/var/www/html/cpndb/fasta_results/b14206.fasta# /data/www/cpndb/fasta35 -E 200 -Q -m 6 -b 20 -d 20 -z 2 -H /data/www/cpndb/fasta_results/b14206 /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank
 version 35.03 Feb. 18, 2008
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: /data/www/cpndb/fasta_results/b14206
  1>>>b14206 558 nt - 558 nt
Library: /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut 10433008 residues in 18820 sequences

10433008 residues in 18820 sequences
Statistics: MLE_cen statistics: Lambda= 0.0037;  K=8.903e-06 (cen=941)
Algorithm: FASTA (3.5 Sept 2006) [optimized]
Parameters: +5/-4 matrix (5:-4) ktup: 6
 join: 51, opt: 36, open/ext: -12/-4, width:  16
 Scan time:  2.430



The best scores are:                                      opt bits E(18820)
b312 AF195273 Ehrlichia ewingii                ( 558) [f] 2565 30.4       4 align
b4786 AB074462 Ehrlichia sp. TS37              ( 558) [f] 2403 29.6     7.3 align
b7543 NZ_AAIF01000011 Ehrlichia chaffeensis Sa ( 558) [f] 2385 29.5     7.8 align
b163 L10917 Ehrlichia chaffeensis Arkansas     ( 558) [f] 2385 29.5     7.8 align
b1162 AB032711 Ehrlichia sp. Anan              ( 558) [f] 2358 29.3     8.6 align
b1157 AB032712 Ehrlichia sp. HF565             ( 558) [f] 2358 29.3     8.6 align
b1158 AF210459 Ehrlichia muris AS145           ( 558) [f] 2322 29.1     9.9 align
b5075 NC_007354 Ehrlichia canis Jake           ( 558) [f] 2304 29.0      11 align
b1159 U96731 Ehrlichia canis FL                ( 558) [f] 2304 29.0      11 align
b34983 QOHL01000018 Ehrlichia minasensis B11   ( 555) [f] 2257 28.8      13 align
b34757 NZ_QOHL01000018 Ehrlichia  minasensis   ( 555) [f] 2257 28.8      13 align
b7436 NC_006831 Ehrlichia ruminantium str. Gar ( 558) [f] 2187 28.4      16 align
b7438 NC_006832 Ehrlichia ruminantium Welgevon ( 558) [f] 2160 28.3      18 align
b147 U13638 Cowdria ruminantium Welgevonden    ( 558) [f] 2160 28.3      18 align
b5085 AB084583 Candidatus Neoehrlichia mikuren ( 558) [f] 1930 27.0      42 align
b3145 AB084583 Ehrlichia-like sp. TK4456       ( 558) [f] 1930 27.0      42 align
b10829 EU432375 Candidatus Neoehrlichia mikure ( 558) [f] 1926 27.0      43 align
b21123 JX392803 Candidatus Neoehrlichia mikure ( 558) [f] 1917 27.0      44 align
b3146 AB074461 Ehrlichia sp. IS58              ( 558) [f] 1894 26.9      48 align
b5086 AB074461 Candidatus Neoehrlichia mikuren ( 558) [f] 1894 26.9      48 align


>>>b14206, 558 nt vs /data/www/cpndb/blastDBs/reference_a_nut library

>>b312 AF195273 Ehrlichia ewingii                         (558 nt)
 initn: 2565 init1: 2565 opt: 2565  Z-score: 111.3  bits: 30.4 E():    4
banded Smith-Waterman score: 2565; 95.5% identity (95.5% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG ::::::::::: :: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b312 TGTTCTATCTTAACCGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b312 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b312 ATGTCTATGAAACGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::: ::::::::::::::::::: ::::::::::::::: ::::::::::::: : b312 GCTAATGGTGATAAGAATATAGGTAGTAGGATTGCACAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAGA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :::::::::::::::::: b312 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAAGGATTTAAAGAGTTGGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b312 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::::::::::::::: ::::::::::: :: :::::::: ::::::::::::::: b312 ATGTTAGTAGAATTTGAAAATCCTTATATTTTGCTGACAGAAAAGAAACTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::: : ::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: :::::: b312 CAACCTATACTGCCAATTTTAGAAAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: ::::::::::: :: :::::::::::::::::::: :::::::::::: b312 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCTCTCAGCACTCTTGTCTTAAATAAATTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :::::::::::::::::: b312 TTGCATGTTGCAGCAGTT 550


