FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 35.03 Feb. 18, 2008 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b18882
1>>>b18882 552 nt - 552 nt Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences 10433008 residues in 18820 sequences Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0026; K=1.02e-05 (cen=941) Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized] Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6 join: 51, opt: 36, open/ext: -12/-4, width: 16 Scan time: 2.280
The best scores are: opt bits E(18820) b28251 NC_022606 Carnobacterium inhibens sub ( 552) [f] 2346 25.4 1.3e+02 align b28254 CP006812 Carnobacterium inhibens subs ( 552) [f] 2346 25.4 1.3e+02 align b29519 FXBJ01000002 Carnobacterium iners LMG26 ( 552) [f] 1837 23.5 4.8e+02 align b813 AF245676 Enterococcus saccharolyticus ATC ( 552) [f] 1828 23.5 4.9e+02 align b26562 ASWN01000003 Enterococcus saccharolytic ( 552) [f] 1828 23.5 4.9e+02 align b16882 GU911352 Carnobacterium divergens ATCC ( 552) [f] 1801 23.4 5.2e+02 align b827 AF245669 Enterococcus rattus 2705-87 2705 ( 552) [f] 1797 23.4 5.3e+02 align b18051 HM103915 Granulicatella elegans NTUH_41 ( 552) [f] 1797 23.4 5.3e+02 align b30197 NZ_FOXW01000005 Desemzia incerta DSM ( 552) [f] 1796 23.3 5.3e+02 align b18234 AEBK01000031 Enterococcus faecalis TX13 ( 552) [f] 1783 23.3 5.5e+02 align b32663 OGVA01000005 Carnobacterium divergens ( 552) [f] 1783 23.3 5.5e+02 align b3390 AY123697 Granulicatella elegans ATCC 700 ( 552) [f] 1779 23.3 5.6e+02 align b15302 GG703807 Granulicatella elegans ATCC 70 ( 552) [f] 1779 23.3 5.6e+02 align b18052 HM103914 Granulicatella elegans ATCC 70 ( 552) [f] 1779 23.3 5.6e+02 align b26566 ASVV01000001 Enterococcus caccae EnGen0 ( 552) [f] 1774 23.3 5.6e+02 align b17928 AEBY01000031 Enterococcus faecalis TX01 ( 552) [f] 1774 23.3 5.6e+02 align b22920 JQ999956 Enterococcus sp. PPC15 ( 552) [f] 1770 23.3 5.7e+02 align b34454 NGKB01000001 Vagococcus carniphilus SS1 ( 552) [f] 1770 23.3 5.7e+02 align b26678 JQ999956 Enterococcus eurekensis PPC15 ( 552) [f] 1770 23.3 5.7e+02 align b20059 JQ038128 Enterococcus eurekensis PC4B C ( 552) [f] 1770 23.3 5.7e+02 align
>>>b18882, 552 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::: ::::::::::::::::: ::::::::::: :: ::::: : :: :::::::::
b16882 GGCGTGATTACAATTGAAGAATCAAAAGGAATCGAGACCGAATTGGACGTTGTTGAAGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::: ::::: :: : :::::::: ::::::::::: :: ::::::::::::
b16882 ATGCAATTTGACCGTGGGTATTTATCTCAATATATGGTAACAGACAATGATAAAATGGAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: :::::::: :: ::: :::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::
b16882 GCTGTTTTAGAAAATCCATATGTTTTGATTACAGATAAAAAAATTTCAAATATTCAAGAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: : ::::: :::::::::::: :::::::::: :::::::::::::: ::::: :::
b16882 GTCTTGCCTTTGTTGGAACAAATTCTACAACAAGGTCGTCCATTGTTGATTATTGCGGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::: ::::: : :::::: : :: :: ::::::::::: :: :: ::::::
b16882 GATGTGGATGGTGAAGCCTTACCAACACTTGTTTTAAATAAATTACGCGGTACGTTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
::::: :::::
b16882 GTTGTTGCAGTC
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:: ::::::::::::::::: :::::::: ::::: :: :::::::::::::: :: ::
b827 GCGACTGTTTTAACTCAAGCAATCGTTCGTGAAGGTTTAAAAAATGTAACAGCAGGCGCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
::::: : :: :::::::: ::::: :: : ::::::: :: :: ::::::::::::
b827 AATCCTCTAGGCATTCGCCGTGGAATTGAGCTAGCAACAAAAGCAGCAGTAGAAGAATTG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: : ::: :: : :::: :::: :::::: : ::::: ::: : :: ::: :::::
b827 CATAATATCTCAACTGTAGTAAACTCTAAAGAAGCGATTGCTCAAGTAGCCGCTGTTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:: :: :: :: :::: : ::: :::: :: ::::::::: :: :::: :::
b827 TCTGGCTCAGATAAAGTAGGACACTTGATTGCCGATGCAATGGAAAAAGTCGGAAATGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
:: :: :: :::::::::::::: :::::::::::::::::::::: ::::::::::::
b827 GGAGTCATCACAATTGAAGAATCAAAAGGAATCGAAACAGAATTAGATGTAGTTGAAGGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::: ::::: ::: : :: ::::: ::::: :: :: :: ::::::::::::
