/var/www/html/cpndb/fasta_results/b18733.fasta# /data/www/cpndb/fasta35 -E 200 -Q -m 6 -b 20 -d 20 -z 2 -H /data/www/cpndb/fasta_results/b18733 /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut
<pre>
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 35.03 Feb. 18, 2008
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

</pre>
Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b18733
<pre>
  1>>>b18733 555 nt - 555 nt
Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences

10433008 residues in 18820 sequences
Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0024;  K=1.105e-05 (cen=941)
Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized]
Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6
 join: 51, opt: 36, open/ext: -12/-4, width:  16
 Scan time:  2.090
</pre>
<p>
<hr>
<p>
<p><pre>

The best scores are:                                      opt bits E(18820)
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4995',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4995" target=_"blank">b4995</a> NC_005061 Candidatus Blochmannia florida ( 555) [f] 1834 22.8   8e+02 <A HREF="#b4995">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29843',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29843" target=_"blank">b29843</a> NZ_NASO01000009 Gilliamella sp. A-TSA1  ( 555) [f] 1776 22.6 9.1e+02 <A HREF="#b29843">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32596',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32596" target=_"blank">b32596</a> NZ_NASR01000003 Gilliamella  apis  A-TS ( 555) [f] 1776 22.6 9.1e+02 <A HREF="#b32596">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24363',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24363" target=_"blank">b24363</a> JQ269400 Buchnera aphidicola isolate Al ( 555) [f] 1749 22.5 9.7e+02 <A HREF="#b24363">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24338',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24338" target=_"blank">b24338</a> JQ269432 Buchnera aphidicola isolate Eg ( 555) [f] 1744 22.4 9.8e+02 <A HREF="#b24338">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32849',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32849" target=_"blank">b32849</a>  NZ_QGLN01000009 Gilliamella  apis  ESL ( 555) [f] 1740 22.4 9.9e+02 <A HREF="#b32849">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24350',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24350" target=_"blank">b24350</a> JQ269416 Buchnera aphidicola isolate Er ( 555) [f] 1731 22.4   1e+03 <A HREF="#b24350">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24354',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24354" target=_"blank">b24354</a> JQ269410 Buchnera aphidicola isolate 3  ( 555) [f] 1722 22.4   1e+03 <A HREF="#b24354">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32937',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32937" target=_"blank">b32937</a> NZ_QICT01000003 Gilliamella  apicola  D ( 555) [f] 1722 22.4   1e+03 <A HREF="#b32937">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b7717',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b7717" target=_"blank">b7717</a> NC_007292 Candidatus Blochmannia pennsyl ( 555) [f] 1717 22.4   1e+03 <A HREF="#b7717">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29271',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29271" target=_"blank">b29271</a> LKAS01000002 Bacterium endosymbiont PRU ( 555) [f] 1717 22.4   1e+03 <A HREF="#b29271">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24331',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24331" target=_"blank">b24331</a> JQ269442 Buchnera aphidicola isolate 56 ( 555) [f] 1713 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b24331">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24367',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24367" target=_"blank">b24367</a> JQ269396 Buchnera aphidicola isolate Cb ( 555) [f] 1708 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b24367">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b20507',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b20507" target=_"blank">b20507</a> NC_016893 Wigglesworthia glossinidia en ( 555) [f] 1708 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b20507">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b22784',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b22784" target=_"blank">b22784</a> NC_020075 Candidatus Blochmannia chroma ( 555) [f] 1708 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b22784">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24362',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24362" target=_"blank">b24362</a> JQ269401 Buchnera aphidicola isolate Pg ( 555) [f] 1704 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b24362">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29347',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29347" target=_"blank">b29347</a> NAHW01000012 Gilliamella apicola N-9-4  ( 555) [f] 1704 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b29347">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b9146',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b9146" target=_"blank">b9146</a> CP000238 Baumannia cicadellinicola str.  ( 555) [f] 1704 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b9146">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4909',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4909" target=_"blank">b4909</a> NC_004344 Wigglesworthia glossinidia     ( 555) [f] 1699 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b4909">align</A>
<a onClick="window.open('getRecord.php?id=b33203',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b33203" target=_"blank">b33203</a> NZ_QGTI01000005  Frischella perrara DSM ( 555) [f] 1699 22.3 1.1e+03 <A HREF="#b33203">align</A>
</pre><p><hr><p>