>>b4786 AB074462 Ehrlichia sp. TS37                       (558 nt)
 initn: 2403 init1: 2403 opt: 2403  Z-score: 106.7  bits: 29.6 E():  7.3
banded Smith-Waterman score: 2403; 92.3% identity (92.3% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b4786 TGTTCTATTTTAACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: :: :: :::::::: :::::::::::::: ::::: :::::: b4786 GATATTGTCTGTATTAAAGAGGGCGTACTTAAGGCTAAAGAAGCTGTGTTAGAGGCTTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::: ::::::::: : :::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b4786 ATGTCTATGAAACGTGAAATATTGTCTGAAGAAGAAATTGCTCAGGTTGCTACTATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::::::::: :: ::::::::::: :::::::::::::: :: :::::::::::: b4786 GCTAATGGAGATAAAAACATAGGTAGTAAAATTGCACAATGTGTTCAGGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::: :: :::::::: ::: b4786 GATGGCGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGATTTAAAGAATTAGACGTTGAAAAGACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: b4786 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::::::::::::::: :: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b4786 ATGTTAGTAGAATTTGAAAATCCATATATTTTACTAACAGAAAAGAAACTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::: : ::::::::::: ::::: ::::: ::::::::::::::::: :: ::: b4786 CAACCTATACTGCCAATTTTAGAAAATGTTGCTAGGTCAGGAAGACCTCTTTTAATCATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :::::::::::: b4786 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCACTTAGCACTCTTGTATTAAATAAATTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b4786 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b7543 NZ_AAIF01000011 Ehrlichia chaffeensis Sapulpa     (558 nt)
 initn: 2385 init1: 2385 opt: 2385  Z-score: 106.2  bits: 29.5 E():  7.8
banded Smith-Waterman score: 2385; 91.9% identity (91.9% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b7543 TGTTCTATTTTAACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::: :: ::::: ::: b7543 GATATTGTGTGTATTAAAGAAGGTGTACTAAAAGCTAAAGAGGCTGTTTTGGAAGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT :::::::::::::::::: : : ::::::::::::::::: ::::::::::::::::: b7543 ATGTCTATGAAGCGTGAAGTGTTGTCTGAAGAAGAAATTGCACAAGTTGCTACTATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b7543 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::: b7543 GATGGGGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAAGGCTTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: :::::::::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::: b7543 GATGGTATGCAGTTTGATCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAATTCAGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::: ::: b7543 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATCTTACTAACAGAGAAAAAACTTAATATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: ::::::::::::::::: :: ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::: b7543 CAACCTATATTACCAATTTTGGAAAATGTGGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :::::::::::::::::::::::::: :::::::: :: :::::::: :: :: ::::: b7543 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTTAGCACTCTCGTTTTAAATAAATTGCGCGGTGGG 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b7543 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b163 L10917 Ehrlichia chaffeensis Arkansas              (558 nt)
 initn: 2385 init1: 2385 opt: 2385  Z-score: 106.2  bits: 29.5 E():  7.8
banded Smith-Waterman score: 2385; 91.9% identity (91.9% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b163 TGTTCTATTTTAACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::: :: ::::: ::: b163 GATATTGTGTGTATTAAAGAAGGTGTACTAAAAGCTAAAGAGGCTGTTTTGGAAGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT :::::::::::::::::: : : ::::::::::::::::: ::::::::::::::::: b163 ATGTCTATGAAGCGTGAAGTGTTGTCTGAAGAAGAAATTGCACAAGTTGCTACTATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b163 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::: b163 GATGGGGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAAGGCTTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: :::::::::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::: b163 GATGGTATGCAGTTTGATCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAATTCAGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::: ::: b163 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATCTTACTAACAGAGAAAAAACTTAATATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: ::::::::::::::::: :: ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::: b163 CAACCTATATTACCAATTTTGGAAAATGTGGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :::::::::::::::::::::::::: :::::::: :: :::::::: :: :: ::::: b163 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTTAGCACTCTCGTTTTAAATAAATTGCGCGGTGGG 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b163 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b1162 AB032711 Ehrlichia sp. Anan                       (558 nt)
 initn: 2358 init1: 2358 opt: 2358  Z-score: 105.4  bits: 29.3 E():  8.6
banded Smith-Waterman score: 2358; 91.4% identity (91.4% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :: b1162 TGTTCTATTTTAACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGGGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: ::::::::: : ::::::::::::::::: ::::::: ::: b1162 GATATTGTATGTATTAAAGAAGGTGTATTGAAAGCTAAAGAAGCTGTGCTAGAAGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::::::::::::::::::::::: b1162 ATGTCTATGAAGCGTGAAATATTATCTGAAGAGGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::: b1162 GCTAATGGAGATAAGAACATAGGTAGTAAAATTGCCCAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :::::: ::::::::::::::::: b1162 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGCTTCAAAGAACTGGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: ::::: :: b1162 GATGGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCAGAGAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::: b1162 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATCTTACTAACAGAGAAAAAACTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::: b1162 CAACCTATATTACCAATTTTAGAAAATGTGGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: ::::::::::: :: :: :::::::: :: ::::: :: ::::::::: b1162 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCTCTTAGTACTCTTGTTTTGAATAAATTGCGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b1162 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b1157 AB032712 Ehrlichia sp. HF565                      (558 nt)
 initn: 2358 init1: 2358 opt: 2358  Z-score: 105.4  bits: 29.3 E():  8.6
banded Smith-Waterman score: 2358; 91.4% identity (91.4% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::: :: b1157 TGTTCTATTTTAACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGGGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: ::::::::: : ::::::::::::::::: ::::::: ::: b1157 GATATTGTATGTATTAAAGAAGGTGTATTGAAAGCTAAAGAAGCTGTGCTAGAAGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::::::::::::: :::::::::: :::::::::::::::::::::::::: b1157 ATGTCTATGAAGCGTGAAATATTATCTGAAGAGGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::: b1157 GCTAATGGAGATAAGAACATAGGTAGTAAAATTGCCCAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: ::::: ::::: :: :::::: ::::::::::::::::: b1157 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGCTTCAAAGAACTGGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: ::::: :: b1157 GATGGTATGCAGTTTGATCGTGGTTATCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCAGAGAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::: b1157 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATCTTACTAACAGAGAAAAAACTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::: b1157 CAACCTATATTACCAATTTTAGAAAATGTGGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: ::::::::::: :: :: :::::::: :: ::::: :: ::::::::: b1157 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCTCTTAGTACTCTTGTTTTGAATAAATTGCGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b1157 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b1158 AF210459 Ehrlichia muris AS145                    (558 nt)
 initn: 2322 init1: 2322 opt: 2322  Z-score: 104.3  bits: 29.1 E():  9.9
banded Smith-Waterman score: 2322; 90.7% identity (90.7% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :::::::: :::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b1158 TGTTCTATTTTAACTGCAAAGGTTATAGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :::::::: ::::::::: : :::::::::::::::::: ::::::: :: b1158 GATATTGTATGTATTAAAGAAGGTGTATTAAAAGCTAAAGAAGCTGTACTAGAAGCATTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT :::::::::::::::::: :: :::::::::: :: ::::::::::::::::::::::: b1158 ATGTCTATGAAGCGTGAAGTATTATCTGAAGAGGAGATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCA 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA ::::::::::::::::: ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::: b1158 GCTAATGGAGATAAGAACATAGGTAGTAAAATTGCTCAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: :::::::: ::::: :::::::::::::::::::::::: b1158 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAGGGATTCAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::::::::: :: ::::::::::::::::: :: :: ::::: :: b1158 GATGGTATGCAGTTTGATCGTGGGTACCTTTCTCCTTATTTTGTAACCAACTCAGAGAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA ::::: :: ::::::::::: :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::: b1158 ATGTTGGTGGAATTTGAAAATCCTTATATCTTACTAACAGAGAAAAAACTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT ::::::::::::::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::: b1158 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAAAATGTGGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::: ::::: ::::: ::::: :: :: :::::::: :: ::::: ::::::::::: b1158 GCAGAGGATGTAGAAGGAGAAGCGCTTAGTACTCTTGTTTTGAATAAATTACGTGGTGGG 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b1158 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b5075 NC_007354 Ehrlichia canis Jake                    (558 nt)
 initn: 2304 init1: 2304 opt: 2304  Z-score: 103.8  bits: 29.0 E():   11
banded Smith-Waterman score: 2304; 90.3% identity (90.3% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b5075 TGTTCTATTTTAACTGCGAAAGTTATAGAAGAAGTTTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :: ::::: :: :::::::::::::::::::: ::::: :::: :: ::: b5075 GATATTGTATGCATTAAAGATGGTGTACTTAAAGCTAAAGAGGCTGTTCTAGATGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::::::::: :: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: b5075 ATGTCTATGAAGCGTGAGGTATTATCTGAGGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::: :::::::: :::::: ::: :::::::::::::: :: :::::::::::: b5075 GCTAATGGTGATAAGAACATAGGTGTTAAAATTGCACAATGTGTTCAGGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: :: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b5075 GATGGTGTTATTACAGTTGAAGAGAGTAAAGGATTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::::: ::::: :: ::::: b5075 GATGGTATGCAGTTTGACCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCGGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::: b5075 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATTTTACTAACAGAGAAAAAGCTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT ::::::::: : ::::::::::: ::::: :::::::: :::::::::::::: :::::: b5075 CAGCCTATACTGCCAATTTTAGAAAATGTTGCTAGATCTGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: ::::::::::: :: ::::::::::: :::::::: :::::::::::: b5075 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGCTTAGCACTCTTGTTTTAAATAAATTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b5075 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b1159 U96731 Ehrlichia canis FL                         (558 nt)
 initn: 2304 init1: 2304 opt: 2304  Z-score: 103.8  bits: 29.0 E():   11
banded Smith-Waterman score: 2304; 90.3% identity (90.3% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: ::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: b1159 TGTTCTATTTTAACTGCGAAAGTTATAGAAGAAGTTTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :: ::::: :: :::::::::::::::::::: ::::: :::: :: ::: b1159 GATATTGTATGCATTAAAGATGGTGTACTTAAAGCTAAAGAGGCTGTTCTAGATGCATTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::::::::: :: ::::::: ::::::::::::::::::::::::::::: b1159 ATGTCTATGAAGCGTGAGGTATTATCTGAGGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCC 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::: :::::::: :::::: ::: :::::::::::::: :: :::::::::::: b1159 GCTAATGGTGATAAGAACATAGGTGTTAAAATTGCACAATGTGTTCAGGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: :: :::::::::::::::::::: ::::::::::::::: b1159 GATGGTGTTATTACAGTTGAAGAGAGTAAAGGATTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::::: ::::: :: ::::: b1159 GATGGTATGCAGTTTGACCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCGGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::: b1159 ATGTTAGTGGAATTTGAAAATCCTTATATTTTACTAACAGAGAAAAAGCTTAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT ::::::::: : ::::::::::: ::::: :::::::: :::::::::::::: :::::: b1159 CAGCCTATACTGCCAATTTTAGAAAATGTTGCTAGATCTGGAAGACCTCTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: ::::::::::: :: ::::::::::: :::::::: :::::::::::: b1159 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCGCTTAGCACTCTTGTTTTAAATAAATTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: ::::::::: b1159 TTACATGTAGCAGCAGTT 550