b827 ATGCAATTTGACCGTGGCTACTTGTCACAATATATGGTGACTGACAATGATAAAATGGAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: :::::::: :: ::::: :: ::::: ::::: :::::::: :: :::::::::
b827 GCCGTTTTAGAAAATCCATATATCTTAATTACAGATAAGAAAATCTCTAACATTCAAGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: : :: :: :: :: :::::::::::::: :::::::::::: :::::::: :::
b827 ATTTTGCCATTGTTAGAGCAAATTTTACAACAGTCACGTCCATTGTTAATCATTGCCGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: :: :: ::::: :::::::: ::::::::::::::: : :::::::::::::::
b827 GATGTGGACGGCGAAGCACTTCCAACGTTAGTATTGAATAAAATTCGTGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: :::::::::
b827 GTCGTAGCAGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
::::: :::::::: ::::: :: ::::: :::::::: :::::::: ::::: :: ::
b18051 GCAACAGTTTTAACGCAAGCAATTGTTCGTGAAGGATTAAAAAATGTTACAGCAGGGGCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:::::::: :: ::::: :: :: :: ::: : :::::: : : :::::::::::::::
b18051 AATCCAGTAGGTATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCAACACGTGCTGCTGTAGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::::: ::::::::: ::::::::::: : :: :::::::::
b18051 CACAAAATTTCTCGTCCGGTAGAATCAAAAGAAGCAATTGCACAAGTAGCAGCTATTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:: :: : ::: :: :: ::::::::::::::::: :: :::: :::
b18051 TCTGGTTCTCAAGAAGTCGGTAGTTTAATTGCAGAAGCAATGGAAAAAGTAGGAAACGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::: ::: :: :::::
b18051 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGGATTGAAACAGAATTAGATGTTGTAGAAGGT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::::::::: ::: : :::::::: :::::::: ::::::::::::::::
b18051 ATGCAATTTGATCGTGGATACTTATCTCAATATATGGTAACTGATAACGATAAAATGGTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: : ::::: :: :: : :::::: ::::: ::::::::: : :: ::::::::::::
b18051 GCTCATTTAGATAATCCATTTATTTTAATTACAGATAAAAAAGTTTCTAATATTCAAGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: :::: ::::: ::::::::: : :::::::: ::: :::: :: :: ::::: :::
b18051 ATTATTCCATTATTAGAACAAATTGTTCAACAAGGTCGTGCATTATTAATTATTGCGGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
:: :: ::::::::::: : ::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::
b18051 GACGTAGATGGAGAAGCATTACCAACATTAGTTTTAAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: :: :: :::
b18051 GTAGTTGCTGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:: ::::::::::: ::::: :::::::: :::::::: ::::: :: ::::::::::::
b30197 GCGACTGTTTTAACACAAGCAATCGTTCGTGAAGGATTAAAAAACGTTACAGCTGGAGCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:: ::::: :: ::::: :: :: ::: ::::::: : ::: :: :: :::::::
b30197 AACCCAGTAGGAATTCGTACGGGTATTGAATTGGCAACTAAAGTAGCCGTTAAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :: : :::: :::::::: :::::::::: ::: ::::::::::::: ::::::
b30197 TTGGCGAATTCTCGTAAAGTAGAAACAAAAGAATCGATTTCACAAATTGCTGCCATTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230
b18882 TC--AGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAG
:: ::: ::: :::: ::: :::: : ::::: :: :::::: :: :: : :
b30197 TCTGGGGATGCA--GAAATCGGAAAATTATTGGCAGATGCTATGGAAAAAGTAGGTAACG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
b18882 ATGGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAG
: :: ::::: :: ::::::::::::::::: :: ::::: ::::::: ::: :::::::
b30197 ACGGTGTTATCACTATTGAAGAATCTAAAGGTATTGAAACGGAATTAGATGTCGTTGAAG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
b18882 GAATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGG
: ::::::::::: ::::::::: : :: :::::::::::::: :: :: ::::::::::
b30197 GTATGCAATTTGACCGTGGTTACTTGTCACAATACATGGTAACTGACAATGATAAAATGG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
b18882 AAGCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAG
:::: ::::::::::: :: :: :: ::::: :: :: ::::::::::: ::::::::::
b30197 AAGCTAACTTAGAAAATCCATACATCTTGATCACAGACAAAAAAATCTCTAATATTCAAG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
b18882 AAGTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTG
: ::::::: :::::::::::::: :: :::::::: :::::::::::::: :::::::
b30197 ATATTCTTCCATTATTGGAACAAATCTTGCAACAAGGTCGTCCATTGTTGATTATTGCTG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
b18882 ATGATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTA
: ::::: :: :: ::::: : ::::: :::::::::: :::::::: :: :::::::