>>>b18733, 555 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library

<A name=b4995>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4995',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4995" target=_"blank">b4995</a> NC_005061 Candidatus Blochmannia floridanus       (555 nt)
 initn: 1714 init1: 1714 opt: 1834  Z-score: 70.0  bits: 22.8 E(): 8e+02
banded Smith-Waterman score: 1834; 81.2% identity (81.2% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::  : :: :: ::::: :: ::::::::  :::: ::::: ::::: ::::::
b4995  GCAACTGTGTTGGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGATTGAAAGCTGTGGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: :: ::: : ::::::::::: :: ::  : :: :: :: :::::::::
b4995  AATCCTATGGATTTGAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTAGTAGCAGCAGTAGAGGAGTTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :::::::::  :::::::  :::: :::: :::::::: ::::::::::::::::::
b4995  AAAAAATTGTCTGTTCCTTGTTCAGATCCAAAGGCTATTGCTCAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :::::::::::::: :: :::  ::: :::::: : ::::::: :::::: ::::::
b4995  GCAAATTCCGATGAAACGGTAGGTAAATTGATAGCTCAAGCTATGGATAAAGTTGGAAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: ::::: :: :: :::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::: :::
b4995  GAGGGAGTTATTACTGTAGAAGAAGGATCTGGATTGCAAGATGAGTTAGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::::::::: ::: : :: :::::::::::::::::  :::::  ::::
b4995  GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCCCCTTATTTTGTTAATAAGCCAGAAAGTGGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :: ::::::::  :::: :::::::: :::   ::::::::: : :: :: :: :: 
b4995  ACTGTGGAATTAGAACATCCATTTATTTTATTAGCGGATAAAAAAATATCTAACATCAGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :: ::: : :: :::::::::   ::::: :::::::: ::::::
b4995  GAAATGTTACCTATATTGGAATCTGTAGCTAAATCTGGAAAACCGTTACTTATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::: ::::: :: ::::: :: ::::: :: :::::::: :: :: :::
b4995  GAAGATGTAGAAGGTGAAGCGTTGGCTACTTTGGTAGTAAACAATATGCGTGGAATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :: ::: :::: :: 
b4995  AAGGTTACTGCAGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b29843>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29843',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29843" target=_"blank">b29843</a> NZ_NASO01000009 Gilliamella sp. A-TSA1           (555 nt)
 initn: 1735 init1: 1735 opt: 1776  Z-score: 68.9  bits: 22.6 E(): 9.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1776; 80.0% identity (80.0% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: ::::: ::  ::::::: ::::::::: : :: :: :::::::: :: :::
b29843 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : ::::::::::: :: ::: :::: :: ::::: ::: : 
b29843 AATCCAATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTTGTTGCAGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: ::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
b29843 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGATTCTAAAGCGATTGCCCAAGTTGGTACTATTTCA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :: :: :::::::: :: ::: : ::::: ::: : :: ::::  :::::::: :::
b29843 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAGAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b29843 GAAGGTGTTATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::::::::: ::: : :: :: :::::  : :::::: ::::: : :  
b29843 GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACCGCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : ::::::::::::: ::: : :::::: :::   ::::::::: : :: :::::  : 
b29843 ACTGTTGAATTAGATAGTCCGTATATTTTATTAGCAGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::::::::::::: :   :::: :: :: : :: ::::::
b29843 GAATTATTACCAGTATTAGAAGCAGTTGCTAAAGCAGGTAAATCTCTATTAATTATTGCT
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::::::::: : :::::: :::::::: 
b29843 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCAACATTAGTAGTTAACACTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::: ::::::
b29843 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b32596>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32596',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32596" target=_"blank">b32596</a> NZ_NASR01000003 Gilliamella  apis  A-TSA4        (555 nt)
 initn: 1735 init1: 1735 opt: 1776  Z-score: 68.9  bits: 22.6 E(): 9.1e+02
banded Smith-Waterman score: 1776; 80.0% identity (80.0% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: ::::: ::  ::::::: ::::::::: : :: :: :::::::: :: :::
b32596 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAATGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : ::::::::::: :: ::: :::: :: ::::: ::: : 
b32596 AATCCAATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCAGTTGTTGCAGCAGTTGAAGAGCTT
               70        80        90       100       110       120

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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: ::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :: :: :::::::: :: ::: : ::::: ::: : :: ::::  :::::::: :::
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::::::::: ::: : :: :: :::::  : :::::: ::::: : :  
b32596 GGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACCGCT
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : ::::::::::::: ::: : :::::: :::   ::::::::: : :: :::::  : 
b32596 ACTGTTGAATTAGATAGTCCGTATATTTTATTAGCAGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::::::::::::: :   :::: :: :: : :: ::::::
b32596 GAATTATTACCAGTATTAGAAGCAGTTGCTAAAGCAGGTAAATCTCTATTAATTATTGCT
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::::::::: : :::::: :::::::: 
b32596 GAAGATGTTGAAGGTGAAGCATTAGCAACATTAGTAGTTAACACTATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::: ::::::
b32596 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

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<hr>
<A name=b24363>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24363',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24363" target=_"blank">b24363</a> JQ269400 Buchnera aphidicola isolate Alo1        (555 nt)
 initn: 1678 init1: 1678 opt: 1749  Z-score: 68.4  bits: 22.5 E(): 9.7e+02
banded Smith-Waterman score: 1749; 79.5% identity (79.5% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :::::  :  : :: :: ::::: :::::::::::: : :: ::::: ::::: ::::::
b24363 GCTACTTTATTAGCACAATCTATAGTCAATGAAGGTTTAAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::  : :::::::: :::::::: :::::::::  ::: :: :: :: :::
b24363 AATCCTATGGATCTTAAAAGAGGAATTGATAAAGCTGTTATTAGTGCTGTAGAAGAATTA
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          :: :: ::   :::::::  :::::: ::::::::: : ::::::::::::::::::
b24363 AAAAATTTATCAGTTCCTTGTTCAGATTCTAAAGCTATTACTCAAGTAGGTACTATTTCT
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::: ::: : ::::: ::::: :: ::::  ::::: :: :: 
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: ::::: :: :: ::::::::: :::: :: :::::::: ::::: :::::  ::
b24363 GATGGTGTTATTACAGTAGAAGAAGGTACTGGTTTACAAGATGAGTTAGAAGTTGTTAAA
              250       260       270       280       290       300