>>b34983 QOHL01000018 Ehrlichia minasensis B11            (555 nt)
 initn: 2209 init1: 2209 opt: 2257  Z-score: 102.5  bits: 28.8 E():   13
banded Smith-Waterman score: 2257; 89.7% identity (89.7% similar) in 554 nt overlap (4-557:1-554)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG ::::: :: ::::: ::::::::::::::::: :: :::::::::::::::::: : b34983 TCTATTTTAACTGCGAAAGTTATAGAAGAAGTTTCGAAAGCTAAAGCTGCTGGATCA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :: :::::::: :::::::::::::::::::::::::: :::: :: ::: b34983 GATATTGTATGCATTAAGGATGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTTCTAGATGCATTA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::: :: ::: : : ::::: ::::::::::::::::::::::::::::: b34983 ATGTCTATGAAACGGGAAGTGTTGTCTGAGGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::: :::::::: :::::: ::: :::::::::::::: ::::::::::::::: b34983 GCTAATGGTGATAAGAACATAGGTGTTAAAATTGCACAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::: b34983 GATGGTGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAAGGGTTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::::: ::::: :: ::::: b34983 GATGGTATGCAGTTTGACCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCGGAAAAG 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::: b34983 ATGTTAGTTGAATTTGAAAATCCTTATATTTTACTAACAGAGAAAAAGCTTAATATAATA 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::::: :::::: :::: ::::: :::::::: :::::::::::::: :::::: b34983 CAACCTATATTGCCAATTCTAGAAAATGTTGCTAGATCTGGAAGACCTCTTTTAATTATT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::::::: b34983 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCACTTAGCACTCTTGTTTTAAATAAATTGCGTGGTGGA 480 490 500 510 520 530 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: :::::::: b34983 TTACATGTAGCAGCAGTG 540 550