b30197 AAGATGTAGACGGCGAAGCATTGCCAACTCTAGTATTGAACAAATTACGCGGTACATTTA
480 490 500 510 520 530
540 550
b18882 ATGTTGTAGCAGTT
:::: : :::::
b30197 ATGTAGCTGCAGTA
540 550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:: :::::::: :: ::::: :: ::::: ::::: :: ::::: ::::: :::::::::
b18234 GCGACTGTTTTGACACAAGCCATTGTTCGTGAAGGCTTAAAAAACGTAACTGCTGGAGCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:: ::: : :: ::::: :: :: :: ::: : ::::::: : : :: :::::::::::
b18234 AACCCATTAGGTATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCAACAAAAATAGCAGTAGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::: :: ::::::::: : ::::::::: : :::::: ::::
b18234 CACAATATTTCATCTGTAGTTGATTCAAAAGAAGCGATTGCACAAGTCGCTGCTGTTTCA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
::::: : :: :: :::: :::: :: ::::::::: ::::: : :::
b18234 TCAGGTTCTGAAAAAGTCGGCCAATTAATTGCTGATGCAATGGAAAAAGTTGGTAACGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::: ::::: ::::::::::: ::::: :: ::::::::::::: ::: :::::::::
b18234 GGCGTAATTACCATTGAAGAATCAAAAGGGATTGAAACAGAATTAGATGTGGTTGAAGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
:::::::: :: :: ::::: : :::::::::::::: :: :: :::::::::::::::
b18234 ATGCAATTCGACCGCGGTTATTTATCTCAATACATGGTTACTGACAACGATAAAATGGAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: :::::::: :: ::::: :: :::::::: :::::::::::::::::::::::
b18234 GCTGTTTTAGAAAATCCATATATCTTAATTACCGACAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
: : :::::::: ::::::::: :::::::: : :::::: : ::::::::::: :::
b18234 ATCTTACCTTTATTAGAACAAATTCTACAACAAAGCCGTCCACTATTGATCATTGCGGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::: : ::::: :::::::::
b18234 GATGTTGATGGAGAAGCTCTACCAACATTAGTATTGAACAAAATCCGTGGTACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
::::: :::::
b18234 GTTGTCGCAGTA
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:: ::::::::::: ::::: :: ::::: :::::::: :::::::: :: :: ::::::
b32663 GCGACTGTTTTAACACAAGCAATTGTTCGAGAAGGATTAAAAAATGTTACTGCAGGAGCT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:: :: ::::: ::::: :: :: :: ::: ::::::: : :: :: :: ::::::::
b32663 AACCCCGTTGGCATTCGTCGTGGGATTGAATTGGCAACGAAAGCAGCAGTTGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: ::: ::::: ::: ::: :: ::::::::: : ::::::::: : :: :: ::::::
b32663 CATGCGATTTCAAAAGTAGTCGATTCAAAAGAAGCGATTGCACAAGTAGCAGCCATTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:: :: : :::: :: ::: : :::::::: :::::: ::::: : ::
b32663 TCTGGTGATGACGAAATTGGTTCATTAATCGCAGAAGCTATGGAAAAAGTTGGCAATGAC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::: ::::::::::::::::: ::::::::::: :: ::::: : :: :::::::::
b32663 GGCGTGATTACAATTGAAGAATCAAAAGGAATCGAGACCGAATTGGACGTTGTTGAAGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::: ::::: :: : :::::::: ::::::::::: :: :: :::::::::
b32663 ATGCAATTTGACCGTGGGTATTTATCTCAATATATGGTAACAGACAATGACAAAATGGAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: :::::::: :: ::: :::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
b32663 GCTGTTTTAGAAAATCCATATGTTTTGATTACAGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: : ::::: ::::::::::::::::::::::: ::::: :::::::: ::::: :::
b32663 GTCTTGCCTTTGTTGGAACAAATTTTACAACAAGGTCGTCCGTTGTTGATTATTGCGGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::: ::::: : ::::: : :: :: ::::::::::: :: :: ::::::
b32663 GATGTGGATGGGGAAGCCTTACCAACCCTTGTTTTAAATAAATTACGCGGTACGTTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
::::: :::::
b32663 GTTGTTGCAGTC
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
::::: :::::::: ::::: :: ::::: :::::::: :::::::: :: :: :: ::
b3390 GCAACAGTTTTAACACAAGCAATTGTTCGTGAAGGATTAAAAAATGTTACTGCAGGTGCA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:::::::: :: ::::: :: :: :: ::: : :: ::: : : :::::::::::: ::
b3390 AATCCAGTAGGCATTCGTCGTGGTATTGAATTAGCGACACGTGCTGCTGTAGAAGAGTTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::::: ::::::::: : ::::: ::: : :: :::::::::
b3390 CACAAAATTTCTCGCCCTGTAGAATCAAAAGAAGCGATTGCGCAAGTAGCAGCTATTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:::::: : ::: :: :: ::::::::::::::::: :: :: : :::
b3390 TCAGGATCTCAAGAAGTCGGTAGTTTAATTGCAGAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAACGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::::::::::::::: :::::::: ::::::::::::: ::: :: ::::::