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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       ::::::::::::::::: :: ::::: :::::::::::: :::::::: ::::: :::: 
b24363 GGTATGCAATTTGATCGCGGTTATCTATCTCCTTATTTTATTAATAAAGCAGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
          ::::: ::::: ::::: : ::::::  :   :::::::::: :::: :::::: : 
b24363 ATTGTTGAGTTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATTTCTAATATTCGT
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::  : :::::: : ::::::::::::   ::::::::  : :: ::: : 
b24363 GAAATGTTACCAATATTAGAATCTGTTGCTAAATCTGGAAAACCTTTGTTAATTATTTCA
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::: ::::: :: :::  :::: :::: ::::::
b24363 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTGAATTCTATGAGAGGAATTGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::: :: :: :::
b24363 AAAGTAGCAGCTGTT
              550     

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<hr>
<A name=b24338>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24338',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24338" target=_"blank">b24338</a> JQ269432 Buchnera aphidicola isolate Egi1        (555 nt)
 initn: 1720 init1: 1720 opt: 1744  Z-score: 68.3  bits: 22.4 E(): 9.8e+02
banded Smith-Waterman score: 1744; 79.4% identity (79.4% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::  :  : :: :: :::::::: ::::::::  : ::::: :: ::::: :: :::
b24338 GCAACTTTATTAGCACAATCTATTGTTAATGAAGGCTTAAAGGCAGTAGCTGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::::::::::::::::: :::::::::   :: ::: : :: :::
b24338 AATCCAATGGATTTAAAAAGAGGTATTGATAAAGCTGTTATTAAAGCTGTTCAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::  ::::   :::::::   ::::::::::::::: : ::::::::::::::::::
b24338 AAAAATATGTCAGTTCCTTGTTCTGATTCAAAAGCTATTACACAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : :::::::  :: :::  ::::::  :::: :: ::::  ::::::::::: 
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: :: :: :: :::::::::::: : ::::: :::::::::::::: :::::  ::
b24338 GATGGTGTAATTACTGTTGAAGAAGGTACAGGATTACAAGATGAATTAGAAGTTGTGAAA
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              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::: :::::::: : ::: :::: 
b24338 GGTATGCAATTTGATCGTGGTTACCTTTCTCCTTATTTTATTAATAAACCTGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         ::: :::::::::::::::: ::::::  :    ::::::::: : :: :::::: : 
b24338 ATAGTAGAATTAGATAATCCTTATATTTTAATGGCGGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  : ::: :  : ::::: ::::: ::::::: :::::::::: : :: ::: ::
b24338 GAACTACTTCCTTTACTGGAAGCTGTTGCAAAATCTAGTAAACCTTTATTAATTATTTCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: ::::: ::::: :: ::::::::::::  :::: :::: :: :::
b24338 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCTTTAGCAACTTTAGTAGTTAATTCTATGAGAGGAATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::::::::: :: 
b24338 AAAGTTGCTGCAGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b32849>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32849',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32849" target=_"blank">b32849</a>  NZ_QGLN01000009 Gilliamella  apis  ESL0169      (555 nt)
 initn: 1699 init1: 1699 opt: 1740  Z-score: 68.2  bits: 22.4 E(): 9.9e+02
banded Smith-Waterman score: 1740; 79.3% identity (79.3% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: ::::: ::  ::::::: :: :::::: : :: :: :::::::: :: :::
b32849 GCAACTGTACTTGCTCAAGCTATTGTTAACGAAGGTTTAAAAGCCGTTGCTGCTGGTATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : ::::::::::: :: ::  :::: :: ::::: ::: : 
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: ::::: :: ::::  ::::: ::::: ::::::::::: ::::::::::: 
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       :: :: :: :::::::: :: ::: : ::::: ::: : :: ::::  :::::::: :::
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       ::::::::::: :: :::::::: ::  : :: :: ::::::::: : :::::::: :::
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::: ::::: ::: : :: :: :::::  : :: ::: ::::: : : :
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :::::::::::::  :: : :::::: :::   ::::::::: : :: :::::  : 
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : ::::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: ::::: : :::::::::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :: ::::: :: :::: :::::: :::::::: 
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b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::::::::::
b32849 AAAGTTGCTGCGGTT
              550     