>>b34757 NZ_QOHL01000018 Ehrlichia  minasensis  B11       (555 nt)
 initn: 2209 init1: 2209 opt: 2257  Z-score: 102.5  bits: 28.8 E():   13
banded Smith-Waterman score: 2257; 89.7% identity (89.7% similar) in 554 nt overlap (4-557:1-554)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG ::::: :: ::::: ::::::::::::::::: :: :::::::::::::::::: : b34757 TCTATTTTAACTGCGAAAGTTATAGAAGAAGTTTCGAAAGCTAAAGCTGCTGGATCA 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::::: :: :::::::: :::::::::::::::::::::::::: :::: :: ::: b34757 GATATTGTATGCATTAAGGATGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTTCTAGATGCATTA 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT ::::::::::: :: ::: : : ::::: ::::::::::::::::::::::::::::: b34757 ATGTCTATGAAACGGGAAGTGTTGTCTGAGGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCC 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :::::::: :::::::: :::::: ::: :::::::::::::: ::::::::::::::: b34757 GCTAATGGTGATAAGAACATAGGTGTTAAAATTGCACAATGTGTTCAAGAAGTTGGTAAA 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::::::::: ::::::::::: ::::::::::::::: b34757 GATGGTGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAAGGGTTTAAAGAATTAGATGTTGAAAAAACT 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::: ::::: :::::::: ::::::::::::::::: ::::: :: ::::: b34757 GATGGTATGCAGTTTGACCGTGGATACCTTTCTCCTTATTTTGTAACTAACTCGGAAAAG 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: ::::::::::: :::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::: b34757 ATGTTAGTTGAATTTGAAAATCCTTATATTTTACTAACAGAGAAAAAGCTTAATATAATA 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :::::::: :::::: :::: ::::: :::::::: :::::::::::::: :::::: b34757 CAACCTATATTGCCAATTCTAGAAAATGTTGCTAGATCTGGAAGACCTCTTTTAATTATT 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::::::::: :::::::::::::: ::::::::::: :::::::: :: ::::::::: b34757 GCAGAAGATGTAGAAGGTGAAGCACTTAGCACTCTTGTTTTAAATAAATTGCGTGGTGGA 480 490 500 510 520 530 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: :::::::: b34757 TTACATGTAGCAGCAGTG 540 550