b3390 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCAAAAGGAATTGAAACAGAATTAGATGTTGTAGAAGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::::::::: ::: : :::::::: :::::::::::::: ::::::::::
b3390 ATGCAATTTGATCGTGGATACTTATCTCAATATATGGTAACAGATAATGATAAAATGGTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: : ::::: :: :: : :::::: ::::: ::::::::: : :: ::::::::::::
b3390 GCTCATTTAGATAATCCATTTATTTTAATTACAGATAAAAAAGTTTCTAATATTCAAGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: :::: ::::: :::::::: : :::::::: ::: :::: :: :: ::::: :::
b3390 ATTATTCCATTATTAGAACAAATCGTTCAACAAGGTCGTGCATTATTAATTATTGCAGAT
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
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b3390 GATGTAGATGGAGAAGCATTACCAACATTAGTTTTAAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
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550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
b3390 GTAGTAGCGGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
::::: :::::::: ::::: :: ::::: :::::::: :::::::: :: :: :: ::
b15302 GCAACAGTTTTAACACAAGCAATTGTTCGTGAAGGATTAAAAAATGTTACTGCAGGTGCA
10 20 30 40 50 60
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b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:::::::: :: ::::: :: :: :: ::: : :: ::: : : :::::::::::: ::
b15302 AATCCAGTAGGCATTCGTCGTGGTATTGAATTAGCGACACGTGCTGCTGTAGAAGAGTTA
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::::: ::::::::: : ::::: ::: : :: :::::::::
b15302 CACAAAATTTCTCGCCCTGTAGAATCAAAAGAAGCGATTGCGCAAGTAGCAGCTATTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:::::: : ::: :: :: ::::::::::::::::: :: :: : :::
b15302 TCAGGATCTCAAGAAGTCGGTAGTTTAATTGCAGAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAACGAT
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::::::::::::::: :::::::: ::::::::::::: ::: :: ::::::
b15302 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCAAAAGGAATTGAAACAGAATTAGATGTTGTAGAAGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::::::::: ::: : :::::::: :::::::::::::: ::::::::::
b15302 ATGCAATTTGATCGTGGATACTTATCTCAATATATGGTAACAGATAATGATAAAATGGTT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: : ::::: :: :: : :::::: ::::: ::::::::: : :: ::::::::::::
b15302 GCTCATTTAGATAATCCATTTATTTTAATTACAGATAAAAAAGTTTCTAATATTCAAGAA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: :::: ::::: :::::::: : :::::::: ::: :::: :: :: ::::: :::
b15302 ATTATTCCATTATTAGAACAAATCGTTCAACAAGGTCGTGCATTATTAATTATTGCAGAT
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::::::::: : ::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::
b15302 GATGTAGATGGAGAAGCATTACCAACATTAGTTTTAAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
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550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
b15302 GTAGTAGCGGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
::::: :::::::: ::::: :: ::::: :::::::: :::::::: :: :: :: ::
b18052 GCAACAGTTTTAACACAAGCAATTGTTCGTGAAGGATTAAAAAATGTTACTGCAGGTGCA
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:::::::: :: ::::: :: :: :: ::: : :: ::: : : :::::::::::: ::
b18052 AATCCAGTAGGCATTCGTCGTGGTATTGAATTAGCGACACGTGCTGCTGTAGAAGAGTTA
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::::: ::::::::: : ::::: ::: : :: :::::::::
b18052 CACAAAATTTCTCGCCCTGTAGAATCAAAAGAAGCGATTGCGCAAGTAGCAGCTATTTCT
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:::::: : ::: :: :: ::::::::::::::::: :: :: : :::
b18052 TCAGGATCTCAAGAAGTCGGTAGTTTAATTGCAGAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAACGAT
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::::::::::::::: :::::::: ::::::::::::: ::: :: ::::::
b18052 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCAAAAGGAATTGAAACAGAATTAGATGTTGTAGAAGGA
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b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::::::::: ::: : :::::::: :::::::::::::: ::::::::::
b18052 ATGCAATTTGATCGTGGATACTTATCTCAATATATGGTAACAGATAATGATAAAATGGTT
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b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: : ::::: :: :: : :::::: ::::: ::::::::: : :: ::::::::::::