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<hr>
<A name=b24350>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24350',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24350" target=_"blank">b24350</a> JQ269416 Buchnera aphidicola isolate Eri1        (555 nt)
 initn: 1624 init1: 1624 opt: 1731  Z-score: 68.0  bits: 22.4 E(): 1e+03
banded Smith-Waterman score: 1731; 79.1% identity (79.1% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
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b24350 GCAACACTTTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGATTAAAAGCTGTTGCTGCTGGAATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::::::::::::::::: :::::::::  ::: ::  : :: :::
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       : ::: :::::::::::::: : ::::::  :   :::::::::: :::: :::::  : 
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::: ::::::::::::::::::: :::: :::::: ::: :::: ::: ::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::: ::::::::::::  :::: :::::::::: 
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b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
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<hr>
<A name=b24354>
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>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24354',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24354" target=_"blank">b24354</a> JQ269410 Buchnera aphidicola isolate 3           (555 nt)
 initn: 1687 init1: 1687 opt: 1722  Z-score: 67.9  bits: 22.4 E(): 1e+03
banded Smith-Waterman score: 1722; 78.9% identity (78.9% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :::::: :  : ::::: :::::::: ::::::::  : :: :: :: ::::::::::::
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: :::::: :::: :::::::: ::::: :::  ::: :: :: :: :::
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
       ::::: :: :::  :::::::   ::::: ::::::::: : ::::::::::::::::::
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::: ::: : ::::: :: :: :: :::: :::::: :: :: 
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       ::::::::::::::: : :: ::: : ::::: :::::: :::::::::::::  :::::
b24354 GGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCATATTTTATTAATAAAACAGATACTGGA
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       : ::: :::::::: ::::: : ::::::  :    ::::::::: :::: : : :::::
b24354 TTAGTAGAATTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCAGATAAAAAAATTTCTAGTGTTAGA
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::: : ::::::::::: :: ::: :   :::::: ::: : :: ::: : 
b24354 GAATTATTACCTATATTAGAAGCAGTAGCAAAAGCAGGTAAACCATTATTAATTATTTCA
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: ::::::::::: :: ::::: :: :::  :::::: :::::::: 
b24354 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCAACTTTAGTTGTAAATTCTATGCGTGGTATTGTT
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              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
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b24354 AAAATAGCAGCTGTT
              550     

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<hr>
<A name=b32937>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b32937',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b32937" target=_"blank">b32937</a> NZ_QICT01000003 Gilliamella  apicola  DSM 10409  (555 nt)
 initn: 1650 init1: 1650 opt: 1722  Z-score: 67.9  bits: 22.4 E(): 1e+03
banded Smith-Waterman score: 1722; 78.9% identity (78.9% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::::: ::::: ::  :::: :: ::::::::: : :: ::::::::::: :: :::
b32937 GCAACAGTACTTGCTCAAGCTATCGTTAATGAAGGTTTAAAAGCTGTTGCTGCGGGCATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: :::::: : ::::::::::: :: ::  ::::::: ::::: ::: : 
b32937 AATCCTATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCGGTGGTTGCTGCAGTTGAAGAGCTT
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: ::::: :: ::::  :: :: ::::: ::::: ::::: ::::::::::: 
b32937 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGACTCTAAAGCAATTGCGCAAGTTGGTACTATTTCA
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              190       200       210       220       230       240
b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :: :: :::::::: :: ::: : ::::: ::: : :: ::::  :::::::: :::
b32937 GCAAACTCTGATGAAACTGTTGGTACTTTAATTGCTCAAGCAATGGAAAAAGTAGGTAAA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :: :: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b32937 GAAGGTGTCATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::: ::::: ::: : :: :: :::::  : :::::: ::::: : :  
b32937 GGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACAGCT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :::::::::::::: :::: :::::: :::  :::::::::: : :: :::::  : 
b32937 ACTGTTGAATTAGATAACCCTTATATTTTATTAGCTGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
              370       380       390       400       410       420

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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  :::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: :  :: : :: :: :::
b32937 GAATTACTACCAGTATTAGAAGCGGTTGCTAAAGCGGGTAAATCACTATTAATTATCGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::  ::::: :::::::: 
b32937 GAAGATGTTGAAGGCGAAGCATTAGCAACATTAGTTGTCAATACAATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::: ::::::
b32937 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b7717>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b7717',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b7717" target=_"blank">b7717</a> NC_007292 Candidatus Blochmannia pennsylvanicus   (555 nt)
 initn: 1645 init1: 1645 opt: 1717  Z-score: 67.8  bits: 22.4 E(): 1e+03
banded Smith-Waterman score: 1717; 78.9% identity (78.9% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::  : :: :: ::::: :: :::::::: :: :: ::::: ::::: ::::::
b7717  GCAACCGTGTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGACTCAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : :: ::::::::::: ::  :::: :: :: :: :: :: 
b7717  AATCCCATGGATTTAAAACGTGGAATTGATAAGGCAGTCGTTGCAGCAGTAGAAGAATTG
               70        80        90       100       110       120

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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: : :::   ::::::  :::: : ::::::::::: ::::::::::::::::::
b7717  AAAAAACTATCTGTGCCTTGTTCAGATCCTAAAGCTATTGCACAAGTAGGTACTATTTCT
              130       140       150       160       170       180

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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::::: :::::::: :: :::  : : :: ::  : :: :::: ::: :: ::::::
b7717  GCAAATTCTGATGAAACTGTTGGTAAACTTATTGCGCAAGCAATGGATAAGGTGGGAAAA
              190       200       210       220       230       240

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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :: :::::::: :: :: :: ::::::::: ::::::: :: :::
b7717  GAAGGAGTTATCACTGTAGAAGAAGGGTCGGGTTTACAAGATGAACTAGATGTAGTTGAA
              250       260       270       280       290       300