>>b7436 NC_006831 Ehrlichia ruminantium str. Gardel       (558 nt)
 initn: 2187 init1: 2187 opt: 2187  Z-score: 100.5  bits: 28.4 E():   16
banded Smith-Waterman score: 2187; 88.0% identity (88.0% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :::::::: ::::: :: ::::: ::::::: ::: :::::::: :: b7436 TGTTCTATTTTAACTGCAAAGGTTATTGAGGAAGTATCTAAAGTTAAGGCTGCTGGTGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: ::::: ::: ::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::: b7436 GATATTATTTGTGTTAGAGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAGGCAGTATTAGAAGCTTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : : :::::::::::: :: ::::::::::::::::::: :::::::: ::::: ::: b7436 AAATGCATGAAGCGTGAAGTATTATCTGAAGAAGAAATTGCCCAAGTTGCAACTATCTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::: ::::: :::::::::: ::: :::::::: ::::: :::::::::::::: b7436 GCAAATGGTGATAAAAATATAGGTACTAAAATTGCACAGTGTGTTAAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: ::::: :::::::::::::: :: ::::::::::::::: b7436 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGATTTAAAGAGTTAGATGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::::::::::::::: : ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::: b7436 GATGGTATGCAATTTGACAGAGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAACTCAGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: :: :::::::: :::::::::::: :::::::::: ::::: ::::::::: b7436 ATGTTAGTTGAGTTTGAAAATCCTTATATTTTATTAACAGAAAAGAAACTAAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: ::: :::: ::::::::::::::: : ::::::::::: ::::: ::::: :::::: b7436 CAACCTCTATTGCCAATTTTAGAGAATATTGCTAGATCAGGTAGACCACTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::: ::::: ::::::::::::::::: :: ::::: :: :::::::: :::::::: b7436 GCAGAGGATGTAGAAGGTGAAGCACTGAGTACACTTGTATTGAATAAGTTGCGTGGTGGT 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: :: :::::: b7436 TTACATGTAGCTGCAGTT 550


>>b7438 NC_006832 Ehrlichia ruminantium Welgevonden       (558 nt)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 2160  Z-score: 99.7  bits: 28.3 E():   18
banded Smith-Waterman score: 2160; 87.5% identity (87.5% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :::::::: ::::: :: ::::: ::::: : ::: :::::::: :: b7438 TGTTCTATTTTAACTGCAAAGGTTATTGAGGAAGTATCTAAGGTTAAGGCTGCTGGTGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: ::::: ::: :::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::: b7438 GATATTATTTGTGTTAGGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAGGCAGTATTAGAAGCTTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : : :::::::::::: : ::::::::::::::::::: :::::::: ::::: ::: b7438 AAATGCATGAAGCGTGAAGTGTTATCTGAAGAAGAAATTGCCCAAGTTGCAACTATCTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::: ::::: :::::::::: ::: :::::::: ::::: :::::::::::::: b7438 GCGAATGGTGATAAAAATATAGGTACTAAAATTGCACAGTGTGTTAAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::: :::::::::::::: :: ::::::::::: ::: b7438 GATGGGGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGATTTAAAGAGTTAGATGTTGAAAAGACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :::::::::::::::::: : ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::: b7438 GATGGTATGCAATTTGATAGAGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAACTCAGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: :: :::::::: :::::::::::: :::::::::: ::::: ::::::::: b7438 ATGTTAGTTGAGTTTGAAAATCCTTATATTTTATTAACAGAAAAGAAACTAAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: ::: :::: ::::::::::::::: : ::::::::::: ::::: ::::: :::::: b7438 CAACCTCTATTGCCAATTTTAGAGAATATTGCTAGATCAGGTAGACCACTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::: ::::: :::::::::::::: :: :: ::::: :: :::::::: :::::::: b7438 GCAGAGGATGTAGAAGGTGAAGCACTTAGTACACTTGTATTGAATAAGTTGCGTGGTGGT 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: :: :::::: b7438 TTACATGTAGCTGCAGTT 550