b18052 GCTCATTTAGATAATCCATTTATTTTAATTACAGATAAAAAAGTTTCTAATATTCAAGAA
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b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: :::: ::::: :::::::: : :::::::: ::: :::: :: :: ::::: :::
b18052 ATTATTCCATTATTAGAACAAATCGTTCAACAAGGTCGTGCATTATTAATTATTGCAGAT
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::::::::: : ::::::::::: :: ::::::::::::::::::::::::
b18052 GATGTAGATGGAGAAGCATTACCAACATTAGTTTTAAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
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550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
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550
10 20 30 40 50 60
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::::: ::::: :: ::::: :: :: :: :::::::::::::: ::::: ::::: :::
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:::::: : :::::::: :: ::::::::: : ::::::: : :::::: ::::::::
b26566 AATCCATTAGGGATTCGTCGTGGAATCGAATTAGCAACAAAAACTGCTGTTGAAGAATTA
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: ::::: : :: :::::::::::: :::: :: ::: :::: :: :::::
b26566 CACAACATTTCAACTGTTGTTGACTCAAAAGAAGCAATCGCTCAAGTTGCGGCCGTTTCT
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:: :: : ::: ::::: ::::::: ::::::::: ::::: : ::
b26566 TCTGGTGATGAACGTGTTGGACAATTGATTGCAGATGCAATGGAAAAAGTTGGTAATGAC
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
:: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::::: ::: ::::::::
b26566 GGTGTTATTACTATTGAAGAATCAAAAGGAATCGAAACAGAATTAGATGTTGTTGAAGGT
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b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::: :: ::::: : :::::::: :::::::: :: :::::::::::::::
b26566 ATGCAATTTGACCGCGGTTATTTATCTCAATATATGGTAACTGACAACGATAAAATGGAA
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:: :::::::: :: ::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::::::
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b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
: : ::::::::::::::::::::::::::: : :: ::::: :: :::::::: :::
b26566 ATCTTACCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAAGTCGCCCATTATTAATCATTGCAGAT
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
:::::::: :::::::: : ::::::::::: :: :: ::: : ::::::::::: ::
b26566 GATGTTGACGGAGAAGCATTACCAACATTAGTTTTAAACAAAATTCGTGGAACATTCAAC
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550
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::::: :: ::
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550
10 20 30 40 50 60
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:: :::::::: :: ::::: :: ::::: ::::: :: ::::: ::::: :::::::::
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:: ::: : :: ::::: :: :: :: ::: : ::::::: : :: :::::::::::
b17928 AACCCATTAGGTATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCAACAAAAACAGCAGTAGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: :::::: ::: :: ::::::::: : ::::::::: : :::::: ::::
b17928 CACAATATTTCATCTGTAGTTGATTCAAAAGAAGCGATTGCACAAGTCGCTGCTGTTTCA
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b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
::::: : :: :: :::: :::: :: ::::::::: ::::: : :::
b17928 TCAGGTTCTGAAAAAGTCGGCCAATTAATTGCTGATGCAATGGAAAAAGTTGGTAACGAT
190 200 210 220 230 240
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::::: ::::: ::::::::::: ::::: :: ::::::::::::: ::: :::::::::
b17928 GGCGTAATTACCATTGAAGAATCAAAAGGGATTGAAACAGAATTAGATGTGGTTGAAGGA
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:::::::: :: :: ::::: : :::::::::::::: :: :: :::::::::::::::
b17928 ATGCAATTCGACCGCGGTTATTTATCTCAATACATGGTTACTGACAACGATAAAATGGAA
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b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
:: :::::::: :: ::::: :: :::::::: :::::::::::::::::::::::
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: : :::::::: ::::::::: :::::::: : :::::: : ::::::::::: :::
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:::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::: : ::::: :::::::::
b17928 GATGTTGATGGAGAAGCTCTACCAACATTAGTATTGAACAAAATCCGTGGTACATTTAAT
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550
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::::: :::::