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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::::::: : :::  ::: 
b7717  GGTATGCAATTTGACCGTGGTTATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAACCTGAAAGTGGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::: ::: ::::  ::::::: ::::: :::   ::::::::  :::: :: ::::: 
b7717  ACAGTGGAACTAGAACATCCTTTCATTTTATTAGCAGATAAAAAGATTTCTAACATTAGG
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :::::: : ::::: ::  :    ::::: :: ::::: ::::::
b7717  GAAATGTTACCTATATTAGAATCTGTTGCAAAGGCAGGAAAACCATTGCTTATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::: ::::: ::::: :: :: :: :: ::::::::::: ::::: :::
b7717  GAAGATGTAGAAGGTGAAGCTTTAGCGACTTTGGTTGTAAATAATATGCGTGGTATAGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::  :::: :: 
b7717  AAAGTAACTGCCGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b29271>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29271',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29271" target=_"blank">b29271</a> LKAS01000002 Bacterium endosymbiont PRUG         (555 nt)
 initn: 1663 init1: 1663 opt: 1717  Z-score: 67.8  bits: 22.4 E(): 1e+03
banded Smith-Waterman score: 1717; 78.9% identity (78.9% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::: : :: :: :::::::: :: :::::: : :: :: :: ::  : ::  ::
b29271 GCAACTGTTTTAGCACAATCTATTGTAAACGAAGGTTTAAAAGCAGTAGCATCTGGTTTG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::::::::::::::::: ::  : ::::: :: ::::: :: :::
b29271 AATCCAATGGATTTAAAAAGAGGTATTGATAAAGCAATAATTGCAGCAGTTGAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: : ::    ::::::  :::::: ::: : :: :: ::::: :::::::: :::
b29271 AAAAAACTTTCAGTACCTTGTTCAGATTCTAAATCAATAGCACAAGTCGGTACTATATCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::: : ::::: ::  ::::::: ::  :::::::::  ::::::::::::
b29271 GCAAATGCAGATCATACAGTAGGGACATTAATTGCAAATGCTATGGAAAAAGTAGGAAAA
              190       200       210       220       230       240

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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :::::::: :: :::::::::::::::::: : :::::: ::::::: ::::::
b29271 GAAGGAGTTATAACAGTAGAAGAAGGTTCTGGATTGAATGATGAACTAGATGTAGTAGAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :: :::::::: ::  : ::::: :::::::: :::::::: :::::: : ::: :::::
b29271 GGAATGCAATTCGACAGAGGATACCTTTCTCCATATTTTGTAAATAAACCTGAAACTGGA
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::: :::::::: :::::::::::  :  ::   ::::::::::: :: :::::::::
b29271 ACAGTAGAATTAGAAAATCCTTTTATACTTCTAGCAGATAAAAAAGTGTCTAATATTAGA
              370       380       390       400       410       420

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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::: ::::  : :::::: : :: :: ::::::   ::: :: : :: :: ::::::
b29271 GAAATGCTACCAATATTAGAATCTGTAGCAAAATCTGGAAAATCTCTTCTAATTATTGCT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::: : ::::::::::: :: :::: :::: :::::::::::
b29271 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCACTGGCTACATTAGTTGTAAATACTATGAGAGGTATTGTA
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::: : ::: :: 
b29271 AAAGTCGTTGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b24331>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24331',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24331" target=_"blank">b24331</a> JQ269442 Buchnera aphidicola isolate 562         (555 nt)
 initn: 1657 init1: 1657 opt: 1713  Z-score: 67.7  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1713; 78.7% identity (78.7% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :::::  : ::::: :: :::::::: ::::::::  : :: :: ::::: :::::::::
b24331 GCTACTTTACTTGCACAATCTATTGTTAATGAAGGATTAAAAGCAGTTGCAGCAGGAATG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: ::::::::::: :::::::: :::::::::  ::: :: :: :: :::
b24331 AATCCTATGGATTTAAAAAGAGGAATTGATAAAGCTGTTATTAGTGCAGTAGATGAATTA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
        : :: :: :::  :::::::   ::::::::::: ::: : ::::: :: :: :: :::
b24331 AGAAATTTATCTGTTCCTTGTTCCGATTCAAAAGCAATTACTCAAGTTGGAACAATATCT
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::::::: ::: ::: : ::::: :: :: :::::::  ::::: :: :: 
b24331 GCAAATGCAGATGAAAAAGTTGGTTCTTTAATTGCAGAAGCTATGGAAAAAGTTGGTAAT
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: ::::: :: :::::::::::  : ::::: ::: :::::::::: :: ::: ::
b24331 GATGGAGTTATTACTGTTGAAGAAGGAACAGGATTACAAAATGAATTAGAAGTAGTAAAA
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       ::::::::::::::: : :::::: : :: ::::::::: :::::::: : ::  : :: 
b24331 GGTATGCAATTTGATAGAGGATATTTATCACCTTATTTTATTAATAAACCTGATACAGGT
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         ::: :::::::: ::::: : ::::::  :   :::::::::: : :: : : : :::
b24331 GTAGTAGAATTAGAAAATCCATATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAGTGTAAGA
              370       380       390       400       410       420

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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::  : ::::::::::: :::::: :   :::::::::: : :: ::: : 
b24331 GAATTATTACCAATATTAGAAGCAGTAGCTAAAGCAGGTAAACCTTTATTAATTATTTCA
              430       440       450       460       470       480

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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::::::::::::::::  :::::: :: ::::: 
b24331 GAAGATTTAGAAGGTGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATTCTATGCGTGGAATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::: ::::::: :::
b24331 AAAATTGCTGCAGTT
              550     

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<hr>
<A name=b24367>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24367',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24367" target=_"blank">b24367</a> JQ269396 Buchnera aphidicola isolate Cbe1        (555 nt)
 initn: 1657 init1: 1657 opt: 1708  Z-score: 67.6  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1708; 78.7% identity (78.7% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::  :  : :: :: ::::: :: ::::::::  : :: :: :::::::: ::::::
b24367 GCGACTTTATTAGCTCAATCTATCGTAAATGAAGGATTAAAAGCAGTTGCTGCTGGAATG
               10        20        30        40        50        60