>>b147 U13638 Cowdria ruminantium Welgevonden             (558 nt)
 initn: 2160 init1: 2160 opt: 2160  Z-score: 99.7  bits: 28.3 E():   18
banded Smith-Waterman score: 2160; 87.5% identity (87.5% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :::::::: ::::: :: ::::: ::::: : ::: :::::::: :: b147 TGTTCTATTTTAACTGCAAAGGTTATTGAGGAAGTATCTAAGGTTAAGGCTGCTGGTGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: ::::: ::: :::::::::::::::::::::::: :: ::::::::::::::: b147 GATATTATTTGTGTTAGGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAGGCAGTATTAGAAGCTTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : : :::::::::::: : ::::::::::::::::::: :::::::: ::::: ::: b147 AAATGCATGAAGCGTGAAGTGTTATCTGAAGAAGAAATTGCCCAAGTTGCAACTATCTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::: ::::: :::::::::: ::: :::::::: ::::: :::::::::::::: b147 GCGAATGGTGATAAAAATATAGGTACTAAAATTGCACAGTGTGTTAAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: ::::: :::::::::::::: :: ::::::::::: ::: b147 GATGGGGTTATTACAGTTGAAGAAAGCAAAGGATTTAAAGAGTTAGATGTTGAAAAGACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :::::::::::::::::: : ::::::::::::::::::::::::::::: :::::::: b147 GATGGTATGCAATTTGATAGAGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAACTCAGAAAAG 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::::: :: :::::::: :::::::::::: :::::::::: ::::: ::::::::: b147 ATGTTAGTTGAGTTTGAAAATCCTTATATTTTATTAACAGAAAAGAAACTAAATATAATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: ::: :::: ::::::::::::::: : ::::::::::: ::::: ::::: :::::: b147 CAACCTCTATTGCCAATTTTAGAGAATATTGCTAGATCAGGTAGACCACTTTTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA ::::: ::::: :::::::::::::: :: :: ::::: :: :::::::: :::::::: b147 GCAGAGGATGTAGAAGGTGAAGCACTTAGTACACTTGTATTGAATAAGTTGCGTGGTGGT 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: ::::: :: :::::: b147 TTACATGTAGCTGCAGTT 550


>>b5085 AB084583 Candidatus Neoehrlichia mikurensis TK44  (558 nt)
 initn: 1918 init1: 1918 opt: 1930  Z-score: 93.1  bits: 27.0 E():   42
banded Smith-Waterman score: 1930; 82.9% identity (82.9% similar) in 557 nt overlap (1-557:1-557)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :: :: :::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::: b5085 TGTTCTATTTTAACAGCTAAAGTTATCGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: :: : :: :: : ::: : : ::::: :: ::: ::::::::: :::: b5085 GATATTATTAGCATAAAAAATGGTATCTTAAAAGCAAAGGAATTAGTATTAGAATCTTTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : ::::::::::: :: : :: ::::: ::::: :: ::::::::::: :::::: b5085 CTTTCTATGAAGCGCGATGTTTCTTCAGAAGATGAAATAGCACAAGTTGCTACAATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::::::::: :: ::::::::::: :::::::::::::: : ::::::::::: b5085 GCAAATGGAGATAAAAACATAGGTAGTAAAATTGCACAATGTGTAAAGGAAGTTGGTAAG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: :: :: :: :::::::::::: b5085 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAGGGATTTAAGGAGTTAGAAGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :: ::::::::::::::: : :: ::: : :::::::: ::::: :::::: :::::::: b5085 GACGGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCTTACTTTGTAACTAATGCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::: : ::::::::::: :: ::::::::: :::::::::::::: : ::::: ::: b5085 ATGTTAATTGAATTTGAAAATCCATATATTTTATTAACAGAAAAAAAATTAAATATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :: :::::::: :: : :: ::: :::: :::::::: ::::: :: : :::::: b5085 CAACCAATATTACCTATCCTTGAAAATATAGCAAGATCAGGTAGACCACTGCTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :: :::::::: :::::::::::: : :::::: : :: :::::::::::::::::::: b5085 GCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTACTAAATAAGTTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: :::::::: :: :: b5085 TTACATGTTGCTGCTGTC 550


