RECORD DETAILS

Add Record To Cart - Printer-friendly version - Close Window
Chaperonin ID: b35123
Chaperonin Group: I
Deposit Date: 2019-06-18
Type: ref
Type strain?: yes
Genus: Maribacter
Species: spongiicola
Strain: DSM 25233
Lineage: root; cellular organisms; Bacteria; FCB group; Bacteroidetes/Chlorobi group; Bacteroidetes; Flavobacteriia; Flavobacteriales; Flavobacteriaceae; Maribacter
Original ID: -
CUTC ID: -
Nucleotide Genbank Accession: NZ_SOAY01000012
Peptide Genbank Accession: WP_133688165
Best FASTA Match: -
Date of FASTA search: -
FASTA identity %: -
Best BLASTP Match: -
Date of BLASTP search: -
BLASTP identity %: -
Source: Genbank
Notes: Type strain synonyms W15M10 = NCIMB:14725.
Full Nucleotide Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB |
ATGGCAAAAGATATTAAGTTTGATATAGATGCAAGAGACGGTCTTAAAAGAGGTGTTGAT
GCATTGGCAAATGCTGTAAAAGTAACATTAGGCCCAAAGGGTAGAAATGTTATTATCAGT
AAATCATTTGGTGCACCACAAGTAACTAAAGATGGTGTTACCGTAGCAAAAGAAATTGAA
TTGGCCGACCCATTAGAAAACATGGGCGCACAAATGGTTAAGGAAGTTGCTTCTAAAACC
AATGACCTAGCTGGTGACGGTACTACTACCGCTACAGTTTTAGCACAAGCTATTGTAAAA
GAAGGTTTGAAAAACGTAGCTGCAGGCGCAAACCCAATGGATTTAAAAAGAGGTATCGAT
AAAGCTGTTGAAGCTATCGTTGCCGATTTAGCCAAACAAGCTAAAAAAGTTGGTGATTCT
TCTGAAAAAATTAAGCAAGTTGCTTCTATCTCAGCTAACAATGACGAAACTATTGGTGAT
TTAATCGCACAAGCATTCGGTAAAGTTGGTAAAGAAGGTGTTATTACTGTTGAAGAAGCT
AAAGGAACAGATACGTATGTTGATGTTGTTGAAGGTATGCAGTTCGACAGAGGTTACCTT
TCTCCTTATTTCGTAACCGATTCTGAAAAGATGGTTTCTGAATTAGAGAGTCCTTATATC
TTGTTGTTCGACAAGAAAATTTCTTCAATGAAAGATCTACTTCCTGTATTAGAGCCAGTT
GCTCAATCAGGTAAGCCTTTATTGATTATCGCTGAAGATGTTGATGGTGAAGCATTAGCT
ACATTGGTTGTAAACAAATTAAGAGGTTCTTTAAAAATTGCTGCCGTTAAAGCTCCAGGT
TTTGGTGACCGTAGAAAAGCAATGTTAGAAGATATCGCAATCTTAACTGGTGGTACCGTT
ATTTCTGAAGAAAGAGGTTTTTCTTTAGATAATACTACTTTAGATATGTTAGGTACTTGT
GAAAAAGTACAGATAGACAAAGACAATACAACTATAGTTAACGGTGGTGGTGTTGCAAAA
GATATCAAAACTAGAGTTAACCAGATAAAATCTCAAATCGAGACAACTACATCTGATTAC
GATAAAGAAAAACTTCAAGAACGTTTAGCTAAATTAGCGGGTGGTGTTGCCGTACTTTAT
GTAGGTGCAGCTTCTGAAGTTGAAATGAAAGAGAAAAAAGACCGTGTTGACGATGCATTA