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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: ::::::::::::: :: :: :::   :: ::: : :: :::
b24367 AATCCAATGGATTTAAAACGAGGTATTGATAAAGCAGTCATTAAAGCTGTTCAAGAATTA
               70        80        90       100       110       120

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          ::  ::::   :::::::   ::::: ::::: ::: ::::::::::::::::::: 
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              130       140       150       160       170       180

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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : :::::::  :: :::   ::::: :::::::::::::  ::::::::::: 
b24367 GCTAATGCAGATGAAAATGTTGGTATTTTAATCGCTGATGCTATGGAAAAAGTAGGAAAT
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: ::::: :: :::::::::::: : ::::: :::::::::::::: :: ::: ::
b24367 GATGGTGTTATTACTGTTGAAGAAGGTACAGGATTACAAGATGAATTAGAAGTGGTAAAA
              250       260       270       280       290       300

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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       ::::::::::::::::: :: ::: : :::::::::::: :::::::: : ::  :::::
b24367 GGTATGCAATTTGATCGGGGTTATTTATCTCCTTATTTTATTAATAAACCTGATACTGGA
              310       320       330       340       350       360

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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
         ::::::  :::::::::::: ::::::  :   :::::::::: : :: :::::: : 
b24367 ATAGTTGAGCTAGATAATCCTTATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
              370       380       390       400       410       420

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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  : ::: : :::::: : ::::: ::::::: :::::: ::: : :::::: ::
b24367 GAATTACTTCCTATGTTAGAATCTGTTGCAAAATCTAGTAAACCATTATTGATCATTTCT
              430       440       450       460       470       480

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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : ::::: :::::::::::::: ::::: :: :::  :::::: :: :: :: 
b24367 GAAGATTTAGAAGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTAAATTCTATGCGTGGAATAGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::::::::: :: 
b24367 AAAGTTGCTGCTGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b20507>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b20507',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b20507" target=_"blank">b20507</a> NC_016893 Wigglesworthia glossinidia endosymbio  (555 nt)
 initn: 1633 init1: 1633 opt: 1708  Z-score: 67.6  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1708; 78.7% identity (78.7% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::: : ::::: :: :: :: ::::::::  : :: :::::::: :: ::::::
b20507 GCAACTGTTTTAGCGCAATCAATAGTAAATGAAGGCTTAAAAGCTGTTGCAGCCGGAATG
               10        20        30        40        50        60

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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::  : ::::: ::::  :: :: :: :  :: :: :: ::: ::
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::::::    ::::::   :: :::::: : ::::: ::::: :: :: ::::::
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: :::::  :::::: ::: : ::::::::::: :::::::  :::::::: :::
b20507 GCTAATGCCGATAGAACAGTAGGTACTTTAATAGCTGAAGCTATGGAAAAAGTAGGGAAA
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :::::::: :: :: ::::::::::: :: ::::: :: ::::::::::::::::: :::
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :: :::::::::::::: :::::: : :: ::::: :: :: :::::: ::::: :  : 
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
       ::::: :::::::::::::: ::::::::  :    ::::::::: :::: :::::: : 
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::: : ::  :::::::: : ::::: ::: :    :: ::: :: : :: ::::::
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              430       440       450       460       470       480

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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       ::::: :: ::::::::::::::::: :::::::: :: :::::::::::::: ::::: 
b20507 GAAGACGTAGAAGGGGAAGCATTAGCAACATTAGTTGTAAATAATATGCGAGGAATTGTT
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              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::: :: :: 
b20507 AAAGTTGCAGCAGTG
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b22784>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b22784',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b22784" target=_"blank">b22784</a> NC_020075 Candidatus Blochmannia chromaiodes 64  (555 nt)
 initn: 1636 init1: 1636 opt: 1708  Z-score: 67.6  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1708; 78.7% identity (78.7% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: ::  : :: :: ::::: :: :::::::: :: :: ::::: ::::: ::::::
b22784 GCAACCGTGTTAGCTCAATCTATAGTTAATGAAGGACTCAAAGCTGTAGCTGCTGGAATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : :: ::::::::::: ::  :::: :: :: :: :: :: 
b22784 AATCCCATGGATTTAAAACGTGGAATTGATAAGGCAGTCGTTGCAGCAGTAGAAGAATTG
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::: : :::   ::::::  :::: : ::::::::::: ::::::::::::::::::
b22784 AAAAAACTATCTGTGCCTTGTTCAGATCCTAAAGCTATTGCACAAGTAGGTACTATTTCT
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::::: :::::::: :: :::  : : :: ::  : :: :::: ::: :: ::::::
b22784 GCAAATTCTGATGAAACTGTTGGTAAACTTATTGCGCAAGCAATGGATAAGGTGGGAAAA
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: ::::: :: :: :::::::: :: :: :: ::::::::::::::::: :: :::
b22784 GAAGGAGTTATCACTGTAGAAGAAGGATCGGGTTTACAAGATGAATTAGATGTAGTTGAA
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::: : :::   :: 
b22784 GGTATGCAATTTGATCGTGGTTATCTGTCTCCTTATTTTGTTAATAAACCTGAAAGCGGT
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::: ::: ::::  ::::::: ::::: :::   :: :::::  :::: :: ::::: 
b22784 ACAGTGGAACTAGAACATCCTTTCATTTTATTAGCAGACAAAAAGATTTCTAACATTAGG
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       :::::::::::: : :::::: : ::::: ::  :    ::::: :: ::::: ::::::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::: ::::: ::::: :: :: :: :: ::::::::::: ::::: :::
b22784 GAAGATGTAGAAGGTGAAGCTTTAGCGACTTTGGTTGTAAATAATATGCGTGGTATAGTA
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              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::  :::: :: 
b22784 AAAGTAACTGCCGTA
              550     