>>b3145 AB084583 Ehrlichia-like sp. TK4456                (558 nt)
 initn: 1918 init1: 1918 opt: 1930  Z-score: 93.1  bits: 27.0 E():   42
banded Smith-Waterman score: 1930; 82.9% identity (82.9% similar) in 557 nt overlap (1-557:1-557)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :: :: :::::::: :::::::: ::::::::::::::::::::::: b3145 TGTTCTATTTTAACAGCTAAAGTTATCGAAGAAGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: :: : :: :: : ::: : : ::::: :: ::: ::::::::: :::: b3145 GATATTATTAGCATAAAAAATGGTATCTTAAAAGCAAAGGAATTAGTATTAGAATCTTTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : ::::::::::: :: : :: ::::: ::::: :: ::::::::::: :::::: b3145 CTTTCTATGAAGCGCGATGTTTCTTCAGAAGATGAAATAGCACAAGTTGCTACAATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::::::::: :: ::::::::::: :::::::::::::: : ::::::::::: b3145 GCAAATGGAGATAAAAACATAGGTAGTAAAATTGCACAATGTGTAAAGGAAGTTGGTAAG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT :::::::::::::::::::: :::::::: :::::::: :: :: :: :::::::::::: b3145 GATGGAGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAGGGATTTAAGGAGTTAGAAGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :: ::::::::::::::: : :: ::: : :::::::: ::::: :::::: :::::::: b3145 GACGGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCTTACTTTGTAACTAATGCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::: : ::::::::::: :: ::::::::: :::::::::::::: : ::::: ::: b3145 ATGTTAATTGAATTTGAAAATCCATATATTTTATTAACAGAAAAAAAATTAAATATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :: :::::::: :: : :: ::: :::: :::::::: ::::: :: : :::::: b3145 CAACCAATATTACCTATCCTTGAAAATATAGCAAGATCAGGTAGACCACTGCTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :: :::::::: :::::::::::: : :::::: : :: :::::::::::::::::::: b3145 GCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCATTAAGCACTTTAGTACTAAATAAGTTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: :::::::: :: :: b3145 TTACATGTTGCTGCTGTC 550


>>b10829 EU432375 Candidatus Neoehrlichia mikurensis Can  (558 nt)
 initn: 1909 init1: 1909 opt: 1926  Z-score: 93.0  bits: 27.0 E():   43
banded Smith-Waterman score: 1926; 82.8% identity (82.8% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :: :: ::::: :: :: :: :: ::::::::::::::::::::::: b10829 TGTTCTATTTTAACAGCTAAAGTAATCGAGGAGGTATCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: :: :::: :: : ::: : : ::::: :: ::: ::::::::: ::::: b10829 GATATTATTAGTATCAAAAATGGTATCTTAAAAGCAAAGGAATTAGTATTAGAATCTTTA 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : :::::::: ::::: : :: ::::: ::::: :: :: ::::: :: :::::: b10829 CTTTCTATGAAACGTGATGTTTCTTCAGAAGATGAAATAGCACAGGTTGCAACAATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: ::::::::::: :: :::::::: :: ::::::::::: :: :::::::::::::: b10829 GCAAATGGAGATAAAAACATAGGTAGCAAAATTGCACAATGCGTAAAAGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: :::::::::::::: :::::::: :::::::::::::: :: :::::::::::: b10829 GATGGTGTTATTACAGTTGAAGAAAGTAAGGGATTTAAAGAATTAGAAGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA :::::::::::::::::: : :: ::: : :: :::::::::::::: ::: :::::::: b10829 GATGGTATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCACCTTATTTTGTTACCAATGCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::: : ::::::::::: :: ::::::::: : :::::::::::: : :: :: ::: b10829 ATGTTAATTGAATTTGAAAATCCATATATTTTATTGACAGAAAAAAAATTAAACATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT ::::: ::: :::: :: : :: ::: :::: :::::::: :::::::: : :::::: b10829 CAGCCAATACTACCTATCCTTGAAAATATAGCAAGATCAGGTAGACCTCTACTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :: :::::::: :::::::::::: :::: ::: : :: :::::::::::::::::::: b10829 GCTGAAGATGTAGAAGGTGAAGCATTGAGTACTTTAGTGCTAAATAAGTTACGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT ::::::::::: :: ::: b10829 TTGCATGTTGCTGCTGTT 550