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550
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:::::::::::::: ::::: :: ::::: :::::: ::::::: :: :::::::: ::
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:::::: : :: ::::: :: :: :: ::: : :: :: ::: :: :: ::::::::
b22920 AATCCATTAGGCATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCGACTCAAGTAGCAGTTGAAGAATTA
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: ::: :::::: :::::: :: :::::::: :::::::: ::: ::: ::: :::::
b22920 CATGCAATTTCTGCAAAAGTTGATTCAAAAGATTCAATTGCTCAAGTTGGTGCAGTTTCT
130 140 150 160 170 180
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b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
::::: ::: : :: :: ::: ::::::: ::::::::: ::::: : :::
b22920 TCAGGTAGCGAACAAGTTGGTCAATACATTGCAGATGCAATGGAAAAAGTTGGCAACGAT
190 200 210 220 230 240
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: ::::::: ::: ::::::::
b22920 GGCGTTATTACTATTGAAGAATCTAAAGGAATTGAAACTGAATTAGATGTCGTTGAAGGG
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:::::::::::::::::::: : :: :::::::::::::: : :::::::::::: ::
b22920 ATGCAATTTGATCGTGGTTATTTATCACAATACATGGTAACCAACAACGATAAAATGCAA
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::: : : ::: :: ::::: :: ::::: ::::::::::::::::::::::::::
b22920 GCAGAACTTGAAGCACCATATATCTTAATTACGGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAT
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:: : :::::::: :: :::::::::::: : ::::: :: ::::::::::::
b22920 ATTTTACCTTTATTAGAGCAAATTTTACAAGCTTCAAAACCATTATTAATCATTGCTGAT
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::: ::::: : ::::::::::: :: :: ::: : :::::::::::::::
b22920 GATGTAGATGGCGAAGCATTGCCAACATTAGTCTTAAACAAAATCCGTGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
b22920 GTGGTAGCGGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
::::::::::::::::::::::: :: :: :::::: : ::::: :: :::::::::::
b34454 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATTGTGCGTGAAGGACTTAAAAACGTTACAGCTGGAGCA
10 20 30 40 50 60
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b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:: ::: : :: :::::::::::::: ::: : ::::: : : ::::: ::::::::
b34454 AACCCAATCGGAATTCGCCGCGGAATTGAATTAGCAACTAAAAAAGCTGTTGAAGAATTA
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: ::::::::::::: ::::::::::::::::: : :: ::::: :::::::: :::::
b34454 CATGCTATTTCTAAACAAGTAGACTCAAAAGAAGCTATCTCACAAGTTGCTGCTGTTTCT
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b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
:: :: ::: : : :: ::::: : : ::::: :::::: ::::: : ::
b34454 TCTGGTAGCGAAACTATCGGTGAATTAATCTCTGAAGCGATGGAAAAAGTTGGTAATGAC
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b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
:: :::::::: ::::::::::::::::: :: ::::: ::::::: :::::::::::
b34454 GGTGTTATTACTATTGAAGAATCTAAAGGGATTGAAACTGAATTAGACGTAGTTGAAGGT
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b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
::::::::::: ::::: ::: : :: :::::::::::::: :::: ::::::::::::
b34454 ATGCAATTTGACCGTGGCTACTTGTCACAATACATGGTAACTGATACAGATAAAATGGAA
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b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
: :::::::: :::::: : :: ::::: ::::: ::::: ::::: :: :::::
b34454 ACTGTTTTAGAAAATCCTTATCTATTAATTACTGATAAGAAAATTTCAAACATCCAAGAT
370 380 390 400 410 420
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b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
: : :::::::: :::::::: ::::::::::: :: :: :: :: :::::::::
b34454 ATCTTACCTTTATTAGAACAAATCTTACAACAAGGTAAACCTTTATTAATTATTGCTGAT
430 440 450 460 470 480
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b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::::::::: :::::: : :::::::::::::: :: ::: : :: ::::::::::::
b34454 GATGTTGATGGGGAAGCTTTACCAACATTAGTATTAAACAAAATTCGCGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: : :: :::
b34454 GTAGCTGCTGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:::::::::::::: ::::: :: ::::: :::::: ::::::: :: :::::::: ::
b26678 GCAACTGTTTTAACCCAAGCAATTGTTCGTGAAGGAATGAAAAACGTTACAGCTGGTGCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:::::: : :: ::::: :: :: :: ::: : :: :: ::: :: :: ::::::::
