostridium botulinum C str. Ek  (552 nt)
 initn: 1708 init1: 1708 opt: 1752  Z-score: 77.3  bits: 24.1 E(): 3.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1752; 79.7% identity (79.7% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::: :: :::::::::::: : ::::: :::::: :::::::: b10980 GCTACATTACTTGCTCAAGCAATCATAAGAGAAGGATTAAAAAACGTAACAGCAGGTGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :: ::::: ::::::::::: ::::: ::: :::::::::::: :: :::::: :::: b10980 AACCCAATGCTTATAAGAAAAGGTATTAAAGTGGCTGTAGATATTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: ::: : :::::::: :::: :: b10980 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATAGCTAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: :::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::: :: :: :: :: ::: b10980 GCTGCTGATCCTGAAATAGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAAAAAGTGGGCAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: ::::: :: :: : :::: :: ::::::::::::::::: b10980 GGGGTTATCACTGTAGAAGAATCAAATACAATGGCTACAGAACTTGAAGTTGTTGAAGGA 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: ::::::: :: ::::: :: :::::::::::::::::: b10980 ATGCAATTTGATAGAGGATATTTAAGTCCTTACATGGTAACAGATGCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: :: : ::: : :::::::: : :::: ::::: ::::: :::::: :::::: b10980 GCTGCACTAGAAAATCCATATATACTTTTAACTGATAAAAAGATAAGTAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::: : ::::: :: ::::: b10980 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAATTATTAATTATTGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: ::::::::::::::::: :::: :::::::::::::::::: b10980 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :::: b10980 TGTGTAGCTGTT 550


>>b29861 LITR01000001 Clostridium  autoethanogenum  JA1-  (552 nt)
 initn: 1708 init1: 1708 opt: 1747  Z-score: 77.1  bits: 24.1 E(): 3.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1747; 79.7% identity (79.7% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: ::: : : :::::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: :: b29861 GCTACTTTACTTGCTCAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: ::::::::: : :::::::: ::::::::::::: :: :: :::::::: b29861 AATCCAATGCTTATAAGACAAGGTATAAAGATGGCTGTAGATAAAGCTGTAGAAGAAATA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: : :: : :: :::::: :: :: :::: ::: ::::: :::: : :: :: b29861 AAAAAAGTTTCAACAACTGTAAAGGGAAAAGAAGATATAGCAAGAATTGCAGCTATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA ::: :::: :: : :: : : ::::::::::: ::::: :::::::: :: ::: b29861 GCTTCTGATGAAGAAATAGGTAAATTAATAGCTGATGCCATGGAAAAGGTAGGTAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT ::::: ::::: ::::::::::: :: : ::::: :::: : :: :: ::::::::: b29861 GGTGTCATAACTGTTGAAGAGTCAAAAACTATGGGAACTGAGTTAGATGTAGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::: ::::: ::: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: b29861 ATGCAGTTTGACAGAGGTTATTTAAGTCCATATATGGTTACTGATTCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: :: : ::::: :::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::::::::: b29861 GCTGCAATAGAAGATCCATATATATTAATAACAGACAAGAAGATATCAAATATTCAAGAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG ::: : :: : :::::: :::: :: :::::::: ::::: : : :::::::: :: b29861 ATATTACCATTACTTGAGAAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAGTTACTTATAATAGCTGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::: :::::::::: :: : :: :::::::::::::::: ::::::::::::::::: b29861 GATGTAGAAGGAGAAGCACTTGCAACTTTAGTTGTAAATAAGTTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :: b29861 TGTGTAGCAGTA 550


>>b14410 NZ_ACSJ01000001 Clostridium botulinum D str. 18  (552 nt)
 initn: 1717 init1: 1717 opt: 1747  Z-score: 77.1  bits: 24.1 E(): 3.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1747; 79.7% identity (79.7% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: :: : : :::::::::::::::::::::::: : :: ::::: ::: :::: ::: b14410 GCTACATTACTTGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGATTAAAGAATGTTACAGCAGGGGCT 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: :: :: ::::: :: :::::::: ::::: :::: :: :::::: :::: b14410 AATCCAATGCTAATTAGAAAAGGAATAAAATTAGCTGTTGATACTGCTGTTGAACAAATT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: ::: ::: : :: :::: :: :::: :: :::::::::: :::: :: b14410 AAAAAATCATCAAAACAAGTTGATGGAAAAGAAGATATCGCAAGAGTTGCTGCAATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA :::: ::: : : : ::: : : ::::: ::::::::::::: :::::::::::: b14410 GCTGCAGATCCTGAAATCGGAAAATTAATAGCAGATGCTATGGAGAGAGTAGGAAATGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT :: ::::: :: :: :::::::: :: : :::: ::: :::::::: ::::::::: b14410 GGGGTTATTACTGTAGAAGAGTCAAATACAATGGCAACAGAACTTGAAGTGGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::::::::: ::::::::: :::::::::::::::: :: ::::::::::: :::::: b14410 ATGCAATTTGACAGAGGATATTTAAGTCCATATATGGTAACAGATGCAGAAAAGATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: ::: ::: : ::::::: : :::: ::::: :: :: ::::: :::::: b14410 GCTGTATTAGAAAATGCATATATACTTTTAACTGATAAAAAAATAAGCAATATACAAGAA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG :::::::: :: ::::: ::::: :: :::::::: :::::::: ::::: :::::::: b14410 ATACTTCCAATACTTGAACAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAACTATTAATTATAGCAGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA :::::::::::::: :: :::::::: :::::::: :::: :::::::::::::::::: b14410 GATATAGAAGGAGAAGCATTAGCTACATTAGTTGTTAATAAATTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :: b14410 TGTGTAGCAGTA 550