>>b21123 JX392803 Candidatus Neoehrlichia mikurensis clo  (558 nt)
 initn: 1900 init1: 1900 opt: 1917  Z-score: 92.7  bits: 27.0 E():   44
banded Smith-Waterman score: 1917; 82.6% identity (82.6% similar) in 558 nt overlap (1-558:1-558)

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>>b3146 AB074461 Ehrlichia sp. IS58                       (558 nt)
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>>b5086 AB074461 Candidatus Neoehrlichia mikurensis IS58  (558 nt)
 initn: 1882 init1: 1882 opt: 1894  Z-score: 92.0  bits: 26.9 E():   48
banded Smith-Waterman score: 1894; 82.2% identity (82.2% similar) in 557 nt overlap (1-557:1-557)

10 20 30 40 50 60 b14206 TGTTCTATCTTGACTGCAAAAGTTATAGAAGAAGTGTCTAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCG :::::::: :: :: :: ::::: :: :::::::: :: :::::::::::::::::::: b5086 TGTTCTATTTTAACAGCTAAAGTAATTGAAGAAGTATCCAAAGCTAAAGCTGCTGGAGCA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 b14206 GATATTGTTTGTATTAAGGAAGGTGTACTTAAAGCTAAAGAAGCTGTATTAGAAGCTTTA :::::: :: :::: :: : ::: : : ::::: :: ::: ::::::::: :::: b5086 GATATTATTAGTATCAAAAATGGTATCTTAAAAGCAAAGGAATTAGTATTAGAATCTTTG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 b14206 ATGTCTATGAAGCGTGAAATACTATCTGAAGAAGAAATTGCTCAAGTTGCTACTATTTCT : ::::::::::: :: : :: ::::: ::::: :: :: :::::::: :::::: b5086 CTTTCTATGAAGCGCGATGTTTCTTCAGAAGATGAAATAGCACAGGTTGCTACAATTTCT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 b14206 GCTAATGGAGATAAGAATATAGGTAGTAAGATTGCACAATGTGTCCAAGAAGTTGGTAAA :: :::::::: :: :: :::::::: :: :::::::::::::: : :::::::::::: b5086 GCAAATGGAGACAAAAACATAGGTAGCAAAATTGCACAATGTGTAAAGGAAGTTGGTAAA 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 b14206 GATGGAGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAAGGATTTAAAGAATTGGATGTTGAAAAAACT ::::: ::::::::::::::::::::::: :::::::: ::::: :: :::::::::::: b5086 GATGGGGTTATTACAGTTGAGGAAAGTAAGGGATTTAAGGAATTAGAAGTTGAAAAAACT 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 b14206 GATGGTATGCAATTTGATCGTGGATATCTTTCTCCTTATTTTGTTACTAATTCAGAAAAA ::::: :::::::::::: : :: ::: : :::::::::::::: :: ::: :::::::: b5086 GATGGCATGCAATTTGATAGAGGTTATTTATCTCCTTATTTTGTCACCAATGCAGAAAAA 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 b14206 ATGTTAGTAGAATTTGAAAACCCTTATATTTTACTAACAGAAAAAAAACTTAATATAATA :::::: : ::::::::::: :: ::::::::: :::::::::::::: : ::::: ::: b5086 ATGTTAATTGAATTTGAAAATCCATATATTTTATTAACAGAAAAAAAATTAAATATCATA 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 b14206 CAGCCTATATTACCAATTTTAGAGAATGTAGCTAGATCAGGAAGACCTCTTTTGATTATT :: :: :::::::: :: : :: ::: :::: :::::::: ::::: :: : :::::: b5086 CAACCAATATTACCTATCCTTGAAAATATAGCAAGATCAGGTAGACCACTACTAATTATT 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 b14206 GCAGAAGATGTGGAAGGTGAAGCACTGAGCACTCTTGTCTTAAATAAGTTACGTGGTGGA :: :::::::: :::::::::::: : :: ::: : :: :::::::::: ::::::::: b5086 GCGGAAGATGTAGAAGGTGAAGCATTAAGTACTTTAGTACTAAATAAGTTGCGTGGTGGA 490 500 510 520 530 540 550 b14206 TTGCATGTTGCAGCAGTT :: :::::::: :: :: b5086 TTACATGTTGCTGCTGTC 550




558 residues in 1 query   sequences
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Function used was FASTA [version 35.03 Feb. 18, 2008]