b26678 AATCCATTAGGCATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCGACTCAAGTAGCAGTTGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
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b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: ::: :::::: :::::: :: :::::::: :::::::: ::: ::: ::: :::::
b26678 CATGCAATTTCTGCAAAAGTTGATTCAAAAGATTCAATTGCTCAAGTTGGTGCAGTTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
::::: ::: : :: :: ::: ::::::: ::::::::: ::::: : :::
b26678 TCAGGTAGCGAACAAGTTGGTCAATACATTGCAGATGCAATGGAAAAAGTTGGCAACGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: ::::::: ::: ::::::::
b26678 GGCGTTATTACTATTGAAGAATCTAAAGGAATTGAAACTGAATTAGATGTCGTTGAAGGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
:::::::::::::::::::: : :: :::::::::::::: : :::::::::::: ::
b26678 ATGCAATTTGATCGTGGTTATTTATCACAATACATGGTAACCAACAACGATAAAATGCAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
::: : : ::: :: ::::: :: ::::: ::::::::::::::::::::::::::
b26678 GCAGAACTTGAAGCACCATATATCTTAATTACGGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: : :::::::: :: :::::::::::: : ::::: :: ::::::::::::
b26678 ATTTTACCTTTATTAGAGCAAATTTTACAAGCTTCAAAACCATTATTAATCATTGCTGAT
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490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::: ::::: : ::::::::::: :: :: ::: : :::::::::::::::
b26678 GATGTAGATGGCGAAGCATTGCCAACATTAGTCTTAAACAAAATCCGTGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
b26678 GTGGTAGCGGTT
550
10 20 30 40 50 60
b18882 GCAACTGTTTTAACTCAAGCTATCGTTCGCGAAGGATTGAAAAATGTAACAGCTGGAGCT
:::::::::::::: ::::: :: ::::: :::::: ::::::: :: :::::::: ::
b20059 GCAACTGTTTTAACCCAAGCAATTGTTCGTGAAGGAATGAAAAACGTTACAGCTGGTGCG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
b18882 AATCCAGTTGGGATTCGCCGCGGAATCGAAATGGCAACAAGAGTTGCTGTAGAAGAATTG
:::::: : :: ::::: :: :: :: ::: : :: :: ::: :: :: ::::::::
b20059 AATCCATTAGGCATTCGTCGTGGGATTGAATTAGCGACTCAAGTAGCAGTTGAAGAATTA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
b18882 CTTGCTATTTCTAAAAAAGTAGACTCAAAAGAATCAATTGCACAAATTGCTGCTATTTCT
: ::: :::::: :::::: :: :::::::: :::::::: ::: ::: ::: :::::
b20059 CATGCAATTTCTGCAAAAGTTGATTCAAAAGATTCAATTGCTCAAGTTGGTGCAGTTTCT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
b18882 TCAGGAAGCAATGAAACAGGAGAATTGGTTGCAGAAGCAATGGAACGCGTTGGAACAGAT
::::: ::: : :: :: ::: ::::::: ::::::::: ::::: : :::
b20059 TCAGGTAGCGAACAAGTTGGTCAATACATTGCAGATGCAATGGAAAAAGTTGGCAACGAT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
b18882 GGCGTTATTACAATTGAAGAATCTAAAGGAATCGAAACAGAATTAGGTGTAGTTGAAGGA
::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: ::::::: ::: ::::::::
b20059 GGCGTTATTACTATTGAAGAATCTAAAGGAATTGAAACTGAATTAGATGTCGTTGAAGGG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
b18882 ATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCAATACATGGTAACAGATAACGATAAAATGGAA
:::::::::::::::::::: : :: :::::::::::::: : :::::::::::: ::
b20059 ATGCAATTTGATCGTGGTTATTTATCACAATACATGGTAACCAACAACGATAAAATGCAA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
b18882 GCAAACTTAGAAAACCCTTATATTTTGATTACCGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAA
::: : : ::: :: ::::: :: ::::: ::::::::::::::::::::::::::
b20059 GCAGAACTTGAAGCACCATATATCTTAATTACGGATAAAAAAATCTCAAATATTCAAGAT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
b18882 GTTCTTCCTTTATTGGAACAAATTTTACAACAAGGACGTCCATTGTTGATCATTGCTGAT
:: : :::::::: :: :::::::::::: : ::::: :: ::::::::::::
b20059 ATTTTACCTTTATTAGAGCAAATTTTACAAGCTTCAAAACCATTATTAATCATTGCTGAT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
b18882 GATGTTGATGGAGAAGCTCTTCCAACATTAGTATTGAATAAATTACGTGGAACATTTAAT
::::: ::::: ::::: : ::::::::::: :: :: ::: : :::::::::::::::
b20059 GATGTAGATGGCGAAGCATTGCCAACATTAGTCTTAAACAAAATCCGTGGAACATTTAAT
490 500 510 520 530 540
550
b18882 GTTGTAGCAGTT
:: ::::: :::
b20059 GTGGTAGCGGTT
550
>>b28251 NC_022606 Carnobacterium inhibens subsp. gili (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 2346; 91.7% identity (91.7% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b28254 CP006812 Carnobacterium inhibens subsp. gilic (552 nt)
initn: 2329 init1: 2329 opt: 2346 Z-score: 84.4 bits: 25.4 E(): 1.3e+02