>>b29924 NZ_LITR01000001 Clostridium  autoethanogenum JA  (552 nt)
 initn: 1708 init1: 1708 opt: 1747  Z-score: 77.1  bits: 24.1 E(): 3.2e+02
banded Smith-Waterman score: 1747; 79.7% identity (79.7% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)

10 20 30 40 50 60 b19587 GCAACTGTTTTAGCTCAAGCTATAATAAGAGAAGGACTTAAAAATGTAACATCAGGTGCT :: ::: : : :::::::: ::::::::::::::: : :::::::: ::: : :: :: b29924 GCTACTTTACTTGCTCAAGCAATAATAAGAGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b19587 AATCCAATACTTATAAGAAATGGTATAAAATTGGCTGTAGATAAGGCAGTTGAAGAAATC :::::::: ::::::::: : :::::::: ::::::::::::: :: :: :::::::: b29924 AATCCAATGCTTATAAGACAAGGTATAAAGATGGCTGTAGATAAAGCTGTAGAAGAAATA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b19587 AAAAAACTATCTAAAAATGTAAATGGTAAGCAAGACATATCAAGAGTTGCGTCAATTTCT :::::: : :: : :: :::::: :: :: :::: ::: ::::: :::: : :: :: b29924 AAAAAAGTTTCAACAACTGTAAAGGGAAAAGAAGATATAGCAAGAATTGCAGCTATATCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b19587 GCTGGTGATTCAGGTGTTGGAGAGCTTATAGCTGATGCTATGGAGAAGGTAGGAAATGAA ::: :::: :: : :: : : ::::::::::: ::::: :::::::: :: ::: b29924 GCTTCTGATGAAGAAATAGGTAAATTAATAGCTGATGCCATGGAAAAGGTAGGTAACGAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b19587 GGTGTTATAACAGTTGAAGAGTCTAAGAATATGGAAACTAGCCTTGAAGTTGTTGAAGGT ::::: ::::: ::::::::::: :: : ::::: :::: : :: :: ::::::::: b29924 GGTGTCATAACTGTTGAAGAGTCAAAAACTATGGGAACTGAGTTAGATGTAGTTGAAGGT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b19587 ATGCAATTTGAAAGAGGATATATAAGTCCATATATGGTTACTGATGCAGAAAAAATGGAA ::::: ::::: ::::: ::: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::: b29924 ATGCAGTTTGACAGAGGTTATTTAAGTCCATATATGGTTACTGATTCAGAAAAAATGGAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b19587 GCATCATTGGAAGACCCATATATTTTAATAACAGATAAGAAGATTTCTAATATTCAAGAA :: :: : ::::: :::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::::::::: b29924 GCTGCAATAGAAGATCCATATATATTAATAACAGACAAGAAGATATCAAATATTCAAGAT 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b19587 ATACTTCCTATTCTTGAGCAAATTGTACAACAAGGGAAGAAACTTTTAATAATAGCAGAG ::: : :: : :::::: :::: :: :::::::: ::::: : : :::::::: :: b29924 ATATTACCATTACTTGAGAAAATAGTTCAACAAGGAAAGAAGTTACTTATAATAGCTGAA 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b19587 GATATAGAAGGAGAGGCGTTAGCTACTTTAGTTGTAAATAGATTAAGAGGAACATTTACA ::: :::::::::: :: : :: :::::::::::::::: ::::::::::::::::: b29924 GATGTAGAAGGAGAAGCACTTGCAACTTTAGTTGTAAATAAGTTAAGAGGAACATTTACT 490 500 510 520 530 540 550 b19587 TGTGTTGGTGTT ::::: : :: b29924 TGTGTAGCAGTA 550


>>b1288 NC_003030 Clostridium acetobutylicum ATCC 824     (552 nt)
 initn: 1676 init1: 1676 opt: 1743  Z-score: 77.1  bits: 24.1 E(): 3.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1743; 79.5% identity (79.5% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)

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>>b18653 CP002118 Clostridium acetobutylicum EA 2018      (552 nt)
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>>b116 M74572 Clostridium acetobutylicum DSM 1731         (552 nt)
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552 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]