CACGCTACAAGAGCTGCCGTTGAAGAAGGTATTGTTGCTGGTGGTGGTGTTGCATTGGTG
AGAGCTAAATCTGTTCTTAGCAAGGTTTCTACTGAAAATGAAGATGAAGCTACAGGTTTA
CAAATTGTTGCCCGTGCTATCGAAGCTCCTTTAAGAACTATCGTTTCTAACGCTGGTGGT
GAAGGTTCTGTTGTTATCGCTAAAATACTTGAAGGTAAAGGTGATTTTGGATACGATGCT
AAATCTGAAAAGTATGTTGAAATGATGAAAGCTGGTATTATCGACCCTAAGAAAGTTACT
AGAGTGGCATTGGAAAATGCAGCTTCTGTTGCTGGTATGATCCTTACTACCGAATGTGCT
TTAACTGATATTAAAGAAGATGCTCCTGCTATGCCTCCTATGGGTGGTGGCGGAATGCCA
GGCATGATGTAA
Full Peptide Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB |
MAKDIKFDIDARDGLKRGVDALANAVKVTLGPKGRNVIISKSFGAPQVTKDGVTVAKEIE
LADPLENMGAQMVKEVASKTNDLAGDGTTTATVLAQAIVKEGLKNVAAGANPMDLKRGID
KAVEAIVADLAKQAKKVGDSSEKIKQVASISANNDETIGDLIAQAFGKVGKEGVITVEEA
KGTDTYVDVVEGMQFDRGYLSPYFVTDSEKMVSELESPYILLFDKKISSMKDLLPVLEPV
AQSGKPLLIIAEDVDGEALATLVVNKLRGSLKIAAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTV
ISEERGFSLDNTTLDMLGTCEKVQIDKDNTTIVNGGGVAKDIKTRVNQIKSQIETTTSDY
DKEKLQERLAKLAGGVAVLYVGAASEVEMKEKKDRVDDALHATRAAVEEGIVAGGGVALV
RAKSVLSKVSTENEDEATGLQIVARAIEAPLRTIVSNAGGEGSVVIAKILEGKGDFGYDA
KSEKYVEMMKAGIIDPKKVTRVALENAASVAGMILTTECALTDIKEDAPAMPPMGGGGMP
GMM
Nucleotide UT Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB |
GCTACAGTTTTAGCACAAGCTATTGTAAAAGAAGGTTTGAAAAACGTAGCTGCAGGCGCA
AACCCAATGGATTTAAAAAGAGGTATCGATAAAGCTGTTGAAGCTATCGTTGCCGATTTA
GCCAAACAAGCTAAAAAAGTTGGTGATTCTTCTGAAAAAATTAAGCAAGTTGCTTCTATC
TCAGCTAACAATGACGAAACTATTGGTGATTTAATCGCACAAGCATTCGGTAAAGTTGGT
AAAGAAGGTGTTATTACTGTTGAAGAAGCTAAAGGAACAGATACGTATGTTGATGTTGTT
GAAGGTATGCAGTTCGACAGAGGTTACCTTTCTCCTTATTTCGTAACCGATTCTGAAAAG
ATGGTTTCTGAATTAGAGAGTCCTTATATCTTGTTGTTCGACAAGAAAATTTCTTCAATG
AAAGATCTACTTCCTGTATTAGAGCCAGTTGCTCAATCAGGTAAGCCTTTATTGATTATC
GCTGAAGATGTTGATGGTGAAGCATTAGCTACATTGGTTGTAAACAAATTAAGAGGTTCT
TTAAAAATTGCTGCCGTT
Peptide UT Sequence:
BLAST this sequence:
cpnDB |
ATVLAQAIVKEGLKNVAAGANPMDLKRGIDKAVEAIVADLAKQAKKVGDSSEKIKQVASI
SANNDETIGDLIAQAFGKVGKEGVITVEEAKGTDTYVDVVEGMQFDRGYLSPYFVTDSEK
MVSELESPYILLFDKKISSMKDLLPVLEPVAQSGKPLLIIAEDVDGEALATLVVNKLRGS
LKIAAV