banded Smith-Waterman score: 2346; 91.7% identity (91.7% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b29519 FXBJ01000002 Carnobacterium iners LMG26642 (552 nt)
initn: 1762 init1: 1762 opt: 1837 Z-score: 74.1 bits: 23.5 E(): 4.8e+02
banded Smith-Waterman score: 1837; 81.5% identity (81.5% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b813 AF245676 Enterococcus saccharolyticus ATCC 43076 (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 1828; 81.3% identity (81.3% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b26562 ASWN01000003 Enterococcus saccharolyticus ATCC (552 nt)
initn: 1828 init1: 1828 opt: 1828 Z-score: 73.9 bits: 23.5 E(): 4.9e+02
banded Smith-Waterman score: 1828; 81.3% identity (81.3% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b16882 GU911352 Carnobacterium divergens ATCC 35677 (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 1801; 80.8% identity (80.8% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b827 AF245669 Enterococcus rattus 2705-87 2705-87 (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 1797; 80.6% identity (80.6% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b18051 HM103915 Granulicatella elegans NTUH_4128 (552 nt)
initn: 1753 init1: 1753 opt: 1797 Z-score: 73.3 bits: 23.4 E(): 5.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1797; 80.6% identity (80.6% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b30197 NZ_FOXW01000005 Desemzia incerta DSM 20581 (552 nt)
initn: 1768 init1: 1768 opt: 1796 Z-score: 73.2 bits: 23.3 E(): 5.3e+02
banded Smith-Waterman score: 1796; 81.0% identity (81.0% similar) in 553 nt overlap (1-551:1-551)
>>b18234 AEBK01000031 Enterococcus faecalis TX1302 (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 1783; 80.4% identity (80.4% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b32663 OGVA01000005 Carnobacterium divergens MFPA43A (552 nt)
initn: 1756 init1: 1756 opt: 1783 Z-score: 73.0 bits: 23.3 E(): 5.5e+02
banded Smith-Waterman score: 1783; 80.4% identity (80.4% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b3390 AY123697 Granulicatella elegans ATCC 700633 (552 nt)
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banded Smith-Waterman score: 1779; 80.3% identity (80.3% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b15302 GG703807 Granulicatella elegans ATCC 700633 (552 nt)
initn: 1726 init1: 1726 opt: 1779 Z-score: 72.9 bits: 23.3 E(): 5.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1779; 80.3% identity (80.3% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b18052 HM103914 Granulicatella elegans ATCC 700633 (552 nt)
initn: 1726 init1: 1726 opt: 1779 Z-score: 72.9 bits: 23.3 E(): 5.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1779; 80.3% identity (80.3% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b26566 ASVV01000001 Enterococcus caccae EnGen0230 ATCC (552 nt)
initn: 1648 init1: 1648 opt: 1774 Z-score: 72.8 bits: 23.3 E(): 5.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1774; 80.2% identity (80.2% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b17928 AEBY01000031 Enterococcus faecalis TX0109 (552 nt)
initn: 1747 init1: 1747 opt: 1774 Z-score: 72.8 bits: 23.3 E(): 5.6e+02
banded Smith-Waterman score: 1774; 80.2% identity (80.2% similar) in 551 nt overlap (1-551:1-551)
>>b22920 JQ999956 Enterococcus sp. PPC15 (552 nt)
initn: 1738 init1: 1738 opt: 1770 Z-score: 72.7 bits: 23.3 E(): 5.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b34454 NGKB01000001 Vagococcus carniphilus SS1714 (552 nt)
initn: 1756 init1: 1756 opt: 1770 Z-score: 72.7 bits: 23.3 E(): 5.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b26678 JQ999956 Enterococcus eurekensis PPC15 (552 nt)
initn: 1738 init1: 1738 opt: 1770 Z-score: 72.7 bits: 23.3 E(): 5.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
>>b20059 JQ038128 Enterococcus eurekensis PC4B CCUG 6125 (552 nt)
initn: 1738 init1: 1738 opt: 1770 Z-score: 72.7 bits: 23.3 E(): 5.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1770; 80.1% identity (80.1% similar) in 552 nt overlap (1-552:1-552)
552 residues in 1 query sequences
10433008 residues in 18820 library sequences
Scomplib [35.03]
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]