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<A name=b24362>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b24362',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b24362" target=_"blank">b24362</a> JQ269401 Buchnera aphidicola isolate Pgr1        (555 nt)
 initn: 1636 init1: 1636 opt: 1704  Z-score: 67.5  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1704; 78.6% identity (78.6% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :::::  :  : :: ::  : :: :: ::::::::: : :: :: :::::::: :: :::
b24362 GCTACTTTATTAGCTCAAGCAATAGTTAATGAAGGTTTAAAAGCAGTTGCTGCTGGTATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: :::::: : ::::::::::: ::::: :::  ::: ::  : :: :::
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::  :::::  ::: :::   ::: : ::::::::: : ::::::::::::::::: 
b24362 AAAAATATGTCTGTTCCATGTTCTGATCCTAAAGCTATTACTCAAGTAGGTACTATTTCA
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       :: ::: : :::::::: :: ::: : ::::: :: :: :: ::::  :::::::: :: 
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       :: :: :: :: :: :: ::::::::  :::::::::::::::::::::: :::::: ::
b24362 GATGGTGTAATTACTGTAGAAGAAGGAACTGGATTGCAAGATGAATTAGAAGTTGTAAAA
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       ::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::: :::::::: : ::: :::: 
b24362 GGTATGCAATTCGATCGTGGATATCTTTCACCTTATTTTATTAATAAATCTGAAACTGGT
              310       320       330       340       350       360

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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
           : :::::::::::::::: ::::::  :   :::::::::: : :: :::::: : 
b24362 ATTATAGAATTAGATAATCCTTATATTTTAATGGCTGATAAAAAAATATCTAATATTCGT
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: : :::::  :::::::::: ::::: ::::: : :::::: ::: : :: ::::::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::: : :: :: :::::::::::::: ::::: :: :::  :::: :::: :: :::
b24362 GAAGATTTAGAGGGAGAAGCATTAGCTACTTTAGTTGTCAATTCTATGAGAGGAATAGTA
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              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::: ::::: :::
b24362 AAAGTAGCTGCTGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b29347>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b29347',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b29347" target=_"blank">b29347</a> NAHW01000012 Gilliamella apicola N-9-4           (555 nt)
 initn: 1632 init1: 1632 opt: 1704  Z-score: 67.5  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1704; 78.6% identity (78.6% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: ::::: ::::: ::  :::: :: ::::::::: : :: ::: ::::::: :: :::
b29347 GCAACAGTACTTGCTCAAGCTATCGTTAATGAAGGTTTAAAAGCTATTGCTGCGGGCATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::::::::: :::::: : ::::::::::: :: ::  ::::::: ::::: ::: : 
b29347 AATCCTATGGATTTAAAACGTGGTATTGATAAAGCGGTGGTTGCTGCAGTTGAAGAGCTT
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: ::::: :: ::::  :: :: ::::: ::::: ::::: ::::::::::: 
b29347 AAAAAATTATCTTCACCATGTGCTGACTCTAAAGCAATTGCACAAGTTGGTACTATTTCA
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :: :: :::::::: :: ::: : ::::: ::: : :: ::::  :::::::: :::
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :: :: :: :::::::: ::: :::: :: ::::: ::: : :::::::: :::
b29347 GAAGGTGTCATCACTGTTGAAGATGGTACTGGTTTACAAGACGAACTTGATGTTGTTGAA
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: ::::: ::::: ::: : :: :: :::::  : :::::: ::::: : :  
b29347 GGTATGCAGTTTGACCGTGGTTATTTATCACCATATTTCATCAATAAACCAGAAACAGCT
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        : :::::::::::::  :::: :::::: :::  :::::::::: : :: :::::  : 
b29347 ACTGTTGAATTAGATAGCCCTTATATTTTATTAGCTGATAAAAAAATCTCTAATATCCGT
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b18733 GAAATGTTACCTGTTTTAGAAGCAGTTGCTAAATCTAATAAACCTTTACTTATCATTGCT
       ::: :  :::: :: :::::::: ::::::::: :   :::: :  :: : :: :: :::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::  ::::: :::::::: 
b29347 GAAGATGTTGAAGGCGAAGCATTAGCAACATTAGTTGTCAATACAATGCGTGGTATTGTT
              490       500       510       520       530       540

