Chaperonin ID: b9542
Chaperonin Group: I
Deposit Date: 2006-12-04
Type: ref
Type strain?: no
Genus: Phaeodactylum
Species: tricornutum
Strain: -
Lineage: root; cellular organisms; Eukaryota; stramenopiles; Bacillariophyta; Bacillariophyceae; Bacillariophycidae; Naviculales; Phaeodactylaceae; Phaeodactylum
Original ID: -
CUTC ID: -
Nucleotide Genbank Accession: NC_008588
Peptide Genbank Accession: YP_874451
Best FASTA Match: -
Date of FASTA search: -
FASTA identity %: -
Best BLASTP Match: -
Date of BLASTP search: -
BLASTP identity %: -
Source: Genbank
Notes: From complete chloroplast genome.
Full Nucleotide Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB | 		ATGGCAAAGAAAATTTTATATCAAGACAATGCTCGACGAGCCTTAGAACGTGGAATGGAA
ATAATGGTTGAAGCTGTTTCAGTTACATTAGGACCAAAAGGTCGAAATGTTGTATTAGAA
AAATCTTATGGTTCGCCTCAAATTGTTAATGATGGTGTAACAATTGCGAAAGAAATCAAA
TTATTAGATCATATAGAAAATACCGGCGTTTCATTAATCCGCCAAGCGGCTTCAAAGACT
AATGATGTCGCAGGTGACGGAACAACAACTGCAACAGTTTTAGCGTATGCGATGGTAAAA
GAAGGATTGAAAAATGTTGCAGCAGGCGCAAATCCAATTTCAATTAAATTAGGAATGGAA
AAAGCATCTCAATATTTGGTAACACAAATTAATGAATTCGCTCAACCAGTAGAGGATATT
CAATCGATTCAACAAGTTGCTTCAATTTCAGCAGGAAATGATGAAATTATTGGATCTTTA
ATTGCCGATGCATTATCAAAAGTTGGAAAAGAAGGTGTAATTTCGTTAGAAGAAGGAAAA
GGTATTGTTACAGAATTAGAAATTACTGAAGGTATGAAGCTAGAAAAAGGTTTTATTTCA
CCATATTTTATTACAAATACTGAAAAGATGGAAGTTTCCTATGATAATCCTTATATTCTA
CTAACAGATAAGCGGATTACACTAGTTCAACAAGATTTACTACCAATTTTGGAGCAAATA
ACTAAAACAAAACGCCCTCTCTTAATCATTGCTGAAGATGTTGAAAAAGAGGCATTAGCA
ACATTAATTTTAAATAAATTAAGAGGAATTATTAATGTTGTTGCAGTTCGTGCACCGGGG
TTTGGTGAACTAAGAAAGCAAATGTTGGAAGACATAGCTATTTTAACTGGTGGGACAGTT
ATTACACAGGATGCTGGCTTAAGTTTAGATAATATTCAATTAAATTTATTAGGCCAAGCT
CGACGAATTATTGTCAATAAAGATTCAACAACAATTGTTTCGGATGGACAAACATTAAAT
GAAATTAATATTAGATGCGAACAATTGCGTAAACAGGTTAATATTGCTGATACGGGTTAT
GAAAAAGAAAAATTACAGGATCGAATTGCCAAATTATCTGGTGGAATTGCTGTAATTCGT
GTGGGGGCTGTTACTGAAACTGAAATGAAGGATAAAAAATTACGTTTAGAGGATGCAATT
AATGCTACTCGAGCAGCCGTAGAAGAAGGTATCGTGCCAGGTGGTGGTGCAACCTTAACA
CATTTGTCGGAAAATTTGGTTACGTGGGCAAAAAATAATCTAAAAGAAGATGAATTAATC
GGTGCAATGATTATATCGCGGGCGATCTTAGCGCCTTTGCGGCGGATTGCGGAAAATGCT
GGTATTAATGGTCCTGTTATTATTGAAAAAGTACAGCAACAAGAATTTGAAATTGGTTAT
AATGCTGCTAAAAATACATTTGGTAATATGTATACAGAGGGAATAGTTGATCCAGCTAAA
GTTACAAGATCAGGATTACAAAATGCTACTTCAATTGCAAGTATGATTTTAACTACAGAG
TGTATTATCGTTGATGATGTTAAAAGTTCAAACGAATCTTAG
Full Peptide Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB | 		MAKKILYQDNARRALERGMEIMVEAVSVTLGPKGRNVVLEKSYGSPQIVNDGVTIAKEIK
LLDHIENTGVSLIRQAASKTNDVAGDGTTTATVLAYAMVKEGLKNVAAGANPISIKLGME
KASQYLVTQINEFAQPVEDIQSIQQVASISAGNDEIIGSLIADALSKVGKEGVISLEEGK
GIVTELEITEGMKLEKGFISPYFITNTEKMEVSYDNPYILLTDKRITLVQQDLLPILEQI
TKTKRPLLIIAEDVEKEALATLILNKLRGIINVVAVRAPGFGELRKQMLEDIAILTGGTV
ITQDAGLSLDNIQLNLLGQARRIIVNKDSTTIVSDGQTLNEINIRCEQLRKQVNIADTGY
EKEKLQDRIAKLSGGIAVIRVGAVTETEMKDKKLRLEDAINATRAAVEEGIVPGGGATLT
HLSENLVTWAKNNLKEDELIGAMIISRAILAPLRRIAENAGINGPVIIEKVQQQEFEIGY
NAAKNTFGNMYTEGIVDPAKVTRSGLQNATSIASMILTTECIIVDDVKSSNES
Nucleotide UT Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB | 		GCAACAGTTTTAGCGTATGCGATGGTAAAAGAAGGATTGAAAAATGTTGCAGCAGGCGCA
AATCCAATTTCAATTAAATTAGGAATGGAAAAAGCATCTCAATATTTGGTAACACAAATT
AATGAATTCGCTCAACCAGTAGAGGATATTCAATCGATTCAACAAGTTGCTTCAATTTCA
GCAGGAAATGATGAAATTATTGGATCTTTAATTGCCGATGCATTATCAAAAGTTGGAAAA
GAAGGTGTAATTTCGTTAGAAGAAGGAAAAGGTATTGTTACAGAATTAGAAATTACTGAA
GGTATGAAGCTAGAAAAAGGTTTTATTTCACCATATTTTATTACAAATACTGAAAAGATG
GAAGTTTCCTATGATAATCCTTATATTCTACTAACAGATAAGCGGATTACACTAGTTCAA
CAAGATTTACTACCAATTTTGGAGCAAATAACTAAAACAAAACGCCCTCTCTTAATCATT
GCTGAAGATGTTGAAAAAGAGGCATTAGCAACATTAATTTTAAATAAATTAAGAGGAATT
ATTAATGTTGTTGCAGTT
Peptide UT Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB | 		ATVLAYAMVKEGLKNVAAGANPISIKLGMEKASQYLVTQINEFAQPVEDIQSIQQVASIS
AGNDEIIGSLIADALSKVGKEGVISLEEGKGIVTELEITEGMKLEKGFISPYFITNTEKM
EVSYDNPYILLTDKRITLVQQDLLPILEQITKTKRPLLIIAEDVEKEALATLILNKLRGI
INVVAV