              550     
b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       :::::::: ::::::
b29347 AAAGTTGCAGCGGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b9146>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b9146',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b9146" target=_"blank">b9146</a> CP000238 Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homa  (555 nt)
 initn: 1645 init1: 1645 opt: 1704  Z-score: 67.5  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1704; 78.6% identity (78.6% similar) in 555 nt overlap (1-555:1-555)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       :: :: :: :: :: :: :::::::: ::::::::  : :: :: ::::: ::::: :::
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :: ::::::::  ::::: : ::::::::::: :::::::: : ::: ::::: :: :: 
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          : : : :::   :::::::  ::::: ::::::::::: ::::: :: ::::: :::
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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: :: :: ::::::: ::: :::  : : ::::: :: :: ::::  ::::: :: :::
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
        :::: ::::: :: ::::::::::::::::: :: ::::::::: ::::::: :: :::
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: :: :::::::: ::  : :::::::::::: :::::::   :::   ::::
b9146  GGTATGCAGTTCGATCGTGGCTACTTATCTCCTTATTTTATTAATAAGCAAGAGAATGGA
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b18733 TCAGTTGAATTAGATAATCCTTTTATTTTGTTAATTGATAAAAAAGTTTCAAATATTAGA
        :::: :::::::: ::::: ::::: ::  ::   ::::: ::: : :: :::::::::
b9146  ACAGTAGAATTAGAAAATCCATTTATCTTACTAGCCGATAAGAAAATATCCAATATTAGA
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       :::::: : ::  : ::::::::::: :::::::: :  :::::::::::  : ::::::
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       :::::::: ::::: ::::: :::::::: ::::: :: :: : :::::: ::::: :::
b9146  GAAGATGTGGAAGGAGAAGCTTTAGCTACTTTAGTCGTAAACACTATGCGTGGTATCGTA
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b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::: :: :: :::
b9146  AAAGTAGCAGCAGTT
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b4909>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b4909',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b4909" target=_"blank">b4909</a> NC_004344 Wigglesworthia glossinidia              (555 nt)
 initn: 1609 init1: 1609 opt: 1699  Z-score: 67.5  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1699; 78.5% identity (78.5% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
       ::::: ::: : :: :: :: :: :: :::::::: :: :: :: :: :: :: :: :::
b4909  GCTACCGTTTTAGCTCAATCCATAGTTAATGAAGGACTAAAAGCAGTAGCAGCTGGTATG
               10        20        30        40        50        60

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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       :::::::::::  ::::::::::::::::::: :::::::: :  :: :: :  ::  ::
b4909  AATCCTATGGATCTAAAAAGAGGTATTGATAAAGCTGTTATAGGAGCAGTGGCTGAACTA
               70        80        90       100       110       120

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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: :::  ::: ::   ::: :: ::: : :: :::::::: :: :: ::::::
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              130       140       150       160       170       180

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b18733 GCCAATTCCGATGAAACAGTGGGTGCATTAATAGCTGATGCTATGGCTAAAGTAGGAAAA
       :: ::: : ::  : ::::: ::  : :: :::::::: :::::::  ::::: ::::::
b4909  GCAAATGCAGACAAGACAGTAGGAACCTTGATAGCTGAAGCTATGGAAAAAGTTGGAAAA
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b18733 GAAGGCGTTATAACGGTTGAAGAAGGTTCTGGATTGCAAGATGAATTAGATGTTGTAGAA
       ::::: :::::::: :: :::::::: :::::: ::::::: ::::::::::: ::::: 
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b18733 GGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTAATAAAACAGAATCTGGA
       :::::::: :::::: : :: ::: : :::::::: :::::::::::  ::::: :: : 
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       :::::::: ::::: :: ::::::::::::::    ::::::::: : :: :::::::::
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       :::::: : ::  :::::::: : :: :: ::: ::   :: :::::: : :: :: :: 
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b18733 GAAGATGTTGAAGGGGAAGCATTAGCTACATTAGTAGTTAATAATATGCGAGGTATTGTA
       ::::: :: ::::: ::::: ::::::::: :::: :: ::::::::: :::::::::::
b4909  GAAGACGTAGAAGGAGAAGCTTTAGCTACACTAGTGGTAAATAATATGAGAGGTATTGTA
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b18733 AAAGTTGCTGCGGTT
       ::::: :: ::::: 
b4909  AAAGTAGCAGCGGTA
              550     

</pre>
<hr>
<A name=b33203>
<pre>
>><a onClick="window.open('getRecord.php?id=b33203',
                                'cpndb_record'); return false;" href="getRecord.php?id=b33203" target=_"blank">b33203</a> NZ_QGTI01000005  Frischella perrara DSM 104328   (555 nt)
 initn: 1699 init1: 1699 opt: 1699  Z-score: 67.5  bits: 22.3 E(): 1.1e+03
banded Smith-Waterman score: 1699; 78.5% identity (78.5% similar) in 554 nt overlap (1-554:1-554)
<p>

               10        20        30        40        50        60
b18733 GCTACAGTTCTTGCGCAGTCTATTGTCAATGAAGGTCTGAAGGCTGTTGCTGCAGGAATG
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b18733 AATCCTATGGACTTAAAAAGAGGTATTGATAAGGCTGTTATTGCTGCCGTTGAGGAGTTA
       ::::: ::::: :::::: : ::::::::::: :: ::::::::::: :: :: ::  : 
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b18733 CGTAAATTGTCTTCTCCTTGTGAAGATTCAAAAGCTATTGCCCAAGTAGGTACTATTTCT
          ::::: :::::::::::::  :: :: :: :::::::: :::::::: :: ::::::
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555 residues in 1 query   sequences
10433008 residues in 18820 library sequences
 Scomplib [35.03]
 start: Mon Jul 22 04:40:25 2024 done: Mon Jul 22 04:40:27 2024
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]
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